世界菌物新命名发表概况(2021年)
Annual review on nomenclature novelties of fungi in the world (2021)
通讯作者: *E-mail:cail@im.ac.cn
编委: 杨祝良
责任编辑: 李会丽
收稿日期: 2022-05-20 接受日期: 2022-06-1
基金资助: |
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Corresponding authors: *E-mail:cail@im.ac.cn
Received: 2022-05-20 Accepted: 2022-06-1
21世纪以来, 菌物新物种的发现速度逐渐加快。每个新发表的菌物新名称都蕴含着大量的分类学和多样性信息, 通过对这些信息进行统计和分析, 可以揭示菌物分类学的发展趋势和存在的问题。2021年全球共发表了3,734个菌物新名称, 包括288个新高阶分类单元(1个新门、2个新纲及新亚纲、16个新目及新亚目、36个新科、233个新属及次级属下单元)、2,551个新种及种下单元、782个新组合、113个其他新名称。这些新名称隶属于3界13门40纲159目425科1,165属, 伞菌和小型子囊菌是本年度最受关注的类群。全球有2,060位学者参与了菌物新名称的研究与发表工作, 为历史上命名作者数量最多的一年。中国学者在本年度的菌物新命名工作中做出了突出贡献, 约30%的新名称(1,124个)由中国学者参与发表。来自中国的命名作者共有380位, 是我国命名作者数量最多的一年。本年度发现的2,533个菌物新物种来自于世界7个大洲的101个国家和地区, 新物种丰富度最多的地区是亚洲东部和南部, 而中国发现了756个菌物新物种, 是发现新物种最多的国家, 占全球的近30%。我国南方地区的新物种数量远多于北方地区, 发现新物种最多的省份是云南省, 共发现248种, 占全国的33%。总体来看, 全球菌物新物种发现的速度与近年持平, 处于波动上升的趋势, 而中国的菌物分类学发展速度和贡献度仍在快速提升。建议未来的分类学研究工作中, 继续扩大研究地域和类群, 将新物种发现与完善高阶分类系统并重, 逐步揭示全球菌物多样性本底。
关键词:
Aim: Since the 21st century, taxonomists have accelerated the discovery of new fungal species. The summary and analysis of the yearly new published names of fungi can reveal the research trend and existing problems for future development of mycology.
Method: The taxonomic data of newly published fungal names were retrieved and analyzed from the three recognized fungal name repositories of Fungal Names, Index Fungorum and MycoBank.
Results: In 2021, a total of 3,734 new fungal names were published all over the world, including 288 new higher taxa (i.e., 1 new phylum, 2 new classes and subclasses, 16 new orders and suborders, 36 new families, 233 new genera and subgenera), 2,551 new species and intraspecific taxa, 782 new combinations, 113 other new names. These new names belonged to 3 kingdoms, 13 phyla, 40 classes, 159 orders, 425 families and 1,165 genera, among which ascomycetes and agaricomycetes have received more attentions. There were 2,060 scholars worldwide participated in the new name publishing this year, reaching the historically highest annual number of authors. The newly published 2533 new fungal species were discovered from 101 countries and regions in the world. East and South Asia were the hottest spots of new species discovery, while China was the country with the highest number of new species discoveries (756 species), accounting for nearly 30% of the world’s total. Besides, Chinese scholars has made the most contributions in the word. Almost 380 Chinese scholars participated in the publications of 1,124 new fungal names in 2021, contributing about 30% of the world’s total.
Conclusion: Although the number of newly published fungal names declined from last year, but it still kept the increasing trends compared to the average number of last few years. The most concerned groups by researchers and localities of new species were similar with last year. A suggestion for the future taxonomic research of fungi is to continue to expand the research groups and field survey area.
Keywords:
本文引用格式
王科, 蔡磊 (2022)
Ke Wang, Lei Cai (2022)
菌物是真核生物的重要组成部分, 其形态各异、分布极为广泛, 科学界对其生物多样性的规模尚未形成统一意见。根据不同的估算方法, 全球菌物多样性可能有数百万、甚至千万种以上(Hawksworth & Lücking, 2017; Wu et al, 2019; Baldrian et al, 2022)。目前, 世界已发现和描述的菌物仅有15万种(生物物种名录,
在信息时代, 生物数据库成为了记录生物多样性和海量菌物名称信息的重要工具。2011年在墨尔本举办的第18届国际植物学大会上通过了《国际藻类、菌物和植物命名法规(墨尔本法规)》(McNeill et al, 2012), 在菌物领域首先引入了名称注册机制, 即每一个拟发表的菌物新命名须在规定的菌物名称信息库进行登记注册(Kirk et al, 2011)。而Fungal Names (
本研究根据上述3个菌物名称信息库的记录, 梳理和统计了2021年度世界及中国发表的菌物新命名, 分析了菌物新名称发表的总体情况、命名作者、研究类群、出版物、新物种产地、新物种来源基质等信息, 以期展示该年度菌物分类学热点, 为未来的相关研究提供依据, 也为各国家/地区菌物名录的制定和完善以及物种保护提供参考。
1 数据来源
本研究的数据来自于Fungal Names、Index Fungorum和MycoBank 3个世界菌物名称信息库, 数据获取时间截止到2022年4月13日。以名称发表年份为检索条件, 筛选获得2021年发表的菌物名称记录3,734条, 每条数据包含菌物名称、命名作者、分类阶元、发表年份、发表期刊、模式标本产地、命名法评价等信息。
2 2021年世界菌物新名称发表概况
2.1 总体概述
2021年, 全球学者共发表了3,734个菌物新名称(名录见附录1), 包括1个新门、1个新纲、1个新亚纲、13个新目、3个新亚目、36个新科、195个新属、16个新亚属、22个新组、2,533个新种、4个新亚种、6个新变种和8个新变型, 共2,839个新分类单元。此外, 还有782个新组合、40个修订名称和73个其他名称(不合格或不合法名称)。本年度发表的新名称总数较2020年有所回落, 减少了约1/4, 但总体来看, 本年发表的新名称数量、新物种数量、新高阶分类单元数量与近10年(2011-2020年)发表数量的平均值基本持平, 菌物分类学科仍处于稳步发展的阶段(王科等, 2021)。
本年度发表的菌物新名称涉及到了真菌、黏菌、卵菌、网黏菌、微孢子等属于广义菌物的各个主要类群, 其中98.85%的新名称隶属于真菌界, 包括1个新门、1个新纲、1个新亚纲、12个新目、3个新亚目、36个新科、194个新属、16个新亚属、22个新组、2,496个新种、4个新亚种、6个新变种、8个新变型、780个新组合、40个修订名称和73个其他名称。在狭义真菌类群之外, 还有假菌界网黏菌门1个新属和1个新种, 卵菌门1个新目、20个新种和1个新组合; 原生动物界微孢子门3个新种, 黏菌门13个新种和1个新组合。
2.2 命名作者
2021年, 全球参与菌物新名称发表的学者有2,060位, 为历史上命名作者数量最多的一年。在本年度的命名作者中, 有599位是首次参与新名称发表。在作者的个人贡献方面, 有22位学者发表了超过50个新名称, 188位学者发表了10个及以上的新名称, 此外, 还有897位学者仅参与了单个新名称的发表工作, 占命名作者总数的43.54% (图1)。
图1
图1
2021年发表不同数量菌物新名称的学者占比
Fig. 1
Proportion of scholars who published different number of new fungal names in 2021
来自泰国皇太后大学的学者Kevin Hyde和荷兰学者Pedro Crous是本年度发表菌物新名称数量最多的两位学者, 分别参与了306个和193个新名称的发表工作。这两位学者在2020年的个人贡献也位居前列, 数十年来持续保持着高效产出, 为菌物分类学领域做出了突出贡献(表1)。
表1 2021年发表50个以上菌物新分类单元的学者
Table 1
命名作者* Author of new names* | 名称数 Total new names | 新高阶分类单元 New higher taxa | 新种及种下单元 New species and infraspecific taxa | 新组合 New combinations | 文章数 Articles |
---|---|---|---|---|---|
K. D. Hyde | 306 | 45 | 186 | 62 | 62 |
P. W. Crous | 193 | 27 | 154 | 11 | 12 |
M. Réblová | 86 | 14 | 18 | 54 | 6 |
M. Hernández-Restrepo | 83 | 15 | 22 | 46 | 5 |
P. Alvarado | 68 | 0 | 10 | 56 | 10 |
C. H. Kuo | 68 | 5 | 54 | 7 | 9 |
Zhu L. Yang | 68 | 6 | 54 | 8 | 12 |
S. Y. Kondr. | 65 | 7 | 1 | 57 | 2 |
K. Liimatainen | 64 | 12 | 51 | 0 | 12 |
