深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 )。国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可。SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 )。
MaxEnt模型是以最大熵原理(principle of maximum entropy)为理论支撑的机器学习模型(Phillips et al, 2006 ), 基于已有的、数量有限的物种分布点数据以及分布点对应的环境条件, 构成未知分布的约束条件, 建立物种地理分布与环境因子间的联系, 通过特定算法找出物种分布规律的最大熵, 进行未知区域的物种分布概率预测(分布的适宜程度) (Phillips et al, 2004 )。自Phillips (2006) 等首次引入MaxEnt模型预测物种潜在分布之后, 它已成为生态学研究的热点工具。
近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 )。尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 )。MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少。
鉴于此, 本研究以红色木莲(Manglietia insignis )为研究对象, 以三江并流、云南省和全国的行政范围为基础构建3个尺度的建模区域, 分别建立MaxEnt模型, 开展以下三方面的研究: (1)检验红色木莲MaxEnt模型在3个尺度下预测精度的稳定性; (2)分析不同尺度下红色木莲分布概率的空间格局变化; (3)研究基于MaxEnt模型建立的红色木莲物种-环境关系的尺度效应, 旨在探讨红色木莲的潜在分布预测对建模尺度变化的响应, 为MaxEnt模型的更好应用提供理论支持。
1 材料与方法
1.1 研究对象与尺度设置
1.1.1 研究对象概况
红色木莲是木兰科木莲属(Manglietia )常绿乔木, 为IUCN红色名录无危等级(Least Concern, LC)物种, 《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》中列为易危(VU)物种(http://www.zhb.gov.cn/gkml/ hbb/bgg/201309/W020130917614244055331.pdf)。红色木莲生长于海拔1,700-2,500 m的常绿阔叶林或常绿落叶阔叶混交林中, 喜温凉湿润气候。其分布范围广阔, 涵盖了我国湖北、湖南、福建、广西、四川、贵州、云南和西藏等8个省份, 尼泊尔、印度和缅甸等国也有分布(中国科学院昆明植物研究所, 2006 ; 董学芬, 2017 )。
1.1.2 尺度设置
本研究最小尺度是三江并流尺度, 参照联合国教科文组织世界遗产委员会批准的云南三江并流世界自然遗产地确定范围, 包括了丽江市、迪庆藏族自治州和怒江傈僳族自治州所涵盖的8个市县的行政范围(http://whc.unesco.org/en/list/1083)。该区域位于全球生物多样性热点地区——西南山地的核心地带, 其内的云南三江并流保护区符合世界自然遗产地全部入选标准, 具有突出普遍价值(outstanding universal value)。中间尺度为云南省, 位于我国的西南边陲, 是我国生物多样性最为丰富的省份之一。最大尺度为全国尺度。尺度设置详见表1 。
基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围。红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 )。本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 )。
图1 3个空间尺度的建模区域与红色木莲分布位点
Fig. 1 Modeling areas of three spatial scales and distribution sites of Manglietia insignis
1.2 研究方法
1.2.1 数据收集与处理
仅采用红色木莲的自然分布位点数据, 主要来源于: 中国数字植物标本馆(http://www.cvh.org.cn/)的标本记录; 全球生物多样性信息网络(GBIF, https://www.gbif.org/)的分布记录; 学术论文、科考报告、专著等相关文献资料中红色木莲的地理分布信息。剔除精度不足的地理分布位点后, 全国范围内共得到88个有效位点, 涵盖了湖南、广西、四川、贵州、云南、西藏等红色木莲在我国的主要分布区, 其中三江并流、云南省尺度分别包含19个和67个分布位点。按照模型软件MaxEnt 3.3.3k (http://www.cs.princeton. edu/schapire/Maxent/)要求, 分别生成csv格式的输入文件。
气候与地形因子是植物群落形成与发展过程中极为重要的环境因子(陈飞等, 2012 )。本研究将19个生物气候因子与3个地形因子作为环境因子, 各环境因子数据描述及来源等信息详见附录1。由于环境因子数据的来源不一, 其尺度范围、坐标信息、栅格分辨率等属性信息各不相同, 为保证MaxEnt模型顺利运行, 基于ArcGIS 10.2对22个环境因子图层进行预处理: 统一地理坐标系至WGS 1984; 数据的栅格分辨率重采样至30 (约为1 km); 分别提取三江并流、云南省与全国3个尺度建模区域的环境因子图层。
