
生物多样性 ›› 2025, Vol. 33 ›› Issue (2): 24434. DOI: 10.17520/biods.2024434 cstr: 32101.14.biods.2024434
林珍1(
), 向家宝1(
), 蔡何佳奕1(
), 高贝1(
), 杨金涛1(
), 李俊毅1(
), 周青松2(
), 黄晓磊1,*(
)(
), 邓鋆1,*(
)(
)
收稿日期:2024-10-01
接受日期:2024-12-10
出版日期:2025-02-20
发布日期:2025-03-14
通讯作者:
*E-mail: huangxl@fafu.edu.cn;
tiancai1282008@126.com
基金资助:
Lin Zhen1(
), Xiang Jiabao1(
), Cai Hejiayi1(
), Gao Bei1(
), Yang Jintao1(
), Li Junyi1(
), Zhou Qingsong2(
), Huang Xiaolei1,*(
)(
), Deng Jun1,*(
)(
)
Received:2024-10-01
Accepted:2024-12-10
Online:2025-02-20
Published:2025-03-14
Contact:
*E-mail: huangxl@fafu.edu.cn;
tiancai1282008@126.com
Supported by:摘要:
昆虫是地球上物种多样性最高的类群, 对特定昆虫类群的线粒体基因组研究还处于不断发展和积累的阶段。由于部分半翅目昆虫的线粒体基因组在GenBank数据库中缺失, 阻碍了线粒体基因组在半翅目昆虫中的进一步应用。本研究报道了Maevius indecorus、Limnogonus cereiventris、尖长蝽(Oxycarenus laetus)、Hormaphis cornu、Melanaphis donacis、香蕉交脉蚜(Pentalonia nigronervosa)、石榴囊毡蚧(Acanthococcus lagerstroemiae)等7种半翅目昆虫的线粒体基因组详尽信息, 其中Maevius indecorus和Pentalonia nigronervosa线粒体基因组数据分别为锚蝽科和交脉蚜属(Pentalonia)首次报道。7种半翅目昆虫数据通过SRA数据库获得, 来源于6个国家(澳大利亚、喀麦隆、中国、印度、肯尼亚、美国)的7个地区。本研究可为半翅目昆虫系统发育关系、生物多样性、种群分化格局等相关研究提供一定数据支持。
数据库(集)基本信息简介
| 数据库(集)名称 | 七种半翅目昆虫线粒体基因组数据 |
|---|---|
| 作者 | 林珍, 向家宝, 蔡何佳奕, 高贝, 杨金涛, 李俊毅, 周青松, 黄晓磊, 邓鋆 |
| 通讯作者 | 黄晓磊(huangxl@fafu.edu.cn); 邓鋆(tiancai1282008@126.com) |
| 时间范围 | 2019-2024年 |
| 地理区域 | 澳大利亚、喀麦隆、中国、印度、肯尼亚、美国 |
| 文件大小 | 1.8 MB |
| 数据格式 | *.fasta, *.xlsx, *.png |
| 数据链接 | https://doi.org/10.57760/sciencedb.21938 https://www.biodiversity-science.net/fileup/1005-0094/DATA/2024434.zip |
| 数据库(集)组成 | 数据集共由15个文件组成, 包含: 7个序列数据文件, 文件大小108 KB; 1个excel数据文件, 文件大小75 KB; 7个图片数据文件, 文件大小1.62 MB。 |
林珍, 向家宝, 蔡何佳奕, 高贝, 杨金涛, 李俊毅, 周青松, 黄晓磊, 邓鋆 (2025) 七种半翅目昆虫线粒体基因组数据. 生物多样性, 33, 24434. DOI: 10.17520/biods.2024434.