L. Lőkös | 58 | 6 | 0 | 52 | 1 |
T. Niskanen | 58 | 12 | 45 | 0 | 10 |
R. G. Shivas | 57 | 0 | 56 | 1 | 13 |
Sheng H. Wu | 57 | 7 | 32 | 17 | 3 |
Á. Pintos | 55 | 0 | 1 | 52 | 1 |
Y. C. Dai | 54 | 0 | 46 | 4 | 15 |
R. Lücking | 54 | 4 | 25 | 21 | 14 |
C. C. Chen | 53 | 6 | 29 | 17 | 2 |
B. Dima | 53 | 0 | 46 | 7 | 11 |
S. K. Huang | 53 | 8 | 0 | 43 | 3 |
J. S. Hur | 53 | 9 | 31 | 45 | 2 |
D. S. Tennakoon | 52 | 5 | 42 | 4 | 3 |
H. S. Yuan | 51 | 15 | 34 | 0 | 6 |
粗体标注为中国作者。
Chinese authors are in bold.
2.3 研究类群
本年度发表的菌物新名称隶属于3界13门40纲159目425科1,165属, 覆盖了全球菌物已知科的近1/2和已知属的约1/10。本年度在划定菌物高阶分类单元方面取得了较大进展, 新构建的最高等级分类单元有1个门和1个纲。Galindo等(2021)通过基因组测序和系统发育分析, 为具有游动孢子的单细胞真菌类群建立了一个新门——Sanchytriomycota, 目前该门下有1纲1目1科和2个单种属。Čadež等(2021)从橄榄油中分离出1株酵母, 通过显微观察和DNA条形码比对, 该物种与已知物种没有密切的亲缘关系, 于是通过系统发育分析发现了1个新种Novakomyces olei、建立了1个新属Novakomyces、1个新科Novakomycetaceae、1个新目Novakomycetales和1个新纲Novakomyetes。
在研究类群方面, 本年度受关注较多的类群是伞菌(丝膜菌科、牛肝菌科和红菇科)和小型子囊菌(丛赤壳科、梨孢假壳菌科、刺球菌科) (表2), 这些类群在本年度都有重要文章或著作发表, 对分类系统进行了全面修订并发现了大量新物种。丝膜菌科中的丝膜菌属(Cortinarius)是当前真菌界中物种多样性最丰富的属, 已经连续多年受到全球研究者的关注。在2021年, 该类群的新物种发现主要集中在北美地区, 有55种, 多个研究团队在丝膜菌属下不同亚属和组中发现了丰富的物种多样性(Ammirati et al, 2021; Dima et al, 2021; Liimatainen & Niskanen, 2021)。红菇科也是伞菌中的重要类群, 包含了多种珍稀食药用真菌, 该科的新物种则多来自于东亚地区, Lee等(2021)在研究中通过对近40年在韩国采集的标本进行重新鉴定, 共发现多汁乳菇属(Lactifluus)物种24个, 其中19个为新种。丛赤壳科中的镰孢属(Fusarium)是重要的植物病原真菌, 对生态环境和粮食安全有着重要影响, 由于镰孢属的概念较为宽泛, 其末端分支的分类界限并不清晰。Crous等(2021)基于19个同源蛋白编码基因序列进行系统发育分析, 对广义镰孢属(Fusarium s.l.)的分类系统进行了全面修订, 发表了4个新属、18个新种和16个新组合, 并为丛赤壳科原有的70多个物种指定了新模式、后选模式或解释模式。藉由上述成果为镰孢属划定了更精确的概念, 并为今后该类群的研究积累了丰富的数据资料。
表2 2021年发表菌物新名称最多的10个科
Table 2
科名 Families | 新属及亚属 New genera and subgenera | 新种及种下单元 New species and infraspecific taxa | 新组合 New combinations | 总数 Total |
---|---|---|---|---|
丛赤壳科 Nectriaceae | 4 | 73 | 29 | 106 |
丝膜菌科 Cortinariaceae | 13 | 87 | 1 | 101 |
牛肝菌科 Boletaceae | 4 | 76 | 16 | 96 |
梨孢假壳菌科 Apiosporaceae | 0 | 21 | 65 | 86 |
红菇科 Russulaceae | 2 | 66 | 17 | 85 |
多孔菌科 Polyporaceae | 3 | 34 | 40 | 77 |
刺球菌科 Chaetosphaeriaceae | 13 | 15 | 45 | 73 |
蘑菇科 Agaricaceae | 3 | 56 | 8 | 67 |
蜈蚣衣科 Physciaceae | 7 | 1 | 56 | 64 |
小脆柄菇科 Psathyrellaceae | 1 | 54 | 3 | 58 |
除此之外, 本年发表的29个新属和196个新种的科级分类地位未定, 有待在今后进一步开展研究。
2.4 名称发表出版物
