生物多样性 ›› 2008, Vol. 16 ›› Issue (6): 533-538.doi: 10.3724/SP.J.1003.2008.08105

• 论文 • 上一篇    下一篇

野生和养殖大鲵群体遗传多样性的微卫星分析

孟彦1, 杨焱清1, 张燕2, 肖汉兵1*   

  1. 1 (中国水产科学研究院淡水生态与健康养殖重点开放实验室, 湖北荆州 434000)
    2 (农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室, 湖北荆州 434000)
  • 出版日期:2008-11-20
  • 通讯作者: 肖汉兵

A comparison of genetic diversity between wild and cultured populations of the Chinese giant salamander, Andrias davidianus, based on microsa-tellite analyses

Yan Meng, Yanqing Yang, Yan Zhang, Hanbing Xiao*   

  1. 1 Key Laboratory of Freshwater Ecology and Healthy Aquaculture, Chinese Academy of Fishery Sciences, Jingzhou,
    Hubei 434000
    2 Key Laboratory of Freshwater Biodiversity Conservation and Utilization, Ministry of Agriculture, Yangtze River Fish-eries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Jingzhou, Hubei 434000
  • Online:2008-11-20
  • Contact: Hanbing Xiao

中国大鲵是世界上最大的两栖动物并且为我国特有,现在该物种野生种群急剧下降, 而人工养殖种群逐渐增多。为了对大鲵(Andrias davidianus)群体进行遗传多样性的本底调查, 本文用10对微卫星引物对28尾野生大鲵和16尾人工养殖的大鲵样本进行了遗传多样性分析。结果表明, 在10对引物中有7对检测到多态位点, 野生群体和养殖群体的观察等位基因数分别为5–8和4–6, 期望杂合度分别为0.81和0.75, 说明本实验中研究的大鲵的遗传多样性水平较高。通过人工养殖群体和野生群体的比较发现, 人工养殖群体存在较大的等位基因丢失现象, 并且遗传多样性水平低于野生群体。以上结果将为大鲵的人工繁育和遗传多样性的保护、利用提供一定的理论依据。

关键词: 甘蓝型油菜, 基因型, 多态性, 遗传距离, 杂交育种

The Chinese giant salamander (Andrias davidianus) is world’s largest amphibian and is endemic to China. Wild populations of the species have declined drastically, while domesticated populations have increased in recent years. To estimate genetic variation in the Chinese giant salamander, we analyzed ten microsatellite loci of 44 individuals from two wild and one domesticated populations. A total of 52 alleles were found from seven loci shown to be polymorphic. The number of alleles ranged from 6 to 9 (mean 7.4). The polymorphism information content (PIC) of all populations at all loci exceeded 0.54 except the YQY at GS134 (0.3750), suggesting high polymorphism at microsatellite markers. Compared with the wild popula-tions, some alleles in the domesticated population were drifted and the PIC was lower. Our results may pro-vide a theoretical basis for conservation and exploitation of giant salamanders in China.

Key words: Brassica napus, EST-SSR, polymorphism, genetic distance, cluster analysis

[1] 宋敏,张瑶,王丽莹,彭向永. (2019) 甘蓝型油菜ZF-HD基因家族的鉴定与系统进化分析. 植物学报, 54(6): 699-710.
[2] 莫日根高娃, 商辉, 刘保东, 康明, 严岳鸿. (2019) 一个种还是多个种? 简化基因组及其形态学证据揭示中国白桫椤植物的物种多样性分化. 生物多样性, 27(11): 1196-1204.
[3] 张俪文, 韩广轩. (2018) 植物遗传多样性与生态系统功能关系的研究进展. 植物生态学报, 42(10): 977-989.
[4] 高虎虎, 张云霄, 胡胜武, 郭媛. (2017) 甘蓝型油菜MADS-box基因家族的鉴定与系统进化分析. 植物学报, 52(6): 699-712.
[5] 刘凯歌, 齐双慧, 段绍伟, 李东, 金倡宇, 高晨浩, 刘绚霞, 陈明训. (2017) 甘蓝型油菜BnTTG1-1基因的功能分析. 植物学报, 52(6): 713-722.
[6] 杨艳, 张海琴, 凡星, 沙莉娜, 康厚扬, 王益, 周永红. (2017) 偃麦草属植物醇溶蛋白和谷蛋白多态性及系统学研究. 植物学报, 52(5): 579-589.
[7] 杨雪, 申俊芳, 赵念席, 高玉葆. (2017) 不同基因型羊草数量性状的可塑性及遗传分化. 植物生态学报, 41(3): 359-368.
[8] 张静, 李渊, 宋娜, 林龙山, 高天翔. (2016) 我国沿海棱鳀属鱼类的物种鉴定与系统发育. 生物多样性, 24(8): 888-895.
[9] 黄建峰, 李朗, 李捷. (2016) 樟属植物ITS序列多态性分析. 植物学报, 51(5): 609-619.
[10] 贾乐东, 李施蒙, 许代香, 曲存民, 李加纳, 王瑞. (2016) 甘蓝型油菜BnMYB80基因的生物信息学分析. 植物学报, 51(5): 620-630.
[11] 钱贞娜, 孟千万, 任明迅. (2016) 风筝果镜像花的雌雄异位变化及传粉生态型的形成. 生物多样性, 24(12): 1364-1372.
[12] 程文, 夏正俊, 冯献忠, 杨素欣. (2016) 一种快速、无损大豆种子DNA提取方法的建立和应用. 植物学报, 51(1): 68-73.
[13] 范文, 徐颖, 许汀, 徐晶, 高继银, 张文驹. (2015) 香港红山茶个体内ITS多态性及物种鉴定的应用. 植物学报, 50(2): 217-226.
[14] 李春宏, 付三雄, 戚存扣. (2014) 应用基因芯片分析甘蓝型油菜柱头特异表达基因. 植物学报, 49(3): 246-253.
[15] 王纳纳, 陈颖, 应娇妍, 高勇生, 白永飞. (2014) 内蒙古草原典型植物对土壤微生物群落的影响. 植物生态学报, 38(2): 201-208.
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed