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世界及中国菌物新命名发表概况(2020年)
生物多样性
2021, 29 (8):
1064-1072.
DOI: 10.17520/biods.2021202
菌物是全球生物多样性最丰富的生物类群之一, 每年有大量新物种被描述和发现, 统计和分析菌物新名称发表数据, 可实时展示菌物分类学的研究热点, 并为学科的未来发展提供参考数据。根据世界菌物名称信息库Fungal Names、Index Fungorum和MycoBank所收录的数据, 2020年全球共发表了4,996个菌物新名称, 包括652个新高阶分类单元、2,905个新种及种下单元、1,342个新组合和97个其他名称, 是历史上发表菌物新名称数量最多的一年。这些新名称隶属于12门44纲173目469科1,386属, 盘菌、小型子囊菌、地衣和伞菌是本年度最受关注的类群。来自全球的1,978位学者将上述菌物新名称发表在133个期刊的885篇论文和9部专著中, 其中669位作者是首次参与新名称发表, 是历年来新作者最多的一年。本年度发表的菌物新物种的模式标本来自世界103个国家和地区, 东亚和东南亚是新物种发现的最热点地区, 而中国是发现新物种最多的国家, 共发现663种, 占全球的23%, 是排名第二位的泰国的2.28倍。西南地区是我国新物种发现的热点地区, 云南、贵州、西藏三省区本年度发现的新物种数量占全国的44.80%。除了新物种来源, 中国学者在本年度的菌物分类学研究中取得了令人瞩目的成果, 333位中国学者参与发表了1,271个菌物新名称, 占全球新名称总数的1/4。这些菌物新名称隶属于8门24纲87目209科440属, 发表在45个期刊的258篇研究论文和1部专著中。通过上述研究发现, 全球菌物新物种发现的速度仍在加快, 命名作者和新名称发表数量在逐步增加, 研究类群规模在逐渐扩大。但菌物物种描述率仍处于较低水平, 持续、高效地发现菌物新物种将是菌物学者的重点研究方向之一。
表1
2020年发表新分类单元最多的15个科
正文中引用本图/表的段落
菌物是全球生物多样性最丰富的生物类群之一, 每年有大量新物种被描述和发现, 统计和分析菌物新名称发表数据, 可实时展示菌物分类学的研究热点, 并为学科的未来发展提供参考数据。根据世界菌物名称信息库Fungal Names、Index Fungorum和MycoBank所收录的数据, 2020年全球共发表了4,996个菌物新名称, 包括652个新高阶分类单元、2,905个新种及种下单元、1,342个新组合和97个其他名称, 是历史上发表菌物新名称数量最多的一年。这些新名称隶属于12门44纲173目469科1,386属, 盘菌、小型子囊菌、地衣和伞菌是本年度最受关注的类群。来自全球的1,978位学者将上述菌物新名称发表在133个期刊的885篇论文和9部专著中, 其中669位作者是首次参与新名称发表, 是历年来新作者最多的一年。本年度发表的菌物新物种的模式标本来自世界103个国家和地区, 东亚和东南亚是新物种发现的最热点地区, 而中国是发现新物种最多的国家, 共发现663种, 占全球的23%, 是排名第二位的泰国的2.28倍。西南地区是我国新物种发现的热点地区, 云南、贵州、西藏三省区本年度发现的新物种数量占全国的44.80%。除了新物种来源, 中国学者在本年度的菌物分类学研究中取得了令人瞩目的成果, 333位中国学者参与发表了1,271个菌物新名称, 占全球新名称总数的1/4。这些菌物新名称隶属于8门24纲87目209科440属, 发表在45个期刊的258篇研究论文和1部专著中。通过上述研究发现, 全球菌物新物种发现的速度仍在加快, 命名作者和新名称发表数量在逐步增加, 研究类群规模在逐渐扩大。但菌物物种描述率仍处于较低水平, 持续、高效地发现菌物新物种将是菌物学者的重点研究方向之一。
中国菌物分类研究始于20世纪上半叶, 在经历了艰难起步和稳步积累阶段后, 目前正处于快速发展的时期。近20年来, 中国菌物分类学对世界的贡献逐步提升, 模式标本产地来源中国的菌物有5,458种, 占全世界同期的15.40%。近年来, 中国学者每年发表的新名称数量占到了世界的1/5左右(王科等, 2021)。
2020年, 全球1,978位学者参与发表了4,996个菌物新名称(附录1), 是历史上发表新名称、新分类群和新物种数量最多的一年。这些名称包含了1个新纲、1个新亚纲、21个新目、5个新亚目、53个新科、4个新亚科、300个新属、2个新亚属、96个新组、8个新亚组、161个新系、2,879个新种、5个新亚种、11个新变种和10个新变型, 共3,557个新分类单元。此外, 还有1,342个新组合、53个修订名称、4个不合格名称和40个不合法名称。21世纪以来, 世界每年发表的菌物新名称数量保持着稳步上升的趋势, 由2000-2011年均不到3,000个名称, 到2020年即将超过5,000个(图1)。
