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基于DNA宏条形码技术分析香螺食性
贺加贝, 柯可, 孙海明, 胡丽萍, 赵晓伟, 王文豪, 赵强
生物多样性    2025, 33 (1): 24403-.   DOI: 10.17520/biods.2024403
摘要   (336 HTML7 PDF(pc) (575KB)(360)  

底栖动物是海洋生态系统的重要组成部分, 在调控海洋生态系统的物质循环和能量流动过程中扮演了关键角色。腹足类动物通过捕食与被捕食行为调控着底栖生态系统的稳定性, 研究腹足类生物的食性有助于我们理解这一调控过程。香螺(Neptunea cumingii)是我国北方海域一种重要的腹足类动物, 具备极高的生态价值和经济价值。但是, 我们对其食性组成及生态功能的了解并不透彻。因此, 有必要探明自然条件下香螺现场食物组成, 提升对腹足类动物在我国北方海域底栖生态系统中所起调控作用的认识。本研究借助4份野生香螺胃含物样品, 以18S rDNA V4区和V9区为标靶, 利用DNA宏条形码技术对其胃含物真核生物进行分析。结果显示, 在4个样品中, 18S rDNA V4区和V9区共分别获得265,161条和221,998条高质量序列, 分别占各自原始序列的93.16%和86.54%, 分别注释到141个和490个OTUs; 虽然18S rDNA V4区获得的优质序列数及占比均更高, 但其注释到的物种数比18S rDNA V9区偏少。两个可变区所有OTUs分属17个门类, 包括动物界10门、真菌界5门、植物界1门, 以及SAR超类群, 包括不等鞭毛生物(Stramenopiles)、囊泡虫(Alveolates)和有孔虫(Rhizaria); 在纲水平上, 腹足纲、辅鳍鱼纲、吸虫纲和色矛纲相对丰度在两个可变区中均排名前十; 在OTU水平上, 两个可变区中3个以上样品中均有检出的物种仅分别占5.67%和8.08%, 且其共同属于软体动物门、脊椎动物亚门、子囊菌门及SAR超类群。总体上, 18S rDNA V4区和V9区两段DNA条形码分析结果显示, 香螺胃含物中真核生物种类丰富, 包括动物(如环节动物、节肢动物、软体动物)、真菌、植物和原生生物, 其中最丰富的类群是腹足类、鱼类、吸虫和真菌。在多个样本中只检测到一小部分共有OTUs, 这表明不同香螺摄食种类多变。结果表明, 香螺现场食性是一种机会主义捕食者, 动物尸体及海底沉积物可能是香螺自然状态下主要食物来源, 但同时其具备一定的清理附着生物潜能及植食性能力, 饵料可驯化性较强。其饵料组成受生存微环境影响较大, 具备一定的饵料驯化潜力。研究结果为深入了解香螺在海洋生态系统中的作用提供了数据支持, 并为香螺人工养殖饵料配比研究提供了新见解。


分类 Classification 细化分类单元 Classification in details
环节动物门 Annelida 单向蚓目 Haplotaxida
节肢动物门 Arthropoda 猛水蚤目 Harpacticoida
尾肢目 Podocopida
软甲纲 Malacostraca
膜翅目 Hymenoptera
鳃足纲 Diplostraca
蛛形纲 Arachnida
软体动物门 Mollusca 牡蛎目 Ostreoida
新腹足目 Caenogastropoda
枪形目 Teuthida
头足纲 Cephalopoda
扁形动物门 Platyhelminthes 后睾目 Opisthorchiida
斜睾目 Plagiorchiida
独孤科 Azygiida
脊椎动物亚门 Vertebrata 哺乳纲 Mammalia
辅鳍鱼纲 Actinopterygii
刺胞动物门 Cnidaria 多壳目 Multivalvulida
眼虫门 Euglenozoa 异线虫目 Heteronematina
动质体纲 Kinetoplastea
副牙形目 Parabodonida
线虫动物门 Nematozoa 蛔目 Ascaridida
单宫目 Monhysterida
杆形目 Rhabditida
棘皮动物门 Echinodermata 海星纲 Asteroidea
苔藓虫门 Bryozoa 唇口目 Cheilostomatida
栉口目 Ctenostomatida
Aphelidea 未鉴定 Norank
子囊菌门 Ascomycota 枝孢菌科 Cladosporiaceae
曲霉科 Aspergillaceae
梅奇酵母科 Metschnikowiaceae
毕赤酵母科 Pichiaceae
汉斯德巴酵母科 Debaryomycetaceae
双足囊菌科 Dipodascaceae
亚隔孢壳科 Didymellaceae
酵母科 Saccharomycetaceae
发菌科 Trichocomaceae
Plectosphaerellaceae
担子菌门 Basidiomycota 线黑粉菌科 Filobasidiaceae
马拉色菌科 Malasseziaceae
微球黑粉菌纲 Microbotryomycetes
短臂担科 Brachybasidiaceae
伞菌目 Agaricales
毛孢子菌科 Trichosporonaceae
黑粉菌科 Ustilaginaceae
多孔菌目 Polyporales
壶菌门 Chytridiomycota 未鉴定 Norank
隐霉菌门 Cryptomycota 未鉴定 Norank
芦苇藻门 Phragmoplastophyta 有胚植物纲 Embryophyta
SAR超类群 SAR 网黏菌纲 Labyrinthulomycetes
脆杆菌目 Fragilariales
水云目 Ectocarpales
间藻纲 Mediophyceae
卡盾藻纲 Chattonellales
Archigregarinorida
Thecofilosea
海洋原生藻 MAST-12A
叶咽纲 Phyllopharyngea
Eugregarinorida
横列甲藻纲 Dinophyceae
Gregarinasina
植黏菌纲 Phytomyxea
多甲藻目 Peridiniales
直链藻属 Melosirids
Suessiaceae
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表3 基于饵料种类分析结果
正文中引用本图/表的段落
除去香螺自身及未鉴定出物种的序列, 利用18S rDNA V4和V9两个可变区, 在4个样品中共鉴定出17个门类, 包括动物界的环节动物、节肢动物、软体动物、扁形动物、刺胞动物、棘皮动物、眼虫、线虫动物等10个门, 真菌界的Aphelidea、子囊菌、担子菌、壶菌和隐霉菌等5个门, 植物界的芦苇藻门, 以及SAR超类群, 包含不等鞭毛生物(Heterokonts, 又名Stramenopiles)、囊泡虫(Alveolates)和有孔虫(Rhizaria), 总体上, 动物及真菌来源是自然条件下香螺胃含物主要物种组成(表3)。
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