世界上已知维管植物有多少种? 基于多个全球植物数据库的整合
How many known vascular plant species are there in the world? An integration of multiple global plant databases
通讯作者: *E-mail:hqian@museum.state.il.us,hong.qian@illinoisstatemuseum.org
编委: 高连明
责任编辑: 周玉荣
收稿日期: 2022-05-10 接受日期: 2022-06-28
Corresponding authors: *E-mail:hqian@museum.state.il.us,hong.qian@illinoisstatemuseum.org
Received: 2022-05-10 Accepted: 2022-06-28
维管植物是地球上生物多样性的重要组成部分, 拥有超过200年的研究历史。然而, 世界上有多少种维管植物, 其中有多少种已被发现和描述等问题迄今仍未很好回答。本文整合分析了全球4个主要植物数据库, 以期回答全球已发现和描述了多少物种的问题。结果表明, 全球已发现和描述的维管植物有376,366种(包括自然杂交种)。排除自然杂交种后, 全球共包含369,054种维管植物, 其中广义蕨类植物13,810种, 裸子植物1,172种, 被子植物354,072种。我们的结果比已有的4个数据库中的任何一个的物种数都至少要多17,700种。
关键词:
Aims: Despite that vascular plants constitute an important component of overall global biodiversity and have been studied well over two centuries, the questions of “How many species of vascular plants are there in the world and how many of them have been discovered and described?” remain open. Here, we address the second of the two questions.
Method: We synthesized four global plant databases.
Results & Conclusions: Our study shows that for the entire global flora of vascular plants (including natural hybrids), 376,366 species have been discovered and validly described. When natural hybrids are excluded, the global flora includes 369,054 species of vascular plant species, of which pteridophytes (ferns and lycophytes), gymnosperms and angiosperms have 13,810, 1,172 and 354,072 species, respectively. The number of vascular plant species derived from our study is larger than any of the other four databases by at least 17,700 species.
Keywords:
本文引用格式
钱宏, 张健, 赵静超 (2022)
Hong Qian, Jian Zhang, Jingchao Zhao (2022)
维管植物包括广义蕨类(包括石松植物和狭义蕨类植物)、裸子植物和被子植物, 是生物多样性的重要组成部分(Borsch et al, 2020)。维管植物的重要性不仅在于其多样性本身, 也在于它们能够影响许多其他类群的多样性(Pimm & Joppa, 2015)。自林奈以来, 维管植物已有两百多年的研究历史, 但世界上究竟有多少种? 其中有多少已被发现并描述? 这两个问题仍未很好地解决。基于统计模型或特定分类群(如科级水平), 不少研究已对全球维管植物物种的数量进行过估计,结果差异巨大, 从不足25万到超过40万不等, 大部分估计在30万至40万之间。例如Christenhusz和Byng (2016)报道全球维管植物物种数为308,312种, 而Pimm和Joppa (2015)的报道为390,923种, 数量上至少有8万种的差距。
准确确定全球已发现和描述的维管植物物种数需要一个包含已发表的所有维管植物名称及其异名(synonyms)与接受名(accepted names)之间的对应关系的名录。The Plant List (TPL; version 1.0, 2010; version 1.1, 2013;
在过去的10年, 以TPL为主要基础, 新开发了5个全球植物数据库: World Flora Online (WFO;