为消除环境因子多重共线性对建模的不利影响(Nüchel et al, 2018 ), 利用R 3.4.3的psych包分别对3个尺度下建模区域的生物气候因子与地形因子数据进行Pearson相关性分析, 筛选出相关系数低于0.7的环境因子(Manhães et al, 2018 )。三江并流尺度参与建模的环境因子为: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp)。云南省尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、年均降水量(b12)、最干月降水量(b14)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp)。全国尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、年均温度变化范围(b7)、年均降水量(b12)、最暖季度降水量(b18)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp)。将环境因子数据转化为ASCII格式, 作为MaxEnt 3.3.3k中环境图层(environmental layers)的输入文件。
1.2.2 数据分析
在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数。根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值。模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格。
使用受试者工作曲线(receiver operating characteristic, ROC)与遗漏率(omission rate, OR)检验MaxEnt模型预测精度, 并通过比较3个空间尺度下MaxEnt的ROC曲线下面积(area under the curve, AUC)与OR值评估模型预测精度的稳定性(Phillips et al, 2006 )。AUC值在0-1之间, 值越大, 模型预测精度越高, 一般认为AUC值 > 0.7时, MaxEnt模型的预测结果便为可信(Raes & Steege, 2007 ); OR值越小MaxEnt预测精度越高(Phillips et al, 2006 )。
基于三江并流尺度的建模区域分析各尺度下红色木莲适生区的空间格局, 主要从两个方面进行研究: (1)分布概率的空间一致性分析。为了深入揭示分布概率的空间格局对尺度选择的响应规律, 本研究基于ArcGIS 10.2对MaxEnt模型输出的概率值信息进行符号化展示, 并使用优化热点分析工具(optimized hot spot analysis)进一步对MaxEnt模型输出的分布概率进行归一化处理, 识别并分析3个尺度下红色木莲概率分布的热点区域。(2)潜在适宜分布区域质心位置分析。本研究使用分区统计工具Zonal分别计算3个空间尺度下潜在适宜分布区域的几何质心(centroid), 通过质心位置的变化表征红色木莲空间分布的变迁(唐继洪等, 2017 )。综合分布概率的空间一致性与质心位置的分析结果, 判断不同空间尺度下红色木莲适生区的空间格局变化。
本研究采用刀切法(Jackknife)检验环境因子贡献率(胡秀等, 2014 ), 基于此识别影响红色木莲空间分布的主导环境因子。本研究选择贡献率大于20%的环境因子作为主导环境因子, 进一步比较3个空间尺度下主导环境因子的异同, 分析MaxEnt模型建立的物种-环境关系的尺度效应。
2 结果
2.1 MaxEnt模型预测精度
MaxEnt模型重复运行20次后得到的ROC曲线如图2 所示, 三江并流、云南省和全国3个空间尺度下的AUC平均值分别为0.936 ± 0.015、0.887 ± 0.010和0.930 ± 0.014; 各尺度的OR值分别为0.18 ± 0.092、0.15 ± 0.035和0.20 ± 0.045。AUC值与OR值的检验结果都表明各尺度建立的MaxEnt模型都有良好的预测效果。
图2 3个空间尺度的受试者工作曲线与曲线下面积
Fig. 2 Receiver operating characteristic curve of three spatial scales and area under the curve (AUC)
2.2 红色木莲适生区空间格局
如图3 所示, 3个尺度下红色木莲适宜性概率的分布趋势基本一致, 高值概率都集中在独龙江、怒江、澜沧江3个流域。3个空间尺度下的热点区域(极显著热点区域+显著热点区域+热点区域)集中分布趋势更加明显(图4 )。从行政区域上看, 除兰坪白族普米族自治县外, 三者热点区域的空间分布格局保持高度一致。从3个潜在适宜分布区域的质心位置来看(图3 ), 不同尺度下的几何质心都分布在怒江流域周围, 通过ArcGIS 10.2的点距离(point distance)分析工具可得, 三江并流尺度质心到云南、全国尺度质心的距离分别为15.59 km和31.95 km, 云南尺度质心到全国尺度质心的距离为17.01 km, 与研究区域(三江并流4.5万km2 , 云南省39万km2 )相比, 3个尺度质心在空间位置上分布集中, 可视为无地带性转移。
