图/表详细信息

利用SRAP分析核盘菌遗传多样性

陈碧云, 胡琼, Christina Dixelius, 李国庆, 伍晓明

生物多样性 2010, 18 (5): 509-515. DOI: 10.3724/SP.J.1003.2010.509

摘要（5628）

HTML （11）

PDF（pc）（798KB）（5876）

核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)是危害油菜等多种经济作物的重要病原真菌。研究不同地区、相同或不同寄主核盘菌的遗传多样性对了解核盘菌的遗传演化过程和指导病害防控具有重要意义。我们采用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism, SRAP)标记对不同地理来源、不同寄主来源的76个核盘菌菌株的遗传多样性进行了分析。7对SRAP引物共获得260个位点, 其中114个为多态位点, 占43.85%。UPGMA聚类结果显示, 在相似性系数为0.64时, 76个核盘菌菌株分为4个组, 每组包含的菌株数分别为54、18、2和2。聚类及主成分分析结果显示, 来源于春油菜生态区和冬油菜生态区油菜上的核盘菌菌株可以明显分为两簇, 而油菜、大豆、莴苣等不同寄主植物上的核盘菌菌株没有明显的遗传分化。分子变异分析(AMOVA)结果显示, 不同地理来源、不同油菜生态区和不同寄主来源的核盘菌群体内的变异率分别为75.2%、81.2%和97.6%, 均达到极显著水平(P<0.001); 不同地理来源和不同油菜生态区的核盘菌群体间的变异率分别为24.8%和18.8%, 也达到极显著水平(P<0.001); 不同寄主来源的核盘菌群体间的变异率仅为2.4%, 变异不显著(P = 0.8673)。研究结果表明, 来源于春油菜生态区的核盘菌的遗传多样性高于冬油菜生态区。

