全球变化情景下的中国木本植物受威胁物种名录
A new list of threatened woody species in China under future global change scenarios
通讯作者: * E-mail:zhiheng.wang@pku.edu.cn
编委: 严岳鸿
责任编辑: 黄祥忠
收稿日期: 2021-11-15 接受日期: 2022-05-10
基金资助: |
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Corresponding authors: * E-mail:zhiheng.wang@pku.edu.cn
Received: 2021-11-15 Accepted: 2022-05-10
生物多样性正面临快速丧失的风险, 气候和土地利用变化已成为生物多样性的主要威胁之一。受威胁物种名录是区域和全球生物多样性保护的重要基础数据, 也是保护区规划的基础。作为一个生物多样性大国, 中国已开展了高等植物受威胁状况的系统性评估, 建立了受威胁植物名录, 为植物多样性保护规划提供了支撑。但由于数据和方法限制, 现有受威胁植物名录制定时未定量考虑全球变化对植物分布的潜在影响, 因而可能低估物种的受威胁等级及未来生物多样性的丧失风险。本研究基于高精度的木本植物分布数据和物种分布模型, 评估了未来气候和土地利用变化对木本植物分布的潜在影响。基于每个物种适宜分布区大小的变化, 并依据IUCN红色名录评估指标A3c的阈值标准, 更新了木本植物的受威胁等级, 补充了未来中国潜在受威胁木本植物名录。结果显示: 综合不同的气候变化情景(RCP 2.6、RCP 6.0和RCP 8.5)和扩散情景(完全扩散、20 km/10年、不扩散), 约12.9%-40.5%的木本植物被评估为受威胁物种。该名录将为制定木本植物保护优先级、开展保护区规划、提升全球变化情景下的生物多样性保护成效提供基础数据, 也为其他类群制定全面的受威胁物种名录提供参考。 数据库(集)基本信息简介
数据库(集)名称 全球变化情景下的中国木本植物受威胁物种名录 作者 彭莳嘉, 罗源, 蔡宏宇, 张晓玲, 王志恒 通讯作者 王志恒(zhiheng.wang@pku.edu.cn) 时间范围 现在至2070年 地理区域 中国 文件大小 2.06 MB 数据格式 *.xlsx 数据链接 http://dataopen.info/home/datafile/index/id/256
http://doi.org/10.24899/do.202205002
https://www.biodiversity-science.net/fileup/1005-0094/DATA/2021459.zip 数据库(集)组成 该数据集共包含2个数据库: (1)中国11,405种木本植物现在(覃海宁等,
关键词:
The world is currently experiencing a biodiversity crisis, and climate and land-cover changes are now recognized as two major threats to biodiversity. China is one of the mega-biodiversity countries and the threatened species list of China’s higher plants was reported in 2017. This list provided important data for biological conservation and protected area planning from regional to global scales. However, it was mainly based on the past and current status of species population and distribution, while future responses of species to climate and land-cover changes were rarely considered. This will lead to an underestimation of future local extinction risks. Using high-resolution species distribution data of woody plants and species distribution models, we evaluated the impacts of climate and land-cover changes on woody species distributions and estimated changes in the extent of occurrence (EOA) for each