图3 3个空间尺度下红色木莲的潜在适宜性及其质心分布
Fig. 3 Potential suitable distributions and its centroids of Manglietia insignis under three spatial scales
图4 3个空间尺度下红色木莲分布概率的优化热点分析
Fig. 4 Optimized hot spot analysis of probability distribution of Manglietia insignis under three spatial scales
2.3 环境因子贡献率
3个空间尺度下环境因子贡献率的检验结果如表2 、图5 。三江并流尺度下, 海拔(39.4%)和坡向(22.1%)是影响红色木莲地理分布的主导因子; 云南省尺度下, 年均降水量(35.5%)是影响红色木莲地理分布的主导因子; 全国尺度下, 昼夜温差月均值(24.8%)和年均温度变化范围(21.7%)是影响红色木莲地理分布的主导因子。
图5 三江并流尺度(A)、云南省尺度(B)与全国尺度(C)下环境因子正规化训练增益值的刀切法评估
Fig. 5 Results of Jackknife evaluation of the environmental variables with respect to regularized training gain for Three Parallel Rivers scale (A), Yunnan Province scale (B), and country scale (C)
3 讨论
本研究基于有效的地理分布位点, 构建三江并流、云南省与全国尺度下红色木莲的建模区域, 并通过相关性检验筛选出各尺度下参与建模的环境因子数据, 在3个空间尺度下建立了红色木莲的MaxEnt模型, 探索红色木莲的潜在分布预测对空间尺度的响应情况。综合模型预测精度评估与空间分布格局分析, 红色木莲的MaxEnt模型在不同空间尺度下有着稳定的性能表现。一定数量与质量的物种地理分布位点是构建高预测精度MaxEnt模型的基础(陈新美, 2012 ), 但在实际研究中常常面临分布位点数据缺乏的问题, 导致无法建立生态位完整的MaxEnt模型, 预测结果可能会过低估计物种的适生区分布范围。空间尺度的扩大意味着可以获取更多的物种信息, 为建立系统全面的物种-环境关系提供更为丰富的环境信息。本研究结果表明更大尺度(云南省和全国尺度)的MaxEnt模型同样可以有效预测物种在局部地区(三江并流尺度)的适生区分布, 通过空间尺度的转换解决基础数据收集困难的问题, 为MaxEnt模型在不同空间尺度的应用提供了新思路。
3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异。通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 )。红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白。考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种。因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中。
不确定性是影响决策的重要因素(Myers, 1990 ), 空间尺度作为不确定性因素对MaxEnt模型进一步的应用与发展有明显的限制作用。本研究尝试使用热点分析的方法将MaxEnt模型输出结果进行处理, 探究热点分析在预测物种适生区方面的作用。结果显示, 热点区域(图4 )比MaxEnt模型的直接预测结果(图3 )更加清晰地呈现了红色木莲的适生区空间格局, 并且不同尺度间的一致性更加明显, 可见热点分析在很大程度上能消除空间尺度给MaxEnt模型带来的不确定性影响。最小存活种群理论表明物种以一定概率存活下去需要基于有效种群大小、最小存活面积等条件, 可见破碎化生境不利于物种的长期生存。热点分析可以有效探测研究区域内具有显著统计学意义的局部热点区域(Getis & Ord, 1992 ; Ord & Getis, 1995 ), 除关注分布概率的高低, 更加强调地理单元间的位置关系, 大大削弱了红色木莲适生区分布的破碎化程度, 更能反映其真实分布状态, 并且边界成本的降低对保护资源的高效利用与自然保护地的合理布局具有重要意义。我们相信综合MaxEnt模型的预测功能与热点分析的聚类优化将十分有益于物种地理分布的科学研究与保护规划的开展。
环境因子贡献率的刀切法检验结果表明, 不同空间尺度下红色木莲的地理分布受不同的环境因子所影响, 地形因子在较小空间尺度内(三江并流尺度)有重要影响, 而转移到较大空间尺度下(云南省与全国尺度)其作用则不显著。海拔梯度反映了温度和湿度等环境因子的综合效应, 对山地物种分布规律的研究具有重要意义(唐志尧和方精云, 2004 )。三江并流区域位于西南山地, 海拔分布从760 m (怒江河谷)到6,740 m (卡瓦格博峰), 狭小地域内的巨大高差使该区域内的物种分布对海拔梯度变化十分敏感, 这也是海拔和坡向等地形因子主导该尺度下红色木莲分布的重要原因。随着空间尺度的扩大, 除海拔等地形因子信息外, 其他环境因子信息也丰富起来, 且红色木莲分布位点的数量增多, 为MaxEnt模型的建立提供了更多的约束条件, 年均降水量、昼夜温差月均值和年均温度变化范围等生物气候因子对红色木莲分布的影响突显出来。由此可见, 红色木莲的空间分布格局存在着尺度依赖效应, 特定尺度下的空间格局可能存在特定主导因子(Wiegand et al, 2007 ), 因此在挑选参与建模的环境因子时应充分考虑空间尺度对物种分布的影响。
