长江源区位于青藏高原腹地, 海拔普遍在4,500‒6,000 m之间, 是全球最重要的水源涵养区之一。本研究针对青藏高原长江青海流域鱼类多样性进行了系统调查与分析, 以了解该区域的鱼类资源现状及其面临的威胁。研究覆盖了长江源干流及长江主要支流, 包括长江源的通天河、沱沱河、楚玛尔河和当曲, 以及雅砻江源和大渡河源。2021‒2022年共设置调查样点43个, 记录到鱼类26种(亚种), 隶属于2目3科12属。与历史调查相比, 发现新分布鱼类7种, 其中土著鱼类4种, 外来鱼类3种。相对重要性指数分析显示, 长江源区的优势种为软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)和小头高原鱼(Herzensteinia microcephalus)。α多样性指数显示通天河和大渡河的物种多样性较高, 而雅砻江的物种均匀度较低。相似性系数和主坐标分析(principal co-ordinates analysis, PCoA)揭示了大渡河源与长江源、雅砻江源之间的物种组成差异明显, 反映了地理隔离对鱼类多样性的影响。环境因子同样影响鱼类物种分布, 典型相关分析(canonical correspondence analysis, CCA)结果表明水温和海拔对鱼类分布有影响。空间自相关分析确定了鱼类分布状态为随机且轻微聚集, 分布热点分析发现通天河和大渡河支流存在鱼类分布热点。研究阐明了长江源区鱼类多样性的空间分布差异, 并提示需要根据不同流域鱼类物种分布特征进行保护。