本文旨在整合WFO、POWO、LCVP和WP等4个主要全球植物数据库中的信息, 确定世界上已知维管植物种数。本研究中我们未考虑TPL和WCVP两个数据库, 因为TPL是WFO的前身, 而WCVP和POWO都是由英国皇家植物园邱园建立, 且POWO包含了WCVP中的植物名。由于这4个主要的全球植物数据库中已涵盖了非常全面的、有关全球植物的信息(Freiberg et al, 2020), 本研究也未考虑其他维管植物特定类群的全球和区域植物数据库。
1 研究方法
LCVP数据库来自Freiberg等(2020)的LCVP名录, WFO、POWO和WP在各自网站中查询获得(访问时间为2021年2月)。采取以下步骤匹配每对数据库之间的植物名称: (1)通过拉丁名及其命名人名的组合进行匹配; (2)对于第一步中未匹配上的名称, 先基于拉丁名进行匹配, 然后人工核实每一个命名人名是否与拉丁名匹配; (3)使用各种R语言软件包中的模糊匹配算法: Taxonstand (Cayuela et al, 2012)、WorldFlora (Kindt, 2020)、lcvplants (Freiberg et al, 2020)或在线名称匹配应用程序(如: Taxonomic Name Resolution Service,
在上述步骤中, 我们也通过对拉丁名和命名人名的微小修改来执行进一步匹配。例如, 对于在使用原始拉丁名和命名人名进行初始匹配过程中未匹配到的名称, 采取以下措施进行进一步匹配: (a)去掉拉丁名中的栽培种符号“×”和连字符“-”, 并将“ae”、“ai”、“ei”、“yi”和“ii”替换为“i”; (b)删除命名人名中的点和空格, 并将“fil.”替换为“f.”; (c)将原拉丁名和命名人名中的所有字母都改成对应的小写字母。在上述每个匹配过程中都会对匹配上的名称进行人工检查。这种多步骤的过程可以最大限度地匹配不同数据库间的名称。
本工作将LCVP数据库作为名称的主体。对于一个指定的接受名, 如在一个或多个名称中, 由于拼写错误(或变体)而出现重复, 仅保留拼写正确的那个。对于在POWO、WFO和WP中被定为接受名的, 如果它们及其异名没有任何一个作为接受名包括在LCVP中, 将它们定为在LCVP之外的接受名。通过以下方法将每个物种归于一个目中: 广义蕨类植物使用PPG I (Pteridophyte Phylogeny Group I)分类系统(Schuettpelz et al, 2016), 裸子植物使用密苏里植物园数据库(
2 结果
全球已发现并描述的维管植物有376,366种(包括自然杂交种; 表1; 本文中的物种数目统计均不包含种下等级类群), 其中广义蕨类14,307种, 种子植物362,059种。种子植物中有1,217种裸子植物和360,842种被子植物。排除自然杂交种后, 全球已发现和描述的维管植物有369,054种, 其中广义蕨类13,810种, 裸子植物1,172种, 被子植物354,072种。
表1 全球各维管植物目所包括的物种数
Table 1
目 Order | 物种数量 Number of species | 目 Order | 物种数量 Number of species | ||
---|---|---|---|---|---|
包括杂交种 Incl. hybrid | 排除杂交种 Excl. hybrid | 包括杂交种 Incl. hybrid | 排除杂交种 Excl. hybrid | ||
蕨类植物 Pteridophyte | 缨子木目 Crossosomatales | 77 | 77 | ||
桫椤目 Cyatheales | 793 | 782 | 葫芦目 Cucurbitales | 3,232 | 3,215 |
木贼目 Equisetales | 45 | 35 | 五桠果目 Dilleniales | 567 | 567 |
里白目 Gleicheniales | 177 | 173 | 薯蓣目 Dioscoreales | 909 | 907 |
膜蕨目 Hymenophyllales | 637 | 634 | 川续断目 Dipsacales | 1,471 | 1,432 |
水韭目 Isoetales | 208 | 203 | 杜鹃花目 Ericales | 14,638 | 14,445 |
石松目 Lycopodiales | 522 | 513 | 南鼠刺目 Escalloniales | 154 | 147 |
合囊蕨目 Marattiales | 151 | 151 | 豆目 Fabales | 26,412 | 26,301 |
瓶尔小草目 Ophioglossales | 132 | 128 | 壳斗目 Fagales | 1,670 | 1,435 |
紫萁目 Osmundales | 26 | 24 | 丝缨花目 Garryales | 27 | 27 |
水龙骨目 Polypodiales | 10,560 | 10,123 | 龙胆目 Gentianales | 23,687 | 23,600 |
松叶蕨目 Psilotales | 19 | 19 | 牻牛儿苗目 Geraniales | 953 | 934 |
槐叶蘋目 Salviniales | 82 | 81 | 大叶草目 Gunnerales | 67 | 66 |