2021年, 全球147个期刊的933篇论文和5部专著刊载了本年度所发表的菌物新名称。专著中发表的新名称仅有88个, 占比2.36%, 其余3,646个名称发表在期刊论文中。近90%的论文和新名称发表在菌物学、微生物学、植物学或分类学期刊中。发表文章数最多的是Phytotaxa, 该期刊刊载的文章多数是发表较少数量的新物种, 本年度共发表107篇文章128个新物种。Persoonia在本年度刊载了最多的新名称和新物种, 该期刊多刊载系统性分类学研究的文章, 虽然发表的文章数量较少, 但每篇文章往往包含大量的菌物新分类单元和新名称。在本年发表的14篇文章中涉及到1个新科、20个新属、274个新种和28个新组合(图2)。
图2
图2
2021年发表100个以上菌物新名称的期刊
Fig. 2
Journals publishing more than 100 new fungal names in 2021
2.5 新物种模式产地
图3
图3
2021年菌物新物种模式标本产地所属大洲分布
Fig. 3
The numbers of new fungal species discovered from different continents in 2021
表3 2021年发现20个以上菌物新物种的国家
Table 3
国家 Country | 大洲 Continent | 新物种数 Number of new species |
---|---|---|
中国 China | 亚洲 Asia | 756 |
美国 USA | 北美洲 North America | 221 |
泰国 Thailand | 亚洲 Asia | 162 |
澳大利亚 Australia | 大洋洲 Oceania | 131 |
巴西 Brazil | 南美洲 South America | 147 |
西班牙 Spain | 欧洲 Europe | 84 |
南非 South Africa | 非洲 Africa | 66 |
印度 India | 亚洲 Asia | 61 |
荷兰 Netherlands | 欧洲 Europe | 56 |
德国 Germany | 欧洲 Europe | 52 |
韩国 South Korea | 亚洲 Asia | 50 |
法国 France | 欧洲 Europe | 47 |
俄罗斯 Russia | 欧洲 Europe | 42 |
意大利 Italy | 欧洲 Europe | 42 |
新西兰 New Zealand | 大洋洲 Oceania | 37 |
葡萄牙 Portugal | 欧洲 Europe | 29 |
日本 Japan | 亚洲 Asia | 28 |
加拿大 Canada | 北美洲 North America | 27 |
挪威 Norway | 欧洲 Europe | 25 |
巴基斯坦 Pakistan | 亚洲 Asia | 23 |
墨西哥 Mexico | 北美洲 North America | 22 |
伊朗 Iran | 亚洲 Asia | 22 |
在新物种来源国家方面, 自21世纪以来, 中国始终保持着年度发现菌物新物种最多的国家, 而在2021年度一共发现756个新物种, 占全球总数的29.85%。总体来看, 发现新物种较多的国家主要是菌物分类学基础雄厚和国土面积辽阔的国家。排名前五位的中国、美国、泰国、澳大利亚和巴西在以上两方面均有优势, 本年度发现新物种数量达100种以上。而一些欧洲国家虽然国土面积有限, 但研究实力雄厚, 也能发现几十种新物种, 如西班牙、荷兰、德国等都发现了50种以上的菌物新物种。
2.6 新物种的生长基质和宿主
在本年度发表的菌物新物种中, 注明生长基质或宿主的有2,528种, 未注明的仅有5种。生长在活体植物上的真菌种类最多, 有883种, 占新物种总数的34.86%; 其次是来自于土壤和腐木、落叶、粪便、腐殖质等腐物类基质中的, 分别有727种和561种; 此外, 还有145种(5.72%)寄生在动物及人体上、74种(2.92%)发现自真菌和其他微生物上; 剩余138种生长于岩石、水、空气等介质中(图4)。
图4
图4
2021年菌物新物种来源基质和/或寄主
Fig. 4
Substrate and/or host origins of new fungal species published in 2021
真菌属于异养生物, 其生活方式主要有腐生、寄生和共生3种。根据物种的寄主和着生基质, 可以分析得出本年发表的新物种中有寄生菌966种、腐生菌841种、共生菌665种和生活方式未知的61种。在新发表的寄生真菌物种中, 近80% (768种)寄生在活体植物的叶片、果实、枝干等部位, 多数可造成植物病害; 有145种寄生在动物或人体上, 这类真菌主要有虫草、动物病原菌、人体病原菌等; 其余53种寄生在真菌、地衣体和其他微生物上。腐生真菌新物种中, 近1/3来自于土壤, 有265种, 其余则多生长在植物残体、粪便等基物上。共生真菌根据共生生物的不同, 分为植物共生菌、动物共生菌、地衣等, 本年度新发表的共生真菌中, 近2/3 (441种)是与植物共生的菌根菌和植物内生菌, 223种是与藻类共生的地衣, 此外还有少数几种与动物共生的蚁巢伞等。
3 2021年中国菌物新名称发表概况
3.1 总体概述
2021年, 中国学者一共参与发表了1,124个菌物新名称, 仅次于2020年, 是历史上中国学者发表菌物新名称数量第二多的年份, 占本年度全球新名称总数的30.10%, 贡献比率为历史最高。这些新名称包括了新分类单元941个, 包括1个新亚目、12个新科、49个新属、15个新亚属、863个新种和1个新变种。此外还有155个新组合和28个其他新名称。上述名称中, 由中国学者独立发表的有722个(64.23%)及中外学者合作发表的402个(35.77%), 中外合作发表的比例较2020年有大幅降低, 可能是受到新冠疫情影响, 与国际间交流访问频率有所降低, 跨地域的野外采集和考察相对减少有关。
