生态保护和生态建设过程对景观格局产生影响并使之发生变化，这种变化又会影响景观的生态过程。应用3S技术和景观指数分析了39年（1964-2003年）内千岛湖库区土地利用和土地覆盖格局的变化。结果显示，斑块总数和景观破碎度基本保持不变，但是各斑块类型的斑块数量、面积和优势度变化非常显著。最优势斑块类型由荒山（占陆地面积的47.44%）演变为马尾松(Pinus massoniana)林（占陆地面积的52.81%），研究区域内森林植被覆盖率增加。研究还发现景观多样性指数略微下降。景观多样性是对土地利用和覆盖类型丰富度和均匀度的概要度量，并不一定总是和景观功能呈正相关关系。上述变化归因于多项生态保护措施的实施使得自然演替得以实现。景观格局的优化使生态系统的生态功能得到提高，包括生境恢复、生物多样性增加、水土流失减少。森林植被恢复以后，马尾松林斑块的单一化趋势应在今后的生物多样性保护、生态规划和可持续发展中得到重视。

以峨眉山的仙姑弹琴蛙（Rana daunchina）蝌蚪作为猎物，该地区潜在的入侵物种克氏原螯虾（Procambarus clarkii）为捕食者，于冬季设计实验观察仙姑弹琴蛙蝌蚪对陌生入侵捕食者的反捕行为反应。实验按照3×3×2因子设计，即：捕食者状况3个水平（食植物的克氏原螯虾、食蝌蚪的克氏原螯虾和无捕食者），蝌蚪年龄组3个水平（31-35期的2.5龄蝌蚪、26-30期的1.5龄蝌蚪和25期的0.5龄蝌蚪），以及蝌蚪短期经验2个水平（有经验和无经验）。实验发现：有短期被捕食经验的蝌蚪的活动时间极显著低于无被捕食经验的蝌蚪，而静止时间以及隐蔽所利用时间却极显著地高于无经验的蝌蚪；短期经验和捕食者状况的交互效应对蝌蚪的活动时间有显著影响；而蝌蚪年龄、捕食者状况及其交互效应对蝌蚪的行为反应没有显著影响。这表明，有短期被捕食经历的仙姑弹琴蛙蝌蚪并未通过个体学习建立起对陌生捕食者克氏原螯虾的识别能力，而是表现出无针对性的活动性受抑、隐蔽时间增加的行为反应。如果自然条件下的仙姑弹琴蛙蝌蚪也有类似反应，在克氏原螯虾入侵初期，仙姑弹琴蛙蝌蚪则可能会由于无法识别新的捕食者而表现出过度的反捕行为反应，承受更大的亚致死作用，而对种群生存造成不利影响。

2002年10月至2003年12月，在可可西里对藏原羚（Procapra picticaudata）的集群行为进行了初步研究。将其集群划分为雌性群、雄性群、母仔群、雌雄混群和独羚5种类型。共统计藏原羚924群次，计3643只次。其中，雌性群525群次，占56.8%，为最多的集群类型；其余为独羚（26.1%）、雄性群（11.0%）、母仔群（3.0%）和雌雄混群（3.0%）。不同大小集群的比例亦有极显著差异，其中2-10只的集群占70.0%，独羚占26.1%，其余为3.9%；最大集群为17只。另外，选择2-8只的集群的个体数占72.9%，选择8只以上集群的个体数为20.5%，独羚仅占6.6%，选择不同大小集群的个体数的差异也极为显著（P<0.001）。除独羚外，其余4种集群类型的集群大小存在极显著差异。独羚作为一种特殊的集群类型，其雄性个体的比例占到68.1%，这说明雄性个体比雌性更容易形成独羚。总体而言，藏原羚的集群以雌性群为主，最适集群大小为2-8只。

在中国科学院鹤山丘陵综合开放试验站观察研究了鸟类和蚂蚁对桃金娘 (Rhodomyrtus tomentosa) 种子的传播。据野外观察和网捕法所捕鸟的情况可知：红耳鹎 (Pycnonotus jocosus) 和白头鹎 (P. sinensis) 两种鸟传播桃金娘种子，白头鹎比红耳鹎的数量多。在网捕到的红耳鹎和白头鹎的粪便中收集到的桃金娘种子分别为8.0±3.0 粒/只和10.0 ±2.0粒/只。在显微镜下观察经过鸟消化道的桃金娘种子都没有破损。传播桃金娘种子的蚂蚁有全异巨首蚁 (Pheidologetion diversus)和梅花山大头蚁(Pheidole meihuashanensis