编号 No.	菌株名称 Isolate	寄主 Host		来源 Origin	编号 No.		菌株名称 Isolate		寄主 Host	来源 Origin
1	RSC-1	油菜 Rape		陕西勉县 Mianxian, Shaanxi	31		F5-219-S2 clone 39		大豆 Soybean	加拿大 Canada
2	RSC-2	油菜 Rape		陕西咸阳 Xianyang, Shaanxi	32		F5-138-L4 clone 321		大豆 Soybean	加拿大 Canada
3	RSC-3	油菜 Rape		陕西大荔 Dali, Shaanxi	33		LMK211 clone 2		油菜 Rape	加拿大 Canada
4	RSC-4	油菜 Rape		湖北武汉 Wuhan, Hubei	34		CW312 clone 1		大豆 Soybean	加拿大 Canada
5	RSC-5	油菜 Rape		湖北武汉 Wuhan, Hubei	35		CW317 clone 2		大豆 Soybean	加拿大 Canada
6	RSC-6	油菜 Rape		湖北武汉 Wuhan, Hubei	36		SC-13 Sweden		油菜 Rape	瑞典 Sweden
7	RSC-7	油菜 Rape		湖北襄樊 Xiangfan, Hubei	37		IC16		油菜 Rape	挪威 Norway
8	RSC-8	油菜 Rape		河南确山 Queshan, Henan	38		IC6		油菜 Rape	挪威 Norway
9	RSC-9	油菜 Rape		湖南汉寿 Hanshou, Hunan	39		824 clone 1		油菜 Rape	加拿大 Canada
10	RSC-10	油菜 Rape		河南遂平 Suiping, Henan	40		Xbz-4		小白菜 Pakchoi	湖北罗田 Luotian, Hubei
11	RSC-11	油菜 Rape		河南信阳 Xinyang, Henan	41		Xbz-5		小白菜 Pakchoi	湖北十堰 Shiyan, Hubei
12	RSC-12	油菜 Rape		河南郑州 Zhengzhou, Henan	42		Xbz-9		小白菜 Pakchoi	湖北洪湖 Honghu, Hubei
13	RSC-13	油菜 Rape		河南郑州 Zhengzhou, Henan	43		Sb-2		大豆 Soybean	黑龙江 Heilongjiang
14	RSC-14	油菜 Rape		江西宜春 Yichun, Jiangxi	44		Sb-4		大豆 Soybean	美国 USA
15	RSC-15	油菜 Rape		浙江杭州 Hangzhou, Zhejiang	45		Sb-6		大豆 Soybean	加拿大 Canada
16	RSC-16	油菜 Rape		浙江杭州 Hangzhou, Zhejiang	46		Cor-3		芫荽 Coriander	湖北神农架 Shennongjia, Hubei
17	RSC-17	油菜 Rape		贵州思南 Sinan, Guizhou	47		Cor-6		芫荽 Coriander	湖北通城 Tongcheng, Hubei
18	RSC-18	油菜 Rape		湖北罗田 Luotian, Hubei	48		Brb-1		蚕豆 Horsebean	湖北武汉 Wuhan, Hubei
19	RSC-19	油菜 Rape		湖北英山 Yingshan, Hubei	49		Brb-9		蚕豆 Horsebean	湖北通城 Tongcheng, Hubei
20	RSC-20	油菜 Rape		江苏南京 Nanjing, Jiangsu	50		Rap-1		油菜 Rape	湖北云梦 Yunmeng, Hubei
21	RSC-21	油菜 Rape		江苏南京 Nanjing, Jiangsu	51		Rap-2		油菜 Rape	湖北沙市 Shashi, Hubei
22	RSC-22	油菜 Rape		江西南昌 Nanchang, Jiangxi	52		Rap-6		油菜 Rape	四川雅安 Yaan, Sichuan
23	RSC-23	油菜 Rape		四川绵阳 Mianyang, Sichuan	53		Rap-20		油菜 Rape	湖北罗田 Luotian, Hubei
24	RSC-24	油菜 Rape		陕西杨凌 Yangling, Shaanxi	54		Rap-21		油菜 Rape	湖北宣恩 Xuanen, Hubei
25	RSC-25	油菜 Rape		湖北武汉 Wuhan, Hubei	55		Rap-31		油菜 Rape	湖北宜昌 Yichang, Hubei
26	RSC-26	油菜 Rape		黑龙江佳木斯 Jiamusi, Heilongjiang	56		Rap-35		油菜 Rape	湖北五峰 Wufeng, Hubei
27	RSC-27	油菜 Rape		青海西宁 Xining, Qinghai	57		Rap-36		油菜 Rape	英国 Britain
28	RSC-28	油菜 Rape		青海西宁 Xining, Qinghai	58		Rap-37		油菜 Rape	加拿大 Canada
29	RSC-29	油菜 Rape		青海西宁 Xining, Qinghai	59		Hzd-3		小白菜 Pakchoi	湖北仙桃 Xiantao, Hubei
30	RSC-30	油菜 Rape		青海西宁 Xining, Qinghai	60		Hzd-4		小白菜 Pakchoi	湖北黄梅 Huangmei, Hubei
编号 No.	菌株名称 Isolate	寄主 Host	来源 Origin			编号 No.		菌株名称 Isolate	寄主 Host	来源 Origin
61	Nic-1	烟草 Tobacco	湖北咸丰 Xianfeng, Hubei			69		Let-46	莴苣 Lettuce	湖北神农架 Shennongjia, Hubei
62	Zxd-1	红豆 Red bean	内蒙古扎兰屯 Zalanten, Inner Monglia			70		Brb-8	蚕豆 Horsebean	湖北通山 Tongshan, Hubei
63	Rad-1	萝卜 Radish	湖北竹山 Zhushan, Hubei			71		Let-9	莴苣 Lettuce	湖北五峰 Wufeng, Hubei
64	clone-22	油菜 Rape	加拿大 Canada			72		Let-3	莴苣 Lettuce	湖北武汉 Wuhan, Hubei
65	UK-2	不清 Unknown	湖北武汉 Wuhan, Hubei			73		Let-27	莴苣 Lettuce	台湾 Taiwan
66	Can02-6	油菜 Rape	湖北武汉 Wuhan, Hubei			74		Let-11	莴苣 Lettuce	湖北宜昌 Yichang, Hubei
67	Cor-10	芫荽 Coriander	湖北宜昌 Yichang, Hubei			75		Can02-22	油菜 Rape	湖北武汉 Wuhan, Hubei
68	Rad-30-2	萝卜 Radish	湖北神农架 Shennongjia, Hubei			76		Let-26	莴苣 Lettuce	加拿大 Canada

View table in article

附录Ⅰ 76个核盘菌菌株、寄主及来源

正文中引用本图/表的段落

主成分分析结果(图2)表明, 第一和第二主成分分别可以解释遗传总变异的37.53%和8.61%(共46.14%), 并将除43、57与62号菌株外的73个核盘菌菌株明显分为冬油菜生态区和春油菜生态区两类, 这与聚类结果一致。

本文的其它图/表