3.2 命名作者
图5
图5
2021年发表不同数量菌物新名称的中国学者占比
Fig. 5
Proportion of Chinese scholars published different number of new fungal names in 2021
3.3 研究类群
本年度中国学者的研究热点类群是木生真菌(原毛平革菌科、多孔菌科和齿菌科)和牛肝菌(牛肝菌科) (表4)。木生真菌在多个分支类群都有系统性研究发表, Chen等(2021)采用形态学和系统发育学方法, 对多孔菌目射脉菌分支(Phlebioid clade)的种属进行了修订, 并调查了物种多样性, 共发现了6个新属、26个新种和18个新组合。Liu等(2021)对多孔菌科的蓝孔菌属(Cyanosporus)开展了系统性研究, 共发现了5个新种和15个新组合。Cao等(2021)通过多基因系统发育研究, 明确了齿菌科的分类界限, 确定了17个属应归属于该科内, 并发现了8个新亚属、17个新物种和2个中国新记录种。在牛肝菌类群, Li和Yang (2021)出版了粉孢牛肝菌属(Tylopilus)相关专著, 并在其中发表了2个新属、35个新种和4个新组合。
表4 2021年中国学者发表菌物新名称单元最多的10个科
Table 4
科 Families | 新属及亚属 New genera and subgenera | 新种及种下单元 New species and infraspecific taxa | 新组合 New combinations | 总数 Total |
---|---|---|---|---|
牛肝菌科 Boletaceae | 4 | 54 | 7 | 65 |
原毛平革菌科 Phanerochaetaceae | 4 | 28 | 8 | 40 |
多孔菌科 Polyporaceae | 1 | 16 | 17 | 34 |
齿菌科 Hydnaceae | 6 | 25 | 0 | 31 |
葡萄座腔菌 Botryosphaeriaceae | 0 | 26 | 3 | 29 |
炭角菌科 Xylariaceae | 0 | 24 | 4 | 28 |
间座壳科 Diaporthaceae | 0 | 26 | 0 | 26 |
肉座菌科 Hypocreaceae | 0 | 26 | 0 | 26 |
线虫草科 Ophiocordycipitaceae | 1 | 12 | 11 | 24 |
裂孔菌科 Schizoporaceae | 0 | 22 | 0 | 22 |
3.4 名称发表的出版物
2021年, 我国学者在The Boletes of China: Tylopilus s.l. (Li & Yang, 2021)和《中国小菇科真菌图志》(图力古尔等, 2021)两部专著中发表了2个新属、44个新种和5个新组合, 其余的1,073个新名称均发表自期刊论文, 共有306篇文章刊载在54个期刊中, 文章数量占全球的32.80%, 其中发表在中文期刊的名称数远少于往年, 仅有13个新种发表在《菌物学报》和《菌物研究》的10篇文章中。中国学者在Journal of Fungi、Fungal Diversity和MycoKeys三种期刊发表的新名称最多, 分别有171个、153个和136个, 而在Phytotaxa期刊发表的文章数量最多, 有47篇。
3.5 新物种模式产地
表5 2021年中国各省级行政区发现的菌物新物种数量
Table 5
省 Province | 新物种数量 Number of new species | 省 Province | 新物种数量 Number of new species |
---|---|---|---|
云南 Yunnan | 248 | 西藏 Xizang | 9 |
台湾 Taiwan | 84 | 河南 Henan | 8 |
贵州 Guizhou | 49 | 青海 Qinghai | 8 |
海南 Hainan | 47 | 重庆 Chongqing | 7 |
湖南 Hunan | 27 | 甘肃 Gansu | 7 |
四川 Sichuan | 26 | 河北 Hebei | 5 |
广东 Guangdong | 23 | 江苏 Jiangsu | 5 |
广西 Guangxi | 23 | 山西 Shanxi | 5 |
江西 Jiangxi | 17 | 安徽 Anhui | 3 |
福建 Fujian | 16 | 黑龙江 Heilongjiang | 2 |
北京 Beijing | 16 | 陕西 Shaanxi | 2 |
吉林 Jilin | 15 | 香港 Hong Kong | 1 |
辽宁 Liaoning | 15 | 上海 Shanghai | 1 |
浙江 Zhejiang | 14 | 宁夏 Ningxia | 0 |
新疆 Xinjiang | 12 | 澳门 Macao | 0 |
湖北 Hubei | 11 | 天津 Tianjin | 0 |
内蒙古 Nei Mongol | 10 | 产地未知 Unknown | 30 |
山东 Shandong | 10 |