Lin Zhen, Xiang Jiabao, Cai Hejiayi, Gao Bei, Yang Jintao, Li Junyi, Zhou Qingsong, Huang Xiaolei, Deng Jun (2025) Mitochondrial genomic data for seven Hemipteran species. Biodiversity Science, 33, 24434. DOI: 10.17520/biods.2024434.
| 物种 Species | 科 Family | 属 Genus | SRA检索号 SRA accession number | GenBank登录号 GenBank accession number | 采集地点 Collection locality | 序列长度 Sequence length (bp) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Maevius indecorus | 锚蝽科 Hyocephalidae | Maevius | SRR6413622 | PQ191211 | 澳大利亚昆士兰 Queensland, Australia | 17,047 |
| Limnogonus cereiventris | 水黾科 Gerridae | 泽背黾蝽属 Limnogonus | SRR9110347 | PQ389959 | 喀麦隆布埃亚 Buea, Cameroon | 15,474 |
| 尖长蝽 Oxycarenus laetus | 尖长蝽科 Oxycarenidae | 尖长蝽属 Oxycarenus | SRR11024516 | PQ191210 | 印度珀丁达 Bhatinda, India | 15,921 |
| Hormaphis cornu | 蚜科 Aphididae | 扁蚜属 Hormaphis | SRR11363133 | PQ336989 | 美国新泽西州 New Jersey, USA | 16,198 |
| Melanaphis donacis | 蚜科 Aphididae | 色蚜属 Melanaphis | SRR26205096 | PQ323560 | 美国加利福尼亚州 California, USA | 17,116 |
| 香蕉交脉蚜 Pentalonia nigronervosa | 蚜科 Aphididae | 交脉蚜属 Pentalonia | SRR11607999 | PQ327933 | 肯尼亚内罗毕 Nairobi, Kenya | 15,115 |
| 石榴囊毡蚧 Acanthococcus lagerstroemiae* | 毡蚧科 Eriococcidae | 毡蚧属 Acanthococcus | SRR18768944 | PQ390451 | 中国石家庄 Shijiazhuang, China | 14,219 |
表1 本研究中7种半翅目昆虫的相关信息
Table 1 The sample information on seven species of Hemiptera in this study
| 物种 Species | 科 Family | 属 Genus | SRA检索号 SRA accession number | GenBank登录号 GenBank accession number | 采集地点 Collection locality | 序列长度 Sequence length (bp) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Maevius indecorus | 锚蝽科 Hyocephalidae | Maevius | SRR6413622 | PQ191211 | 澳大利亚昆士兰 Queensland, Australia | 17,047 |
| Limnogonus cereiventris | 水黾科 Gerridae | 泽背黾蝽属 Limnogonus | SRR9110347 | PQ389959 | 喀麦隆布埃亚 Buea, Cameroon | 15,474 |
| 尖长蝽 Oxycarenus laetus | 尖长蝽科 Oxycarenidae | 尖长蝽属 Oxycarenus | SRR11024516 | PQ191210 | 印度珀丁达 Bhatinda, India | 15,921 |
| Hormaphis cornu | 蚜科 Aphididae | 扁蚜属 Hormaphis | SRR11363133 | PQ336989 | 美国新泽西州 New Jersey, USA | 16,198 |
| Melanaphis donacis | 蚜科 Aphididae | 色蚜属 Melanaphis | SRR26205096 | PQ323560 | 美国加利福尼亚州 California, USA | 17,116 |
| 香蕉交脉蚜 Pentalonia nigronervosa | 蚜科 Aphididae | 交脉蚜属 Pentalonia | SRR11607999 | PQ327933 | 肯尼亚内罗毕 Nairobi, Kenya | 15,115 |
| 石榴囊毡蚧 Acanthococcus lagerstroemiae* | 毡蚧科 Eriococcidae | 毡蚧属 Acanthococcus | SRR18768944 | PQ390451 | 中国石家庄 Shijiazhuang, China | 14,219 |
图1 Maevius indecorus、Limnogonus cereiventris、尖长蝽、Hormaphis cornu、Melanaphis donacis和香蕉交脉蚜的完整线粒体基因组结构图。标注在外圈的基因表示被编码在正义链(J链), 标注在内圈的基因表示被编码在负义链(N链)。tRNA基因用对应氨基酸的缩写来表示。一个未完整的线粒体基因组未画图。
Fig. 1 Mitogenome circular maps of the Maevius indecorus, Limnogonus cereiventris, Oxycarenus laetus, Hormaphis cornu, Melanaphis donacis, and Pentalonia nigronervosa. The genes that are labeled on the outside circle indicate that coding sequences are on the major (J) strand, while others are on the minor (N) strand. The tRNA genes are labeled with the amino acid abbreviations. The incomplete mitochondrial genome has not been mapped.
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