2002年6-9月，对内蒙古中西部草原建群植物及优势植物的丛枝菌根共生状况进行了调查。在观察的28科125种植物中，被丛枝菌根真菌侵染的植物有104种（占83.2%）；在过去认为不能侵染的莎草科植物中发现卵穗苔草（Carex duriuscula）和黄囊苔草（C. korshinskyi）有侵染现象。在所调查的植物中，多年生草本和灌木类植物被丛枝菌根真菌侵染的比例较高，占被调查该类植物总数的90.4%；而一年生和二年生草本植物被侵染的比例仅为47.6%。本地区野生植物的丛枝菌根结构类型多数为Arum类型，占65.38%，尤其在百合科（Liliaceae）、菊科（Compositae）、豆科（Leguminosae）和蔷薇科（Rosaceae）植物中比例较高；而Paris类型仅有19.23%，多见于禾本科（Gramineae）、唇形科（Labiatae）、桔梗科（Campanulaceae）和百合科。丛枝菌根的结构类型与植物的根系类型、生活型和菌根侵染率无关，而与植物所属的科属关系比较密切。

深圳市梧桐山是濒危物种紫纹兜兰(Paphiopedilum purpuratum)仅存的几个自然分布地之一。自1998年10月1日至2002年2月28日，我们在梧桐山选取了9个调查点，对407个基株进行了观察，研究了该地的气候、植被、土壤和其他环境因素与紫纹兜兰之间的关系。观察结果表明，梧桐山地区的紫纹兜兰在次生阔叶林下生长良好；短刺刺腿食蚜蝇（Ischiodon scutellaris）为其有效传粉者；大多数开花的紫纹兜兰均能结果。我们认为，紫纹兜兰生存所面临的主要威胁应该是其生境亦即森林的破坏，而不是其自身存在的生物学缺陷。

应用RAPD技术检测了多叶重楼（Paris polyphylla）2个变种4个居群的遗传多样性，并与1个凌云重楼（P. cronquistii）居群进行了比较。选择的16个随机引物在5个居群中共检测到246个多态位点。在居群水平上，滇重楼2个居群的多态位点百分比(PPB)分别为57.43%和54.67%，Shannon指数分别为0.3080和0.2830；七叶一枝花2个居群的PPB分别为56.33%和57.75%，Shannon指数分别为0.3080和0.3293。在变种水平上，滇重楼的PPB为75.14%，Shannon指数为0.3922，遗传分化系数（G_st）为0.3085；七叶一枝花的PPB为80.31%，Shannon指数为0.3992，遗传分化系数（G_st）为0.3726；在种的水平PPB达92.05%，遗传分化系数G_st达0.5151。聚类分析显示滇重楼和七叶一枝花有较近的亲缘关系，而与凌云重楼遗传距离较远。此结果从分子水平上支持了过去将滇重楼和七叶一枝花划分为1个种下2个变种的形态分类观点。

1999-2003年在云南对白尾梢虹雉(Lophophorus sclateri)的分布及栖息生境进行了调查，确证11个分布点，另有3个点可能有分布。白尾梢虹雉在云南的栖息生境主要有高山草甸、高山亚高山箭竹林及亚高山针叶林3种类型。栖息生境承载量小、种群增长慢、人类活动干扰以及宣传不力是白尾梢虹雉濒危的主要因素，据此提出开展驯养繁殖、加强禁止偷猎的法制宣传，以及加强基础研究的保护建议。