4 总结与展望
相比于2020年, 本年度新发表的菌物新名称数量有所降低, 但参与的学者数量仍在继续增加。综合近20年的数据, 菌物分类学仍处于波动上升的趋势。相较于动植物类群, 菌物在高阶分类单元仍有较多的变动, 而且大量的新物种、新属尚处于高阶分类单元未定的状况。除了持续发现新物种, 逐步修订和完善菌物分类系统也是亟需分类学者们需要解决的问题。
虽然本年度全球菌物新名称发表数量有一定回落, 但中国学者的贡献和成果仍在稳步增加, 参与学者数量、新物种发现数量等均达到历史最高。从新物种地理分布来看, 西南地区依旧是新物种发现的热点地区, 而东南沿海地区的关注度有所提升, 但是针对北方地区的研究工作有所减少。从类群来看, 本年中国学者的重点研究类群与2020年较为相似。期待国内外学者在未来的工作中, 拓宽研究地域、扩大研究类群, 逐步揭开中国乃至世界菌物多样性本底。
附录 Supplementary Material
附录1 世界及中国菌物新命名文献目录(2021)
Appendix 1 Bibliography of nomenclature novelties of fungi in China and the world (2021)
参考文献
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PMID:34404788
[本文引用: 1]
Compared to multicellular fungi and unicellular yeasts, unicellular fungi with free-living flagellated stages (zoospores) remain poorly known and their phylogenetic position is often unresolved. Recently, rRNA gene phylogenetic analyses of two atypical parasitic fungi with amoeboid zoospores and long kinetosomes, the sanchytrids Amoeboradix gromovi and Sanchytrium tribonematis, showed that they formed a monophyletic group without close affinity with known fungal clades. Here, we sequence single-cell genomes for both species to assess their phylogenetic position and evolution. Phylogenomic analyses using different protein datasets and a comprehensive taxon sampling result in an almost fully-resolved fungal tree, with Chytridiomycota as sister to all other fungi, and sanchytrids forming a well-supported, fast-evolving clade sister to Blastocladiomycota. Comparative genomic analyses across fungi and their allies (Holomycota) reveal an atypically reduced metabolic repertoire for sanchytrids. We infer three main independent flagellum losses from the distribution of over 60 flagellum-specific proteins across Holomycota. Based on sanchytrids' phylogenetic position and unique traits, we propose the designation of a novel phylum, Sanchytriomycota. In addition, our results indicate that most of the hyphal morphogenesis gene repertoire of multicellular fungi had already evolved in early holomycotan lineages.© 2021. The Author(s).
Fungal diversity revisited: 2.2 to 3.8 million species
Taxonomic studies of some often over-looked Diaporthomycetidae and Sordariomycetidae
DOI:10.1007/s13225-021-00488-4 URL [本文引用: 1]
Identification and characterization of leaf-inhabiting fungi from Castanea plantations in China