物种的地理分布是不均匀的(赵淑清等, 2000 ), 弄清区域内物种资源的分布现状是实施精细化保护的关键。根据本研究结果, 红色木莲在兰坪白族普米族自治县和维西傈僳族自治县均有大面积分布, 但这两个区域却鲜有此种的分布记录(表1 )。可能有两方面原因导致记录的缺失: 一是三江并流区域内环境异质性极大, 沟谷纵横与气候多变的环境条件让基础性研究工作的开展十分困难; 二是三江并流区域内的保护资源与人员有限, 物种资源调查工作仅针对重点保护物种, 无法全面铺开。本研究表明, 基于MaxEnt模型通过扩大空间尺度的方法可以有效克服基础性研究工作不足, 并且得到的预测结果可以为下一步的野外调查研究提供新样地, 实现模型预测与实地调查工作的良性循环。三江并流区域是世界生物多样性热点区域, 如果等数据收集充分再开展精细化保护, 很多物种可能已经灭绝(Sierra et al, 2002 ), 因此我们建议基于已有的物种信息利用MaxEnt模型等相关方法预测三江并流区域内更多物种的地理分布, 随后结合实地考察逐步掀开该区域生物多样性的神秘面纱, 使三江并流区域生物多样性的精细化保护在不断探索与实践中得到完善。
附录 Supplementary Material
附录1 19个生物气候因子与3个地形因子的数据概况
Appendix 1 Data profiles of 19 bioclimatic variables and 3 terrain variables
http://www.biodiversity-science.net/fileup/PDF/2018059-1.pdf
作者声明没有竞争性利益冲突.
参考文献
文献选项
[1]
Ahmed SE , McInerny G , O’Hara K , Harper R , Salido L , Emmott S , Joppa LN (2015 ) Scientists and software—surveying the species distribution modelling community
. Diversity and Distributions , 21 , 258 -267 .
[本文引用: 1]
[2]
Barbosa FG , Schneck F (2015 ) Characteristics of the top-cited papers in species distribution predictive models
. Ecological Modelling , 313 , 77 -83 .
[本文引用: 1]
[3]
Catherineh G , Jane E , Robertj H , Antoine G , Townsend PA , Bettea L (2008 ) The influence of spatial errors in species occurrence data used in distribution models
. Journal of Applied Ecology , 45 , 239 -247 .
[本文引用: 1]
[4]
Chai Y , Zhu H , Meng GT , Shi JP , Yang GB (2011 ) Population structure and distribution pattern of dominant tree species in ancient tea tree community in Ailao Mountains of Yunnan Province, China
. Forest Research , 24 , 277 -284 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[柴勇 , 朱华 , 孟广涛 , 施济普 , 杨国平 (2011 ) 云南哀牢山古茶树群落优势树种的种群结构与分布格局
. 林业科学研究 , 24 , 277 -284 .]
[本文引用: 1]
[5]
Chen F , Wang JM , Sun BG , Chen XM , Yang ZX , Duan ZY (2012 ) Relationships of plant species distribution in different strata of Pinus yunnanensis forest with landform and climatic factors
. Chinese Journal of Ecology , 31 , 1070 -1076 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[陈飞 , 王健敏 , 孙宝刚 , 陈晓鸣 , 杨子祥 , 段兆尧 (2012 ) 云南松林不同层植物分布与地形、气候因子的关系
. 生态学杂志 , 31 , 1070 -1076 .]