本年度发表的菌物新名称涵盖了真菌(true fungi)、卵菌(oomycetes)和黏菌(slime mold) 3个类群, 涉及12门44纲173目469科1,386属。研究类群覆盖了世界已知真菌类群1/10的属和2/5的科。Beimforde等(2020)建立了树脂生真菌的新纲Sareomycetes, 是本年度所发表的最高等级分类单元。对新分类单元所属科进行统计发现, 盘菌类(圆盘菌科、盘菌科)、小型子囊菌(曲霉科、亚隔孢壳科、从赤壳科)、地衣(黄枝衣科、叶上衣科)和伞菌(丝膜菌科和小脆柄菇科)是最受研究者关注的类群(表1)。在发表新分类单元最多的几个类群中, 本年度都有重要文章或著作发表, 对其分类系统进行了全面更新和修订。Baral等(2020)将其团队30年的研究成果进行总结, 在世界范围内确定了圆盘菌科有7属470个物种(包含4个新属和331个新种), 使该科的已知物种数量增加了2.4倍。Houbraken等(2020)全面更新了曲霉科中曲霉属(Aspergillus)和青霉属(Penicillium)的分类系统, 对其属下分类单元进行了重新划分, 建立了1个新科、4个新属和141个属下次级分类单元。Wächter和Melzer (2020)收集了小脆柄菇科的18,133条分子序列开展系统发育分析, 并结合形态特征, 提出了该科全新的属级分类体系, 建立了7个新属, 并对该科下74个物种做了分类修订。除此之外, 本年发表的37个新属和198个新种的科级分类地位未定, 有待在今后进一步研究。
2020年, 全球有1,978位学者参与了世界菌物新名称的发表, 作者数量仅次于2016和2017年, 为历史第三的年份。其中669位作者是首次参与新名称发表, 是历年来新作者最多的一年。在作者的个人贡献方面, 44.34%的作者(877位)仅发表了1个新名称; 而发表10个新名称以上的高产作者有203位, 占作者总数的约1/10 (图2)。
2020年, 来自世界各国的学者将4,996个菌物新名称发表在133个期刊的885篇论文和9部专著中。专著中发表的新名称有492个, 仅占新名称总数的不足1/10, 其余4,504个名称发表在期刊论文中。在期刊的选择上, 多数论文发表在菌物学、微生物学或分类学期刊中, 也有少数名称发表在基因组学、植物学期刊上。发表文章数最多的是Phytotaxa, 该期刊立足于高效快速地发表新物种, 所刊载文章多数描述1-3个新物种, 本年度共发表97篇文章147个新物种。Fungal Diversity和Studies in Mycology两种期刊则多刊载针对某个类群系统性研究的文章,一篇文章往往会发表数十甚至上百个新分类单元和新名称。Fungal Diversity在本年度刊载了最多的新名称和新物种, 在发表的23篇文章中涉及到82个新高阶分类单元、405个新种及种下单元和226个新组合。Studies in Mycology刊载了最多的新高阶分类单元, 刊载了12个新目及亚目、14个新科和185个新属及属下次级分类单元(图3)。
本年度发表的菌物新物种有2,879种, 新种的模式标本来自于世界7个大洲的103个国家和地区。亚欧大陆发现的菌物新物种占全世界的60%以上,而亚洲尤其是东亚和东南亚, 是新物种发现的最热点地区(图4)。地处东亚的中国、日本、韩国一共发现了740个新物种, 占全球同期发表数的1/4; 而所属东南亚的泰国、越南、马来西亚和印度尼西亚等国, 共发现了324个新物种, 占全球同期的11.25%。
中国菌物分类学在2020年度延续着近年来高速发展的趋势。本年度, 有333位中国学者参与发表了1,271个菌物新名称, 是历史上中国学者发表菌物新名称最多的一年, 分别占本年度世界菌物命名作者总数的16.84%和新名称总数的25.44%。中国学者所发表的名称有新分类单元978个, 包括3个新目、13个新科、83个新属、1个新亚属、2个新组、1个新亚组、875个新种。此外, 中国学者还发表了276个新组合和17个其他名称。上述名称中, 由中国学者独立发表的有627个(49.33%), 其余644个(50.67%)由中外学者合作发表, 中外合作发表的比例较往年有所增加。
在本年度参与新名称发表的中国学者有333人, 仅少于2016年的342人, 位居历史第二; 首次参与新名称发表的有103人, 占30.93%, 与近年的比例基本持平。在本年度发表100个以上新名称的学者共有15位, 其中4位来自中国(表1)。发表名称最多的两位学者是从事酵母分类研究的白逢彦研究员和王启明研究员, 分别发表了163和155个新名称, 两人在本年度合作发表了2个新目、3个新科、10个新属和130多个新种(Li et al, 2020)。此外, 子囊菌分类专家蔡磊研究员本年度参与了4篇分类学文章, 发表了1个新科、9个新属、89个新种和26个新组合(Hou et al, 2020a,b; Zhao et al, 2020; Zhang et al, 2021)。以上三位学者都是近20年来发表菌物新分类单元最多的中国学者, 持续为中国乃至世界菌物新物种发现做出了突出的贡献(王科等, 2021)。
相比全世界的菌物分类学者, 中国学者更倾向于将新名称发表在期刊论文中。本年98.51% (1,252个)的名称发表在45个期刊的258篇研究论文中, 仅有19个发表在1部专著中(Baral et al, 2020)。在期刊的选择上, 发表在中文期刊的名称数少于往年, 仅有1个新属、23个新种、4个新组合和1个其他新名称发表在《菌物学报》《菌物研究》《食用菌学报》3个期刊的16篇文章中, 占期刊发表名称数的2.32%和文章数的6.20%。与世界菌物学者的偏好相同, 中国学者在Fungal Diversity和Studies in Mycology两种期刊发表的新名称最多(分别为344和304个), 在Phytotaxa期刊发表的文章数量最多(47篇)。
本文的其它图/表
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