species. Our results indicate that 12.9%-40.5% of woody species will be threatened under different climate and dispersal scenarios. Based on these results, we updated the list of threatened woody species in China based on the IUCN Red List Criteria. This new list of threatened woody species provides important data for assessing the conservation priorities of woody plants, for the planning of future nature reserve extension, for improving the performance of nature reserves under future global change scenarios, and for updating the list of threatened species of other taxa. Database/Dataset Profile
Title A new list of threatened woody species in China under future global change scenarios Authors Shijia Peng, Yuan Luo, Hongyu Cai, Xiaoling Zhang, Zhiheng Wang Corresponding author Zhiheng Wang (zhiheng.wang@pku.edu.cn) Time range Current-2070 Geographical scope China File size 2.06 MB Data format *.xlsx Data link http://dataopen.info/home/datafile/index/id/256
http://doi.org/10.24899/do.202205002
https://www.biodiversity-science.net/fileup/1005-0094/DATA/2021459.zip Database/Dataset
compositionThe dataset consists of two data files: (1) The classification of 11,405 woody plant species as threatened or non-threatened under current (Qin et al,
Keywords:
本文引用格式
彭莳嘉, 罗源, 蔡宏宇, 张晓玲, 王志恒 (2022)
Shijia Peng, Yuan Luo, Hongyu Cai, Xiaoling Zhang, Zhiheng Wang (2022)
目前, IUCN红色名录定量评估指标体系已较为完善, 共包括5类指标: 标准A, 分布范围内种群大小下降; 标准B, 有限的地理分布范围; 标准C, 种群内成熟个体数下降或减少; 标准D, 极小种群或分布十分受限; 标准E, 未来野外灭绝概率增加。其中标准A包括物种过去(A1指标和A2指标)、未来(A3指标)或从过去到未来(A4指标)的种群动态。在标准A中, 种群动态变化可采用以下5种方式评估: (a)直接观测(不适用于A3); (b)适合研究类群的多度指标; (c)分布范围(extent of occurrence, EOA)、占有面积(area of occupancy, AOO)和/或生境质量; (d)实际或潜在的利用强度; (e)外来类群、杂交、病原菌、污染、竞争者或寄生等对种群大小的影响(IUCN, 2012)。尽管现有的评估指标体系包括了未来种群动态改变, 然而, 由于数据和方法限制, 现有的相关研究很少定量化这一要素对物种濒危等级的影响。
本研究利用中国11,405种木本植物的高精度分布数据(20 km × 20 km), 结合物种分布模型, 评估了未来气候和土地利用变化对中国木本植物分布的影响。基于物种未来潜在分布区的变化情况, 并参考IUCN的A3阈值标准, 将物种划分为不同的受威胁等级; 对比现有的受威胁物种与未来全球变化情景下的潜在受威胁物种, 对现有的受威胁物种名录进行有效补充, 拟为进一步开展中国生物多样性与保护生物学的研究提供基础数据。需要指出的是, 本研究旨在现有红色名录基础上增加全球变化情景下的受威胁物种, 而非否定现有名录。
1 数据采集与处理方法
1.1 数据来源