[本文引用: 1]
[6]
Chen XM , Lei YC , Zhang XQ , Jia HY (2012 ) Effects of sample sizes on accuracy and stability of maximum entropy model in predicting species distribution
. Scientia Silvae Sinicae , 48 (1 ), 53 -59 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 2]
[陈新美 , 雷渊才 , 张雄清 , 贾宏炎 (2012 ) 样本量对MaxEnt模型预测物种分布精度和稳定性的影响
. 林业科学 , 48 (1 ), 53 -59 .]
[本文引用: 2]
[7]
Dong XF (2017 ) Effect of topographic factors on the distribution of Manglietia insignis
. Journal of Anhui Agricultural Sciences , 45 (10 ), 162 -163 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[董学芬 (2017 ) 地形因素对红花木莲分布的影响
. 安徽农业科学 , 45 (10 ), 162 -163 .]
[本文引用: 1]
[8]
Elith J , Phillips SJ , Hastie T , Dudík M , Chee YE , Yates CJ (2011 ) A statistical explanation of MaxEnt for ecologists
. Diversity and Distributions , 17 , 43 -57 .
[本文引用: 2]
[9]
Escalante T , Rodríguez-Tapia G , Linaje M , Illoldi-Rangel P , González-López R (2013 ) Identification of areas of endemism from species distribution models: Threshold selection and Nearctic mammals
. Transaction Image Processing , 16 , 5 -17 .
[本文引用: 1]
[10]
Getis A , Ord JK (1992 ) The analysis of spatial association by use of distance statistics
. Geographical Analysis , 24 , 189 -206 .
[本文引用: 1]
[11]
Hu X , Wu FC , Guo W , Liu N (2014 ) Identification of potential cultivation region for Santalum album in China by the MaxEnt ecologic niche model
. Scientia Silvae Sinicae , 50 (5 ), 27 -33 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[胡秀 , 吴福川 , 郭微 , 刘念 (2014 ) 基于MaxEnt生态学模型的檀香在中国的潜在种植区预测
. 林业科学 , 50 (5 ), 27 -33 .]
[本文引用: 1]
[12]
Jiang ZG (1996 ) Hoarding behavior of animal and its ecological functions
. Chinese Journal of Zoology , (3 ), 47 -49 . (in Chinese)
[本文引用: 1]
[蒋志刚 (1996 ) 动物贮食行为及其生态意义
. 动物学杂志 , (3 ), 47 -49 .]
[本文引用: 1]
[13]
Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences (2006 ) Flora of Yunnan . Science Press , Beijing . (in Chinese)
[本文引用: 1]
[中国科学院昆明植物研究所 (2006 ) 云南植物志 . 科学出版社 , 北京 .]
[本文引用: 1]
[14]
Levin SA (1992 ) The problem of pattern and scale in ecology: The Robert H. MacArthur Award lecture
. Ecology , 73 , 1943 -1967 .
[本文引用: 1]
[15]
Li HJ , Zhang ZB (2001 ) Relationship between animals and plant regeneration by seed. II. Seed predation, dispersal and burial by animals and relationship between animals and seedling establishment
. Biodiversity Science , 9 , 25 -37 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[李宏俊 , 张知彬 (2001 ) 动物与植物种子更新的关系. II. 动物对种子的捕食、扩散、贮藏及与幼苗建成的关系
. 生物多样性 , 9 , 25 -37 .]
[本文引用: 1]
[16]
Lin YP , Deng D , Lin WC , Lemmens R , Crossman ND , Henle K , Schmeller DS (2015 ) Uncertainty analysis of crowd- sourced and professionally collected field data used in species distribution models of Taiwanese moths
. Biological Conservation , 181 , 102 -110 .
[本文引用: 1]
[17]
Manhães AP , Loyola R , Mazzochini GG , Ganade G , Oliveira-Filho AT , Carvalho AR (2018 ) Low-cost strategies for protecting ecosystem services and biodiversity
. Biological Conservation , 217 , 187 -194 .
[本文引用: 1]
[18]
Morales NS , Fernández IC , Bacagonzález V (2017 ) MaxEnt’s parameter configuration and small samples: Are we paying attention to recommendations?
A systematic review. PeerJ , 5 , e3093 .
[本文引用: 1]
[19]
Myers N (1990 ) The biodiversity challenge: Expanded hot-spots analysis
. Environmentalist , 10 , 243 -256 .