微卫星DNA广泛分布于真核生物基因组中，具有多态性高、共显性遗传、选择中性、易于操作等特点，是一种极具应用价值的分子遗传标记，近年来在濒危动物保护遗传学研究中得到越来越多的应用。微卫星DNA高度多态性提供的高分辨率遗传信息，使其不仅适合个体水平的亲子鉴定与交配系统研究，而且也已成为种群遗传结构与多样性分析的有效分子标记。微卫星分析所需的DNA量极少，用非损伤性方法获取的极少量样品或陈旧样品就能用于有效分析，方便了濒危动物野外调查工作的开展，并且可以利用年代久远的馆藏历史标本揭示种群的重要历史进程。另外，某些微卫星DNA大小在近缘物种间可相互区分，这使得部分物种的DNA分子鉴别将更为简便。但微卫星分子标记的座位筛选和特异引物开发耗时费力，一定程度上限制了其广泛应用。针对不同的研究目的选择合适的分子标记方法将有助于更好的揭示问题本质。

濒危等级是确定物种优先保护顺序和制订濒危物种保育策略的重要依据，《生物多样性公约》、相关国际组织和一些国家都把物种濒危状态的评价作为生物多样性保护工作中的一个重要步骤。本文对IUCN和美国、加拿大等国在物种濒危状态评价中有关等级标准、评价程序、数据信息采集管理及网络应用方面的问题进行了分析。国际上物种濒危状态评价工作呈现出以下几个方面的发展趋势：(1)物种濒危等级评价标准由定性指标向定量指标发展；(2)物种濒危状况评价程序逐步规范严格，评价过程透明，公众积极参与；(3)数据信息的采集逐步标准化，储存与管理更新采用计算机及网络技术；(4)物种濒危等级的公布与更新逐步以网络形式为主；(5)全球对物种濒危状态评价工作日益重视，物种濒危等级信息在物种资源利用、保护及其他方面的应用愈加广泛。在此基础上，作者提出了我国在物种濒危状况评价中急需加强的3个方面的工作：(1)建立我国的物种濒危等级评价标准；(2)建立完善的物种濒危等级评价程序并制定相关的指导性文件；(3)加强濒危物种评价中数据信息的规范采集、网络管理和数据共享。

针对目前国内生物多样性相关软件缺乏的情况，利用可视化开发方法和地理信息系统组件包Shape Viewer Objects开发了一个综合性的生物多样性评价软件BiodiversityMapping。该软件运行于Windows98/NT操作系统下，是一个32位Windows应用软件；可以计算8类37种α、β生物多样性测度并能利用地理信息系统技术将结果空间化表达。利用该软件计算了北京东灵山地区3个研究区域（小龙门、梨园岭和东灵山主峰）内11个生境中大步甲属（Carabus）昆虫的Shannon-Wiener多样性指数并制图，然后对这3个地区进行了右尾和排序。结果表明，BiodiversityMapping软件能够准确方便地计算多种生物多样性测度，是生物多样性评价的一个有力工具。

自然保护区作为地球上生态保育的基石，其管理的有效性和可持续性一直是备受关注的热点问题之一。自然保护区管理涉及自然环境和社会经济两大系统，具有复杂性特征。为解析这种复杂性，可以把自然保护区管理看成是博弈问题，将博弈论作为有力工具来解决自然保护区管理中的各种矛盾冲突，协调各种利益关系，以促进自然保护区管理的科学性、有效性和可持续性。一般地，自然保护区可以描述为n人博弈，能够通过Nash均衡和n人合作博弈的Shapley值以及核仁（Nucleolus）等方法求解。作者用博弈论思想分析了自然保护区管理中天然林保护、以电代柴和适度开发等典型案例，总结了自然保护区管理博弈分析的一般步骤。认为必须通过政策、体制和机制创新，促进自然保护区管理中各利益主体的广泛参与和密切合作，才能实现自然保护区管理中公平与效率、高效与持续的统一。

本文以生物多样性研究发展现状的分析为基础，为生物多样性保护政策的制定提供可靠的数据支持为目标，通过对国内外几个著名的生物多样性数据库建设情况的分析，从相关学者的需求出发，提出了设计一个多层次多角度并带有一定人工智能的生物多样性集成数据库的构想。该系统基于都柏林核心（Dublin Core）的数据规范，并符合基于开放文献预研的元数据互操作协议（The Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting, OAI-PMH）的标准，是一个集文字、图件、图片、声音、影像为一体的，能够在网上和硬件载体（如光盘）上同时进行发布的分布式数据库平台。其网上数据库系统的子系统之间以及子系统和硬件载体之间可以通过元数据获取的开放档案倡议协议互相交换数据。