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戴云山国家级自然保护区访花昆虫DNA条形码数据集
罗小燕, 李强, 黄晓磊
生物多样性    2023, 31 (8): 23236-.   DOI: 10.17520/biods.2023236
摘要   (569 HTML46 PDF(pc) (695KB)(453)  

访花和传粉昆虫对于维持生态系统功能具有重要作用, 但我国相关昆虫类群的本底数据非常缺乏。作为基于特定基因序列的物种划分方法, DNA条形码在标本鉴定、新物种发现、生物多样性保护、种群遗传和进化等研究领域具有重要的应用价值。本文报道了福建戴云山国家级自然保护区双翅目、膜翅目和鞘翅目3个类群访花昆虫的815条线粒体COI条形码数据, 并详细提供了所获样品的海拔分布信息。该数据集可为地区性昆虫多样性的DNA条形码数据库构建、隐存种发现、海拔梯度物种遗传多样性和生物多样性保护等方面研究提供帮助。

数据库(集)基本信息简介

数据库(集)名称 戴云山国家级自然保护区不同海拔访花昆虫的DNA条形码数据集
作者 罗小燕, 李强, 黄晓磊
通讯作者 黄晓磊(huangxl@fafu.edu.cn)
时间范围 2021年
地理区域 福建泉州市德化县, 25°38'-25°43' N, 118°05′-118°20′ E
文件大小 107.63 KB
数据量 815条条形码序列; 815条样品记录
数据格式 *.fasta, *.xlsx
数据链接 http://www.dataopen.info/article/298
http://doi.org/10.24899/do.202307003
https://www.biodiversity-science.net/fileup/1005-0094/DATA/2023236.zip
数据库(集)组成 数据集共包括1个序列数据文件, 1个样品信息文件


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图4 本研究DNA条形码序列的BLAST比对情况
正文中引用本图/表的段落
根据在NCBI数据库进行BLAST同源比对的结果, 仅63条比对结果在99%以上, 其中膜翅目34条, 双翅目26条和鞘翅目3条, 分别占各类群总获条形码数的8.21%、8.36%和3.33%; 超过200条序列比对结果低于90% (图4), 暗示公共数据库中没有相关序列所代表的近缘物种, 也表明本研究提供了大量新测定的访花昆虫DNA条形码序列。
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