[本文引用: 1]
[20]
Nüchel J , Bøcher PK , Xiao W , Zhu AX , Svenning JC (2018 ) Snub-nosed monkeys (Rhinopithecus ): Potential distribution and its implication for conservation
. Biodiversity and Conservation , 27 , 1517 -1538 .
[本文引用: 1]
[21]
Ord JK , Getis A (1995 ) Local spatial autocorrelation statistics: Distributional issues and an application
. Geographical Analysis , 27 , 286 -306 .
[本文引用: 1]
[22]
Phillips SJ , Anderson RP , Schapire RE (2006 ) Maximum entropy modeling of species geographic distributions
. Ecological Modelling , 190 , 231 -259 .
[本文引用: 4]
[23]
Phillips SJ , Dudík M , Schapire RE (2004 ) A Maximum Entropy Approach to Species Distribution Modeling. p
. 83 . Association for Computing Machinery, Banff .
[本文引用: 1]
[24]
Raes N , Roos MC , Slik JWF , van Loon EE , ter Steege H (2009 ) Botanical richness and endemicity patterns of Borneo derived from species distribution models
. Ecography , 32 , 180 -192 .
[本文引用: 1]
[25]
Raes N , Steege HT (2007 ) A null-model for significance testing of presence-only species distribution models
. Ecography , 30 , 727 -736 .
[本文引用: 1]
[26]
Scott JM , Csuti B , Jacobi JD , Estes JE (1987 ) Species richness
. BioScience , 37 , 782 -788 .
[本文引用: 1]
[27]
Sierra R , Campos F , Chamberlin J (2002 ) Assessing biodiversity conservation priorities: Ecosystem risk and representativeness in continental Ecuador
. Landscape and Urban Planning , 59 , 95 -110 .
[本文引用: 1]
[28]
Song W , Kim E , Lee D , Lee M , Jeon SW (2013 ) The sensitivity of species distribution modeling to scale differences
. Ecological Modelling , 248 , 113 -118 .
[本文引用: 1]
[29]
Tang JH , Cheng YX , Luo LZ , Zhang L , Jiang XF (2017 ) MaxEnt-based prediction of overwintering areas of Loxostege sticticalis in China under different climate change scenarios
. Acta Ecologica Sinica , 37 , 4852 -4863 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[唐继洪 , 程云霞 , 罗礼智 , 张蕾 , 江幸福 (2017 ) 基于MaxEnt模型的不同气候变化情景下我国草地螟越冬区预测
. 生态学报 , 37 , 4852 -4863 .]
[本文引用: 1]
[30]
Tang ZY , Fang JY (2004 ) A review on the elevational patterns of plant species diversity
. Biodiversity Science , 12 , 20 -28 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[唐志尧 , 方精云 (2004 ) 植物物种多样性的垂直分布格局
. 生物多样性 , 12 , 20 -28 .]
[本文引用: 1]
[31]
Vaz ÚL , Cunha HF , Nabout JC (2015 ) Trends and biases in global scientific literature about ecological niche models
. Brazilian Journal of Biology , 75 (4 ), S17 -S24 .
[本文引用: 1]
[32]
Wang HL (2017 ) Protection and utilization of wild animals and plants in Lanping County
. Journal of Green Science and Technology , (3 ), 90 -91 . (in Chinese)
[本文引用: 1]
[汪海林 (2017 ) 兰坪县野生动植物保护与利用对策
. 绿色科技 , (3 ), 90 -91 .]
[本文引用: 1]
[33]
Wiegand T , Gunatilleke S , Gunatilleke N (2007 ) Species associations in a heterogeneous Sri Lankan dipterocarp forest
. The American Naturalist , 170 , E77 .
[本文引用: 1]
[34]
Yang GB (2011 ) Ecological quality assessment of Yunling Nature Reserve in Lanping County of Yunnan Province
. Journal of West China Forestry Science , 40 (4 ), 48 -53 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[杨国斌 (2011 ) 兰坪云岭省级自然保护区生态质量评价研究
. 西部林业科学 , 40 (4 ), 48 -53 .]
[本文引用: 1]
[35]
Yang GB (2013 ) Lanping Yunling Nature Reserve . Yunnan Science and Technology Press , Kunming . (in Chinese)
[本文引用: 1]
[杨国斌 (2013 ) 兰坪云岭自然保护区 . 云南科技出版社 , 昆明 .]