DOI:10.3390/jof7010064 URL [本文引用: 1]
Changes to the Code of Nomenclature in Melbourne
国际植物学墨尔本大会上命名法规的变化
Taxonomic revision of the genus Lactifluus (Russulales, Basidiomycota) of South Korea
DOI:10.1080/12298093.2021.1943812 URL [本文引用: 1]
Species diversity and molecular phylogeny of Cyanosporus (Polyporales, Basidiomycota)
DOI:10.3389/fmicb.2021.631166 URL [本文引用: 1]
Annual report of new taxa for Chinese Hemiptera and 28 other orders of Insecta in 2020
中国半翅目等29目昆虫2020年新分类单元
International Code of Nomenclature for Algae, Fungi, and Plants (Melbourne Code)
Asproinocybaceae fam. nov. (Agaricales, Agaricomycetes) for Accommodating the genera Asproinocybe and Tricholosporum, and description of Asproinocybe sinensis and Tricholosporum guangxiense sp. nov
DOI:10.3390/jof7121086 URL [本文引用: 1]
Morphology and phylogeny reveal Vamsapriyaceae fam. nov. (Xylariales, Sordariomycetes) with two novel Vamsapriya species
DOI:10.3390/jof7110891 URL [本文引用: 1]
Global new species of vascular plants published in 2020
DOI:10.17520/biods.2021156 URL [本文引用: 1]
2020年发表的全球维管植物新种
New vertebrate forms discovered in China in 2020
DOI:10.17520/biods.2021214 URL [本文引用: 1]
中国脊椎动物2020年新增物种
Overview of nomenclature novelties of fungi in the world and China (2020)
DOI:10.17520/biods.2021202
[本文引用: 3]
<p id="p00005"><strong>Aims:</strong>Fungi have the richest biodiversity on earth, second to insects. Thousands of new fungal species have been discovered and described every year recently. Timely analysis of the published data of new fungal names can show the research hotspots of fungal taxonomy in details and provide reference data for the future development of mycology.</p> <p id="p00010"><strong>Method:</strong> The taxonomic data of new published fungal name were retrieved from the database of Fungal Names, Index Fungorum and MycoBank.</p> <p id="p00015"><strong>Results:</strong> In 2020, at least 4,996 new fungal names including 652 new higher taxa, 2,905 new species and new intraspecific taxa, 1,342 new combinations, and 97 other novelties, were published by 1,978 scholars in 885 articles and 9 monographs all over the world, reaching the historically highest annual record of new fungal names. These new names belong to 12 phyla, 44 classes, 173 orders, 469 families and 1,386 genera, among which ascomycetes had received more