根据2017年度中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）统计结果, 《生物多样性》荣获2017年“百种中国杰出学术期刊”称号。

      中国科学技术信息研究所每年定期出版《中国科技期刊引证报告》, 公布“中国科技论文引文数据库”(CSTPCD)收录的中国科技论文统计源期刊的多项科学计量指标。从1999年开始, 中国科学技术信息研究所就开始以这些指标为基础, 研制发布了“中国科技期刊综合评价指标体系”, 采用层次分析法, 由专家打分确定了重要指标的权重, 并分学科对每种期刊进行了综合评定。并且从2002年开始应用于“百种中国杰出学术期刊”的评价中。2002年公布了第一届名单。自此之后, 连续每年公布。

      《生物多样性》分别入选2006年度、2007年度、2008年度、2009年度、2011年度、2012年度、2013年度、2015年度、2016年度、2017年度中国百种杰出学术期刊。