[本文引用: 1]
[36]
Zhang L (2015 a) Application of MaxEnt model in predicting the potential distribution of species
. Bulletin of Biology , 50 (11 ), 9 -12 . (in Chinese)
[本文引用: 1]
[张路 (2015 a) MaxEnt最大熵模型在预测物种潜在分布范围方面的应用
. 生物学通报 , 50 (11 ), 9 -12 .]
[本文引用: 1]
[37]
Zhang L (2015 b) Prediction of potential distribution area of Euphorbia dentata in China based on MaxEnt model
. Journal of Biosafety , 24 , 194 -200 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[张路 (2015 b) 基于MaxEnt模型预测齿裂大戟在中国的潜在分布区
. 生物安全学报 , 24 , 194 -200 .]
[本文引用: 1]
[38]
Zhao SQ , Fang JY , Lei GC (2000 ) Global 200: An approach to setting large-scale biodiversity conservation priorities
. Chinese Biodiversity , 8 , 435 -440 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[赵淑清 , 方精云 , 雷光春 (2000 ) 全球200: 确定大尺度生物多样性优先保护的一种方法
. 生物多样性 , 8 , 435 -440 .]
[本文引用: 1]
[39]
Zhu GP , Qiao HJ (2016 ) Effect of the MaxEnt model’s complexity on the prediction of species potential distributions
. Biodiversity Science , 24 , 1189 -1196 . (in Chinese with English abstract)
[本文引用: 1]
[朱耿平 , 乔慧捷 (2016 ) MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响
. 生物多样性 , 24 , 1189 -1196 .]
[本文引用: 1]
Scientists and software—surveying the species distribution modelling community
1
2015
... 深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 ).国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可.SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 ). ...
Characteristics of the top-cited papers in species distribution predictive models
1
2015
... 深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 ).国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可.SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 ). ...
The influence of spatial errors in species occurrence data used in distribution models
1
2008
... 深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 ).国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可.SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 ). ...
云南哀牢山古茶树群落优势树种的种群结构与分布格局
1
2011
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
云南哀牢山古茶树群落优势树种的种群结构与分布格局
1
2011
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
云南松林不同层植物分布与地形、气候因子的关系
1
2012
... 气候与地形因子是植物群落形成与发展过程中极为重要的环境因子(陈飞等, 2012 ).本研究将19个生物气候因子与3个地形因子作为环境因子, 各环境因子数据描述及来源等信息详见附录1.由于环境因子数据的来源不一, 其尺度范围、坐标信息、栅格分辨率等属性信息各不相同, 为保证MaxEnt模型顺利运行, 基于ArcGIS 10.2对22个环境因子图层进行预处理: 统一地理坐标系至WGS 1984; 数据的栅格分辨率重采样至30 (约为1 km); 分别提取三江并流、云南省与全国3个尺度建模区域的环境因子图层. ...
云南松林不同层植物分布与地形、气候因子的关系
1
2012
... 气候与地形因子是植物群落形成与发展过程中极为重要的环境因子(陈飞等, 2012 ).本研究将19个生物气候因子与3个地形因子作为环境因子, 各环境因子数据描述及来源等信息详见附录1.由于环境因子数据的来源不一, 其尺度范围、坐标信息、栅格分辨率等属性信息各不相同, 为保证MaxEnt模型顺利运行, 基于ArcGIS 10.2对22个环境因子图层进行预处理: 统一地理坐标系至WGS 1984; 数据的栅格分辨率重采样至30 (约为1 km); 分别提取三江并流、云南省与全国3个尺度建模区域的环境因子图层. ...
样本量对MaxEnt模型预测物种分布精度和稳定性的影响
2
2012
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
... 本研究基于有效的地理分布位点, 构建三江并流、云南省与全国尺度下红色木莲的建模区域, 并通过相关性检验筛选出各尺度下参与建模的环境因子数据, 在3个空间尺度下建立了红色木莲的MaxEnt模型, 探索红色木莲的潜在分布预测对空间尺度的响应情况.综合模型预测精度评估与空间分布格局分析, 红色木莲的MaxEnt模型在不同空间尺度下有着稳定的性能表现.一定数量与质量的物种地理分布位点是构建高预测精度MaxEnt模型的基础(陈新美, 2012 ), 但在实际研究中常常面临分布位点数据缺乏的问题, 导致无法建立生态位完整的MaxEnt模型, 预测结果可能会过低估计物种的适生区分布范围.空间尺度的扩大意味着可以获取更多的物种信息, 为建立系统全面的物种-环境关系提供更为丰富的环境信息.本研究结果表明更大尺度(云南省和全国尺度)的MaxEnt模型同样可以有效预测物种在局部地区(三江并流尺度)的适生区分布, 通过空间尺度的转换解决基础数据收集困难的问题, 为MaxEnt模型在不同空间尺度的应用提供了新思路. ...