莎草蕨目 Schizaeales | 224 | 213 | 腺椒树目 Huerteales | 30 | 30 |
卷柏目 Selaginellales | 731 | 731 | 茶茱萸目 Icacinales | 187 | 187 |
裸子植物 Gymnosperm | 唇形目 Lamiales | 29,365 | 28,447 | ||
柏目 Cupressales | 458 | 441 | 樟目 Laurales | 3,955 | 3,954 |
苏铁目 Cycadales | 376 | 375 | 百合目 Liliales | 1,897 | 1,876 |
银杏目 Ginkgoales | 1 | 1 | 木兰目 Magnoliales | 3,565 | 3,542 |
买麻藤目 Gnetales | 120 | 117 | 金虎尾目 Malpighiales | 20,197 | 19,749 |
松目 Pinales | 262 | 238 | 锦葵目 Malvales | 7,770 | 7,605 |
被子植物 Angiosperm | 水螅花目 Metteniusales | 66 | 66 | ||
菖蒲目 Acorales | 2 | 2 | 桃金娘目 Myrtales | 15,400 | 15,203 |
泽泻目 Alismatales | 4,832 | 4,729 | 睡莲目 Nymphaeales | 109 | 101 |
无油樟目 Amborellales | 1 | 1 | 酢浆草目 Oxalidales | 2,164 | 2,160 |
伞形目 Apiales | 6,400 | 6,377 | 露兜树目 Pandanales | 1,699 | 1,698 |
冬青目 Aquifoliales | 770 | 766 | 盔被花目 Paracryphiales | 42 | 42 |
棕榈目 Arecales | 2,814 | 2,784 | 无叶莲目 Petrosaviales | 4 | 4 |
天门冬目 Asparagales | 42,236 | 40,736 | 苦榄木目 Picramniales | 57 | 57 |
菊目 Asterales | 41,868 | 41,459 | 胡椒目 Piperales | 4,512 | 4,512 |
木兰藤目 Austrobaileyales | 91 | 91 | 禾本目 Poales | 25,379 | 24,667 |
红珊藤目 Berberidopsidales | 4 | 4 | 山龙眼目 Proteales | 2,085 | 2,080 |
紫草目 Boraginales | 3,711 | 3,674 | 毛茛目 Ranunculales | 6,328 | 6,207 |
十字花目 Brassicales | 5,502 | 5,393 | 蔷薇目 Rosales | 11,985 | 11,428 |
绒球花目 Bruniales | 90 | 90 | 檀香目 Santalales | 2,636 | 2,632 |
黄杨目 Buxales | 135 | 135 | 无患子目 Sapindales | 7,071 | 7,036 |
白樟目 Canellales | 129 | 129 | 虎耳草目 Saxifragales | 3,359 | 3,134 |
石竹目 Caryophyllales | 15,362 | 15,020 | 茄目 Solanales | 5,493 | 5,469 |
卫矛目 Celastrales | 1,437 | 1,437 | 昆栏树目 Trochodendrales | 2 | 2 |
金鱼藻目 Ceratophyllales | 7 | 7 | 黄漆姑目 Vahliales | 5 | 5 |
金粟兰目 Chloranthales | 75 | 75 | 葡萄目 Vitales | 1,105 | 1,101 |
鸭跖草目 Commelinales | 959 | 956 | 姜目 Zingiberales | 2,999 | 2,986 |
山茱萸目 Cornales | 744 | 731 | 蒺藜目 Zygophyllales | 343 | 343 |
对所有维管植物目水平进行已描述和接受的物种统计后发现(表1), 物种数最多的5个目是天门冬目(含杂交种为42,236种, 排除杂交种为40,736种)、菊目(41,868种和41,459种)、唇形目(29,365种和28,447种)、豆目(26,412种和26,301种)和禾本目(25,379种和24,667种)。
3 讨论