木本植物是指根和茎含有木质部的植物。中国木本植物分布数据主要来自于《中国木本植物分布图集》(Wang et al, 2009; Fang et al, 2011)。该图集基于目前已出版的全部国家级和省级植物志以及大量地方植物志和区域考察报告, 记录了中国11,405种木本植物的县级分布数据, 其中乔木3,165种, 灌木7,205种, 木质藤本1,035种, 分类系统与Flora of China一致。近年来, 通过进一步收集整理2009- 2018年间出版的40余卷国家和地方植物志以及大量的文献资料, 结合最新公布的标本记录数据: 主要来源于中国数字标本植物馆(
构建物种分布模型所需的现代和未来气候数据均来自于全球气候数据库(WorldClim,
现代和未来土地利用数据来自Li等(2017)发表的2010和2100年全球1 km土地利用与土地覆盖数据(LUCC)产品。该产品将全球的土地利用和土地覆盖划分为6个类型, 分别为水体、森林、草地、农田、城市用地以及裸地。我们计算了20 km × 20 km网格内每种土地利用类型所占的比例作为土地利用变量, 用于建立物种分布模型。由于水体对陆地植物分布的影响较小, 本研究未将水体用于建模分析。未来土地利用与土地覆盖数据包含4个SRE情景(special report on emissions scenarios), 分别为A1B, A2, B1和B2。本研究选取B1、A1B和A2这3种情景, 并与3个RCPs情景对应(IPCC, 2014; Peng et al, 2022)。此外, 由于仅能获得2100年的土地覆盖数据, 因此我们将2100年的LUCC与2070年的气候数据相匹配。
植物的分布可能受土壤条件的影响, 因此在进行物种分布预测时, 我们也选择了多个能够反映土壤理化性质的土壤变量。表层土壤(0-15 cm)数据来源于SoilGrid250m (
1.2 数据处理方法
采用R语言中的biomod2包进行物种分布模型的构建(Thuiller et al, 2009)。Biomod2是目前比较常用的物种分布模型软件包, 提供了多种物种分布模型算法以及模型集成方法来提高模型预测的精确度。本研究共采用5种物种分布模型: 广义线性模型(GLM)、分类回归树(CTA)、广义提升回归模型(GBM)、随机森林(RF)和最大熵(MaxEnt)模型, 涵盖分类、回归和机器学习等不同算法。5种算法的参数设置均采用biomod2包中的默认值。
对于每个物种和每种物种分布模型, 我们将完整的分布数据随机分割成两部分, 80%用来建模, 20%用来评价模型的表现, 这一过程重复10次。因此, 每个物种共生成50个模型, 用于预测物种的现代潜在分布以及未来不同气候和土地利用变化情景下的潜在分布。利用真实技巧统计(true skill statistics, TSS)来评价模型的表现。TSS的值介于-1到1之间。当TSS > 0时, 证明模型优于随机; 而当TSS > 0.5时, 认为模型表现良好(Allouche et al, 2006)。为了减小由于模型拟合度差而导致的不确定性, 在每个物种的50个模型中, 只有TSS > 0.5 的模型预测结果会被用于最终的模型集成。模型集成采用中位数法。由于模型集成的结果是介于0-1之间的概率值, 我们采用MaxTSS为阈值的方法将概率值转换为0和1的二项分布。
当物种的分布记录太少时, 模型预测精度通常较差且易出现过拟合现象。之前相关研究通常删除分布记录较少的物种。然而, 分布区较小的狭域物种更容易受到气候变化和人类活动的影响。对于分布范围大于5而小于20个网格的物种, 本研究采用集成小模型(ensembled small models)的方法(Breiner et al, 2018)。研究显示, 当物种分布记录与预测变量个数的比值为10 : 1时, 模型的拟合效果最好(Brun et al, 2020)。因此, 我们对15个预测变量进行两两组合, 共有105对变量组合。对每个物种构建105个二元模型, 同样采用5种模型算法, 最终每个物种共525个模型纳入分析。参数的设置、后续模型的筛选以及阈值的选择等均与对广域物种(分布记录大于20个网格的物种)的处理方式一致。对于分布区小于5个网格的物种来说(共560个物种), 由于> 90%的模型拟合度都较差(TSS < 0.5), 因此, 这部分物种未包括在本次研究中。
对于未来气候变化情景下的物种分布, 本研究假设了3种扩散情景: (1)完全扩散。该情景下物种可以扩散到未来气候变化情景下所有合适的栖息地。(2) 20 km/10年。即物种每10年扩散20 km。该扩散速度根据IPCC报告和其他研究中植物所能达到的最大扩散速度而确定(Chen et al, 2011, IPCC, 2014)。因此, 到2070年, 中国木本植物最大可以扩散200 km。(3)无扩散。该情景下物种不能扩散, 在未来气候变化情景下物种只能继续存在于原来分布的栅格里或消失。在无扩散情景下, 我们直接将模型预测得到的物种现在和未来的潜在分布范围进行叠加, 所得的重叠部分即为物种在未来的分布范围。关于本文中物种分布模型的建立、检验和预测方法详见Peng等(2022)。
