生物多样性 ›› 2007, Vol. 15 ›› Issue (4): 432-436. DOI: 10.1360/biodiv.070111
饶友生1, 2 ,聂庆华1 ,梁勇1,杜颖军1,阎文龙1,张细权1*
Yousheng Rao1, 2, Qinghua Nie1, Yong Liang1, Yingjun Du1,Wenlong Yan1, Xiquan Zhang1*
摘要: 本研究旨在探讨鸡功能基因5′-侧翼区的单核苷酸多态性(SNP)水平。作者以白来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料, 扩增了GH、DDBC1、RIKEN、RASGRP3、IGF1、THRSP、VIP及PRL共8个基因的5′-侧翼区DNA序列。扩增序列全长为8,399 bp, SNP的总数为161个, 平均每52 bp出现一个SNP。8个功能基因5′-侧翼区核苷酸多样性的θ均值和π均值分别为0.00620±0.00110和0.00559±0.00100。比较检验表明, 5′-侧翼区的SNP多样性显著低于内含子区域。5′-侧翼区是基因表达的一个重要调控区域, 在分子进化和系统发生过程中承受着比内含子区域更大的选择压, 其较低的SNP多样性是适应性较好的表现。Tajima检验与Fu和Li检验表明, 与鸡繁殖性状显著关联的VIP基因和PRL基因很可能是人工选择或自然选择的目的基因。