鲟鱼分子鉴定方法的整合应用 生物多样性    2022, 30 (6): 22034-.   DOI: 10.17520/biods.2022034

图1 目前已有SNP引物可鉴定的鲟鱼种类范围。GUE: 俄罗斯鲟; BAE: 西伯利亚鲟; STE: 闪光鲟; NAC: 纳氏鲟; RUT: 小体鲟; SCH: 施氏鲟; HUS: 欧洲鳇; DAU: 达氏鳇; TRA: 高首鲟; FUL: 富氏鲟; SIN: 中华鲟; PER: 波斯鲟。

正文中引用本图/表的段落

在明确贸易中杂交鲟种类的基础上, 通过分析现有鉴定方法的应用条件和鉴定范围, 探讨不同方法的整合在不同应用情景下进行鲟鱼鉴定的可行性。目前已开发出SNP引物的11种鲟鱼包含了杂交鲟亲本种类, 且引物在12种鲟鱼中存在跨物种扩增检测(图1), 故本文以11种鲟鱼及其杂交鲟为研究范围进行方法整合。在现有SNP引物中(附录1), ST、T、H、SI、F、N分别为闪光鲟、高首鲟、欧洲鳇、中华鲟、富氏鲟、纳氏鲟的特异性引物, 可分别从11种鲟鱼中准确鉴定出对应种类(Boscari et al, 2014, 2017); 在引物SI、F和N排除中华鲟、富氏鲟和纳氏鲟的情况下, 通过引物R可准确鉴定出小体鲟(Havelka et al, 2017)。引物SD为施氏鲟和达氏鳇共用引物, 仅可从11种鲟鱼中将种类范围缩小至此两种鲟鱼(Boscari et al, 2014), 再以微卫星引物Ls19和SX226 (孔杰等, 2020)鉴别施氏鲟和达氏 鳇。引物G不仅是西伯利亚鲟和俄罗斯鲟的共用引物, 也可在部分波斯鲟中扩增出目的条带(Havelka et al, 2019), 但无法在其他鲟鱼中扩增出目的条带, 故该引物大概率可将种类范围缩小至此3种鲟鱼。即核DNA遗传分析(SNP分析和微卫星DNA分析相结合)可在11种鲟鱼及其可能的杂交鲟范围内鉴定样品亲本种类, 但无法区分亲本雌雄性。故本文再以mtDNA遗传分析鉴定样品母本种类, 以区分亲本雌雄性, 进而准确鉴定鲟鱼种类(图2)。

当前贸易中共有36种鲟鱼, 其中杂交鲟14种。杂交鲟亲本共涉及9种鲟鱼(以下简称9种鲟鱼) (图1), 包括俄罗斯鲟、西伯利亚鲟、闪光鲟、纳氏鲟、小体鲟、施氏鲟、欧洲鳇、达氏鳇和高首鲟。西伯利亚鲟和俄罗斯鲟是杂交鲟最常见的亲本物种, 共有8种杂交鲟的亲本涉及此两个物种(表1)。由于CITES数据库未标注杂交鲟亲本的雌雄性, 本文默认其可能存在正交和反交两种杂交类型。

本文的其它图/表

• 图2 鲟鱼鉴定方法及应用情景。f、m可为同一种鲟鱼, 引物ST、T、H、SI、F、N、SD无使用先后顺序; 图中物种缩写全称见图1。
  
• 表1 贸易鲟鱼种类及鉴定可行性
  
• 图3 11种纯种鲟鱼及其可能的杂交鲟种类鉴定结果。可能有*指CITES贸易数据库中仅标注杂交鲟双亲种类, 未标注雌雄性, 故不确定实际贸易中杂交鲟的母本是哪一个。图中物种缩写全称见图1。