attentions. The type specimens of new species were from 103 countries and regions in the world. East and Southeast Asia were the hot spots of new species discovery, while China was the country with the highest number of new species discovered (669 species), accounting for 23% of the world's total. Besides, China had made remarkable achievements in fungal taxonomy in 2020, with 333 Chinese scholars participating in the publications of 1,271 new fungal names, accounting for about a quarter of the total number in the world.</p> <p id="p00020"><strong>Conclusion:</strong> As shown by the analysis, the discovery of new fungal species is accelerating, with the increased number of new published names and authors. However, the description rate of fungal species is still at a low level, which leaves a long-term and arduous task for mycologists to discover undescribed fungi efficiently.</p>
世界及中国菌物新命名发表概况(2020年)
DOI:10.17520/biods.2021202
[本文引用: 3]
菌物是全球生物多样性最丰富的生物类群之一, 每年有大量新物种被描述和发现, 统计和分析菌物新名称发表数据, 可实时展示菌物分类学的研究热点, 并为学科的未来发展提供参考数据。根据世界菌物名称信息库Fungal Names、Index Fungorum和MycoBank所收录的数据, 2020年全球共发表了4,996个菌物新名称, 包括652个新高阶分类单元、2,905个新种及种下单元、1,342个新组合和97个其他名称, 是历史上发表菌物新名称数量最多的一年。这些新名称隶属于12门44纲173目469科1,386属, 盘菌、小型子囊菌、地衣和伞菌是本年度最受关注的类群。来自全球的1,978位学者将上述菌物新名称发表在133个期刊的885篇论文和9部专著中, 其中669位作者是首次参与新名称发表, 是历年来新作者最多的一年。本年度发表的菌物新物种的模式标本来自世界103个国家和地区, 东亚和东南亚是新物种发现的最热点地区, 而中国是发现新物种最多的国家, 共发现669种, 占全球的23%, 是排名第二位的泰国的2.28倍。西南地区是我国新物种发现的热点地区, 云南、贵州、西藏三省区本年度发现的新物种数量占全国的44.80%。除了新物种来源, 中国学者在本年度的菌物分类学研究中取得了令人瞩目的成果, 333位中国学者参与发表了1,271个菌物新名称, 占全球新名称总数的1/4。这些菌物新名称隶属于8门24纲87目209科440属, 发表在45个期刊的258篇研究论文和1部专著中。通过上述研究发现, 全球菌物新物种发现的速度仍在加快, 命名作者和新名称发表数量在逐步增加, 研究类群规模在逐渐扩大。但菌物物种描述率仍处于较低水平, 持续、高效地发现菌物新物种将是菌物学者的重点研究方向之一。
Towards a natural classification of Hyphodontia sensu lato and the trait evolution of basidiocarps within Hymenochaetales (Basidiomycota)
DOI:10.3390/jof7060478 URL [本文引用: 1]
Current insights into fungal species diversity and perspective on naming the environmental DNA sequences of fungi
DOI:10.1080/21501203.2019.1614106 URL [本文引用: 1]
Polypore diversity in South China
中国华南地区多孔菌多样性研究
Annual report of Chinese spider taxonomy in 2020
2020年中国蜘蛛分类年报
Contribution to rust flora in China I, tremendous diversity from natural reserves and parks
DOI:10.1007/s13225-021-00482-w URL [本文引用: 1]
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