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世界及中国菌物新命名发表概况(2020年)
生物多样性
2021, 29 (8):
1064-1072.
DOI: 10.17520/biods.2021202
菌物是全球生物多样性最丰富的生物类群之一, 每年有大量新物种被描述和发现, 统计和分析菌物新名称发表数据, 可实时展示菌物分类学的研究热点, 并为学科的未来发展提供参考数据。根据世界菌物名称信息库Fungal Names、Index Fungorum和MycoBank所收录的数据, 2020年全球共发表了4,996个菌物新名称, 包括652个新高阶分类单元、2,905个新种及种下单元、1,342个新组合和97个其他名称, 是历史上发表菌物新名称数量最多的一年。这些新名称隶属于12门44纲173目469科1,386属, 盘菌、小型子囊菌、地衣和伞菌是本年度最受关注的类群。来自全球的1,978位学者将上述菌物新名称发表在133个期刊的885篇论文和9部专著中, 其中669位作者是首次参与新名称发表, 是历年来新作者最多的一年。本年度发表的菌物新物种的模式标本来自世界103个国家和地区, 东亚和东南亚是新物种发现的最热点地区, 而中国是发现新物种最多的国家, 共发现663种, 占全球的23%, 是排名第二位的泰国的2.28倍。西南地区是我国新物种发现的热点地区, 云南、贵州、西藏三省区本年度发现的新物种数量占全国的44.80%。除了新物种来源, 中国学者在本年度的菌物分类学研究中取得了令人瞩目的成果, 333位中国学者参与发表了1,271个菌物新名称, 占全球新名称总数的1/4。这些菌物新名称隶属于8门24纲87目209科440属, 发表在45个期刊的258篇研究论文和1部专著中。通过上述研究发现, 全球菌物新物种发现的速度仍在加快, 命名作者和新名称发表数量在逐步增加, 研究类群规模在逐渐扩大。但菌物物种描述率仍处于较低水平, 持续、高效地发现菌物新物种将是菌物学者的重点研究方向之一。
表3
2020年发表20个以上菌物新物种的国家
正文中引用本图/表的段落
本年度发表的菌物新名称涵盖了真菌(true fungi)、卵菌(oomycetes)和黏菌(slime mold) 3个类群, 涉及12门44纲173目469科1,386属。研究类群覆盖了世界已知真菌类群1/10的属和2/5的科。Beimforde等(2020)建立了树脂生真菌的新纲Sareomycetes, 是本年度所发表的最高等级分类单元。对新分类单元所属科进行统计发现, 盘菌类(圆盘菌科、盘菌科)、小型子囊菌(曲霉科、亚隔孢壳科、从赤壳科)、地衣(黄枝衣科、叶上衣科)和伞菌(丝膜菌科和小脆柄菇科)是最受研究者关注的类群(表1)。在发表新分类单元最多的几个类群中, 本年度都有重要文章或著作发表, 对其分类系统进行了全面更新和修订。Baral等(2020)将其团队30年的研究成果进行总结, 在世界范围内确定了圆盘菌科有7属470个物种(包含4个新属和331个新种), 使该科的已知物种数量增加了2.4倍。Houbraken等(2020)全面更新了曲霉科中曲霉属(Aspergillus)和青霉属(Penicillium)的分类系统, 对其属下分类单元进行了重新划分, 建立了1个新科、4个新属和141个属下次级分类单元。Wächter和Melzer (2020)收集了小脆柄菇科的18,133条分子序列开展系统发育分析, 并结合形态特征, 提出了该科全新的属级分类体系, 建立了7个新属, 并对该科下74个物种做了分类修订。除此之外, 本年发表的37个新属和198个新种的科级分类地位未定, 有待在今后进一步研究。
新物种的来源国家与前几年的趋势类似, 中国仍是发现新物种最多的国家, 本年度共发现663个菌物新种, 占全球新物种总数的近1/4。此外, 本年度有6个国家发现的新种数量超过了100个, 分别是中国、泰国、澳大利亚、美国、巴西和意大利, 6国一共发现1,677个新物种, 占全球总数的58.25% (表3)。这些国家中, 中国、澳大利亚、美国和巴西的国土面积辽阔、气候和生态系统丰富多样, 泰国地处物种多样性热点地区, 而中国、美国和意大利菌物分类研究基础雄厚。
2020年度, 中国学者所发表的菌物新名称隶属于3界8门24纲87目209科440属, 科属级别的研究类群较2019年扩大了1/3, 也是历史上研究范围最广泛的一年。本年度中国学者发表的最高等级菌物分类群是3个新目, 包括了2个担子菌酵母新目Rosettozymales和Heitmaniales (Li et al, 2020), 以及1个水生丝状真菌新目Neodactylariales (Qiao et al, 2020)。对新分类单元所属的科进行统计, 小型子囊菌(亚隔孢壳科)、地衣(叶上衣科)和木生真菌(革菌科)是发表新分类单元较多的类群(表4)。中国学者通过在世界范围内收集材料, 综合形态学和系统发育分析, 对上述类群的分类系统进行了重新修订, 并发现了大量新分类单元。Hou等(2020a)收集了来自全球92个国家、多种生长基质的1,124株亚隔孢壳科菌株, 是迄今为止亚隔孢壳科研究最广泛的取样, 通过多位点系统发育分析和形态比较发现了7个新属、40个新种和21个新组合。由中外学者合作, 对叶上衣属(Strigula)地衣的分类系统进行全面梳理, 发现了1个新属、3个新种和近70个新组合(Hongsanan et al, 2020; Jiang et al, 2020)。Yuan等(2020)通过研究来自中国的标本发现了革菌科小垫革菌属(Tomentella)新物种46个。在发表新名称最多的10个科中, 有6个科中国学者贡献了超过80%的新分类单元, 其中革菌科的所有46个新分类单元均为中国学者发表(表4)。
相比全世界的菌物分类学者, 中国学者更倾向于将新名称发表在期刊论文中。本年98.51% (1,252个)的名称发表在45个期刊的258篇研究论文中, 仅有19个发表在1部专著中(Baral et al, 2020)。在期刊的选择上, 发表在中文期刊的名称数少于往年, 仅有1个新属、23个新种、4个新组合和1个其他新名称发表在《菌物学报》《菌物研究》《食用菌学报》3个期刊的16篇文章中, 占期刊发表名称数的2.32%和文章数的6.20%。与世界菌物学者的偏好相同, 中国学者在Fungal Diversity和Studies in Mycology两种期刊发表的新名称最多(分别为344和304个), 在Phytotaxa期刊发表的文章数量最多(47篇)。
本年度所发表的菌物新物种中, 模式产地来自中国的有669种, 这一数量超过了亚洲其他国家的总和以及欧洲、美洲、大洋洲等单个大洲所发现新物种的数量, 占全球的23.03%, 是排名第二位泰国的2.28倍(图4, 表3)。这些模式产自中国的新物种中, 73.54% (492种)由中国学者发表, 115种由中外学者合作发表, 剩余62种由外国学者发表。
21世纪以来, 全球菌物分类研究快速发展, 从年均发表不到3,000个新名称逐步增长至4,000个, 并在2020年达到历史最高, 即将迈入年均5,000个的时代。同时, 随着新技术的发展和研究的深入, 所估计的全球菌物多样性规模也在逐渐增加。可以预见, 在未来几十年内, 菌物物种的描述率仍会持续处于缓慢增长且维持较低的状态。来自全球的菌物学家需要继续保持并加快菌物新物种描述速度, 逐步提升人类对于菌物多样性的认知。
本文的其它图/表
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