旦增尼玛1#,孙伟2#,李聪2,张纾意2,赵竹楠2,许永强1,普布卓玛1,罗诗琦2,达娃1*,周欣2*
收稿日期:
2025-07-14
修回日期:
2025-08-07
通讯作者:
达娃, 周欣
Tenzin Nyima1#, Wei Sun2#, Cong Li2, Shuyi Zhang2, Zhunan Zhao2, Yongqiang Xu1, Zhuoma Pubu1, Shiqi Luo2, Wa Da1*, Xin Zhou2*
Received:
2025-07-14
Revised:
2025-08-07
Contact:
Wa Da, Xin Zhou
摘要: 西藏吉隆沟生物多样性丰富,其中以传粉昆虫为主要媒介的传粉网络在维护生态系统的稳定性中发挥了重要作用。为了更高效的对当地传粉网络的组成和变化、以及关键传粉昆虫的食性组成等开展监测研究,本研究拟构建西藏吉隆沟的开花植物叶绿体数据库以用于花粉植物种类的分子鉴定。首先,我们基于中国数字植物标本馆数据,整理了吉隆镇6-11月份开花植物名录。通过NCBI公共数据库下载吉隆名录物种中已发表的叶绿体基因组数据,并基于高通量测序数据新组装和注释了9种植物的叶绿体基因组,其中包括3种在我国仅分布于西藏地区的植物物种,美丽唐松草、尼泊尔锦鸡儿以及耳叶象牙参(近危)。随后,我们对每种植物的64个蛋白质编码基因(Protein Coding Genes, PCGs)进行提取拼接以作为数据库参考序列。阶段性的吉隆开花植物叶绿体基因组数据库包含了419个开花植物物种。该数据库的建立将为吉隆沟传粉昆虫食物多样性组成和传粉偏好的分子鉴定提供重要的数据基础。
旦增尼玛, 孙伟, 李聪, 张纾意, 赵竹楠, 许永强, 普布卓玛, 罗诗琦, 达娃, 周欣. 西藏吉隆沟地区开花植物叶绿体基因组数据集. 生物多样性, DOI: 10.17520/biods.2025270.
Nyima Tenzin, Wei Sun, Cong Li, Shuyi Zhang, Zhunan Zhao, Yongqiang Xu, Zhuoma Pubu, Shiqi Luo, Wa Da, Xin Zhou. The Chloroplast Genome Dataset of Flowering Plants from the Jilong Valley Region in Xizang. Biodiversity Science, DOI: 10.17520/biods.2025270.
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