本文旨在解决一个长期存在争议但极为重要的问题, 即世界上有多少种已知维管植物? 由于许多植物名称是异名(即同一植物有很多不同的名称), 且许多异名与它们的接受名之间的关系很难确定, 因此回答这一问题并非易事。据统计, 平均每个维管植物有2.7个学名(Kew, 2016)。当同种植物被不同学者在不同时期命名了不同学名时, 一个物种有一个以上学名的情况就会出现。然而, 相比于其他全球植物数据库, 本研究中使用的主干数据库LCVP中未解决的植物名称数量相对较少, 如: LCVP数据库有5%未解决, 而TPL数据库有21%未解决(Freiberg et al, 2020)。本文通过综合4个数据库中的信息, 梳理了它们之间错综复杂的关系, 因此与之前基于统计模型的估计(Paton et al, 2008; Pimm & Joppa, 2015; Lughadha et al, 2016)或单一物种名录(Freiberg et al, 2020)相比, 提供了目前已知的全球维管植物物种数的最准确估计(包括杂交种共376,366种, 不包括杂交种共369,054种)。相比于LCVP (351,180个维管植物接受种) (Freiberg et al, 2020)、WP (351,263个接受种) (
本研究整理出的LCVP数据库以外的大多数物种源自POWO和WP数据库。Freiberg等(2020)在其附录1中指出LCVP使用了POWO数据。虽然他们没有将WP列为LCVP的直接源数据库, 但确实提到使用了WP和Catalogue of Life数据库。值得注意的是: 为什么LCVP遗漏了那么多在POWO和WP中可获取的植物名? 其中一个原因可能是使用了过时的POWO和WP版本。Freiberg等(2020)表明LCVP中使用的POWO数据于2018年11月从Kew获得, 仅包含约793,000个植物名称(~335,000个接受名, ~458,000个被标记为异名)。而本文使用的POWO数据库版本包含了约110万个植物名, 比用来构建LCVP的POWO数据库的版本多了约30万个名称。Freiberg等(2020)用来构建LCVP的WP数据库版本是由Hassler (2019)为Catalogue of Life生成的, 因此这个版本相较于本研究中使用的版本而言已经过时。
LCVP数据库约有63,000个植物名称为“未解决”状态。其中, 60,710个是种等级上的植物名称。然而, 约有14,500个名称在POWO和/或WP中被确定为接受名或异名。在本研究中, 未解决名称的比例从LCVP的5%下降到3.7%。尽管LCVP中有一些仍未解决名称将来可能成为接受名, 但我们支持Freiberg等(2020)的观点, 认为这些未解决名称中的多数仍可能是异名。
本文的英文版参见网站
参考文献
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The lack of comprehensive and standardized taxonomic reference information is an impediment for robust plant research, e.g. in systematics, biogeography or macroecology. Here we provide an updated and much improved reference list of 1,315,562 scientific names for all described vascular plant species globally. The Leipzig Catalogue of Vascular Plants (LCVP; version 1.0.3) contains 351,180 accepted species names (plus 6,160 natural hybrids), within 13,460 genera, 564 families and 84 orders. The LCVP a) contains more information on the taxonomic status of global plant names than any other similar resource, and b) significantly improves the reliability of our knowledge by e.g. resolving the taxonomic status of ~181,000 names compared to The Plant List, the up to date most commonly used plant name resource. We used ~4,500 publications, existing relevant databases and available studies on molecular phylogenetics to construct a robust reference backbone. For easy access and integration into automated data processing pipelines, we provide an 'R'-package (lcvplants) with the LCVP.
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The State of the World’s Plants Report 2016
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