为评估在不同扩散情景和未来气候和土地利用变化情景下中国木本植物的受威胁程度及灭绝风险, 本研究基于物种分布范围的变化, 参考IUCN物种红色名录评估指标(A3c指标) (IUCN, 2012), 将物种划分为不同的受威胁等级, 分别为灭绝(Extinction, EX)、极危(Critically Endangered, CR)、濒危(Endangered, EN)、易危(Vulnerable, VU)和无危(Least Concern, LC)。其中, 本文所关注的受威胁物种包括前4个等级(VU + EN + CR + EX)。我们建立了不同情景下的根据A3c指标确定的受威胁物种名录及各类受威胁物种占全部物种的比例, 并与覃海宁等(2017)发布的受威胁物种名录进行了对比分析。
2 数据描述
结果显示, 到2070年, 在不同气候和土地利用变化情景以及不同扩散情景下, 潜在受威胁物种的数量具有显著差异。在RCP 8.5情景下, 受威胁物种的比例高于RCP 2.6与RCP 6.0情景。在相同的气候和土地利用变化情景下, 随着物种扩散能力的降低, 受威胁物种的比例也随之增加。在完全扩散情景下, 平均约有14.0%的木本植物将会受到威胁(RCP 2.6: 12.9%; RCP 6.0: 14.0%; RCP 8.5: 15.2%), 其中, 平均4.8% (3.6%-5.5%)的物种被评为灭绝, 2.9% (2.4%-3.5%)为极危, 3.4% (3.2%-3.5%)为濒危, 2.9% (2.4%-3.5%)为易危; 在20 km/10年的扩散情景下, 平均约有19.8%的木本植物将会受到威胁(RCP 2.6: 17.8%; RCP 6.0: 20.2%; RCP 8.5: 21.5%), 其中, 6.4% (5.3%-7.3%)的物种将会灭绝; 3.9% (3.3%-4.6%)的物种极危; 4.9% (4.6%-5.1%)的物种濒危, 4.6% (4.0%-5.3%)的物种易危; 在不扩散的情景下, 平均约有37.6%的木本植物受到威胁(RCP 2.6: 33.7%; RCP 6.0: 38.8%; RCP 8.5: 40.5%), 其中, 8.0% (6.3%-9.2%)的物种灭绝; 5.8% (5.2%-6.5%)的物种极危; 10.7% (8.8%-12.7%)的物种濒危, 13.1% (11.1%-15.7%)的物种易危。我们选取一个代表性物种锐角槭(Acer acutum), 给出了其在当前和未来情景下的潜在分布图(附录1)。
3 数据质量控制与评估
本研究的数据来源包括: (1)《中国木本植物分布图集》(Atlas of Woody Plants in China: Distributions and Climate) (Fang et al, 2011); (2)中国其他已发表的植物志、地图集和文献, 包括Flora of China (25卷)、《中国植物志》(126卷)、《中国高等植物》, 以及目前所能收集到的省级植物志(共计27个省149卷/册), 已发表的区域尺度的植物志和各种名录, 如昆仑山脉、南岭、秦岭和青藏高原等地区, 共计42卷/册; (3)中国国家标本资源共享平台近年来发布的标本数据。为了确保分布数据的精确度,收集过程仅筛选了县级水平, 或者有明确经纬度记录的标本数据。此外, 对于面积相对较大的县(如新疆塔克拉玛干沙漠地区), 本研究将其细分成2-4个小区域, 在此基础上, 根据每种植物的海拔分布范围和生境信息对县级分布进行降尺度, 从而提高分布数据的精确度。
在构建模型以及模型筛选方面, 本研究采用多个算法、多种情景的模型集成方法, 在一定程度上减少了由于算法不同而导致的结果的不确定性, 显著改善了模型的预测能力, 得到更可靠的预测结果(Araujo & New, 2007)。此外, 对于狭域物种(分布区网格数为5-20), 我们采用最新的集合小模型方法进行模拟, 拓展了对狭域物种的模型模拟能力, 也为认识未来全球变化下狭域物种的分布区变化提供了新数据。
值得注意的是, 随着植物系统学的发展, 近年来人们发表了部分新物种(如希陶木, Tsaiodendron dioicum), 目前中国木本植物的总数量略高于本研究数据库中所包含的物种。由于这些新类群大多生境独特、分布狭窄且数量较少, 很多可能面临比较高的威胁。由于部分新发表物种的分布范围尚存在不确定性, 部分物种也未被收录至Flora of China或Catalog of Life (COL)中, 其分类地位也可能存在不确定性。因此, 本研究并未完全包含这些新发表物种。随着野外调查和文献调研的深入, 未来可根据最新的数据, 定量评估气候变化和人类活动对其分布的影响, 进而确定其受威胁等级。
4 数据使用方法和建议
已有研究显示, 物种分布模型的预测精度受物种分布区大小的影响较大(Wisz et al, 2008)。尽管本研究采用集成小模型的方法对狭域物种的分布区进行了模拟, 但仍有560种物种因分布区过小(小于5个网格)而无法进行模型拟合。这些物种可能也会受到未来气候变化和人类活动的威胁。经统计, 这560种物种约有1/4已被包括在覃海宁等(2017)的受威胁植物名录中。但值得注意的是, 这部分狭域物种中仍有3/4未被以往评估确定为受威胁物种, 也未被包括在本研究的评估中。这些物种大部分为潜在受威胁物种。在本研究中, 分布区小于5个网格的物种被标记为“\”。在今后研究中, 要集中开展对这些信息缺乏的潜在受威胁物种的野外调查, 并采集和保存其种质资源, 为未来开展生物多样性监测与保护工作提供参考。尽管如此, 本研究旨在通过评估未来气候和土地利用变化情景下物种分布范围大小的变化情况, 对现有的本本植物受威胁物种名录进行补充, 即在现有红色名录的基础上增加未来全球变化情景下的受威胁物种, 而非否定现有名录。因此, 这些少数缺失的狭域物种不会影响本研究的主要结论。同时, 本研究也统计了所有气候和扩散情景下都将受到威胁的物种, 共870种, 其中灭绝的有313种。相较于只在少数几种情景下受威胁的物种, 这些共同出现的物种在未来的保护规划中则需重点关注。此外, 本研究中所有物种分布数据的空间分辨率为20 km × 20 km, 该精度对于未来的保护规划仍显粗糙。随着相关文献数据与标本资料的不断数字化, 未来可结合新的数据和野外调查进一步细化物种分布数据(Peng et al, 2022)。
作者分工
彭莳嘉负责初步科学问题的提出、数据分析和文章的撰写; 罗源负责模型的构建; 蔡宏宇负责部分文字的撰写; 张晓玲负责分布数据的处理; 王志恒负责科学问题的升华、研究设计指导及文稿统筹。
附录 Supplementary Material
附录1 锐角枫(Acer acutum)在当前与未来不同气候变化和扩情情景下的分布情况
Appendix 1 The distribution area of Acer acutum under current and future climate and dispersal scenarios
参考文献
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Globally, priority areas for biodiversity are relatively well known, yet few detailed plans exist to direct conservation action within them, despite urgent need. Madagascar, like other globally recognized biodiversity hot spots, has complex spatial patterns of endemism that differ among taxonomic groups, creating challenges for the selection of within-country priorities. We show, in an analysis of wide taxonomic and geographic breadth and high spatial resolution, that multitaxonomic rather than single-taxon approaches are critical for identifying areas likely to promote the persistence of most species. Our conservation prioritization, facilitated by newly available techniques, identifies optimal expansion sites for the Madagascar government's current goal of tripling the land area under protection. Our findings further suggest that high-resolution multitaxonomic approaches to prioritization may be necessary to ensure protection for biodiversity in other global hot spots.
A new global land-use and land-cover change product at a 1-km resolution for 2010 to 2100 based on human-environment interactions
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Effects of sample size on the performance of species distribution models
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