样本量对MaxEnt模型预测物种分布精度和稳定性的影响
2
2012
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
... 本研究基于有效的地理分布位点, 构建三江并流、云南省与全国尺度下红色木莲的建模区域, 并通过相关性检验筛选出各尺度下参与建模的环境因子数据, 在3个空间尺度下建立了红色木莲的MaxEnt模型, 探索红色木莲的潜在分布预测对空间尺度的响应情况.综合模型预测精度评估与空间分布格局分析, 红色木莲的MaxEnt模型在不同空间尺度下有着稳定的性能表现.一定数量与质量的物种地理分布位点是构建高预测精度MaxEnt模型的基础(陈新美, 2012 ), 但在实际研究中常常面临分布位点数据缺乏的问题, 导致无法建立生态位完整的MaxEnt模型, 预测结果可能会过低估计物种的适生区分布范围.空间尺度的扩大意味着可以获取更多的物种信息, 为建立系统全面的物种-环境关系提供更为丰富的环境信息.本研究结果表明更大尺度(云南省和全国尺度)的MaxEnt模型同样可以有效预测物种在局部地区(三江并流尺度)的适生区分布, 通过空间尺度的转换解决基础数据收集困难的问题, 为MaxEnt模型在不同空间尺度的应用提供了新思路. ...
地形因素对红花木莲分布的影响
1
2017
... 红色木莲是木兰科木莲属(Manglietia )常绿乔木, 为IUCN红色名录无危等级(Least Concern, LC)物种, 《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》中列为易危(VU)物种(http://www.zhb.gov.cn/gkml/ hbb/bgg/201309/W020130917614244055331.pdf).红色木莲生长于海拔1,700-2,500 m的常绿阔叶林或常绿落叶阔叶混交林中, 喜温凉湿润气候.其分布范围广阔, 涵盖了我国湖北、湖南、福建、广西、四川、贵州、云南和西藏等8个省份, 尼泊尔、印度和缅甸等国也有分布(中国科学院昆明植物研究所, 2006 ; 董学芬, 2017 ). ...
地形因素对红花木莲分布的影响
1
2017
... 红色木莲是木兰科木莲属(Manglietia )常绿乔木, 为IUCN红色名录无危等级(Least Concern, LC)物种, 《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》中列为易危(VU)物种(http://www.zhb.gov.cn/gkml/ hbb/bgg/201309/W020130917614244055331.pdf).红色木莲生长于海拔1,700-2,500 m的常绿阔叶林或常绿落叶阔叶混交林中, 喜温凉湿润气候.其分布范围广阔, 涵盖了我国湖北、湖南、福建、广西、四川、贵州、云南和西藏等8个省份, 尼泊尔、印度和缅甸等国也有分布(中国科学院昆明植物研究所, 2006 ; 董学芬, 2017 ). ...
A statistical explanation of MaxEnt for ecologists
2
2011
... 深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 ).国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可.SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 ). ...
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
Identification of areas of endemism from species distribution models: Threshold selection and Nearctic mammals
1
2013
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
The analysis of spatial association by use of distance statistics
1
1992
... 不确定性是影响决策的重要因素(Myers, 1990 ), 空间尺度作为不确定性因素对MaxEnt模型进一步的应用与发展有明显的限制作用.本研究尝试使用热点分析的方法将MaxEnt模型输出结果进行处理, 探究热点分析在预测物种适生区方面的作用.结果显示, 热点区域(图4 )比MaxEnt模型的直接预测结果(图3 )更加清晰地呈现了红色木莲的适生区空间格局, 并且不同尺度间的一致性更加明显, 可见热点分析在很大程度上能消除空间尺度给MaxEnt模型带来的不确定性影响.最小存活种群理论表明物种以一定概率存活下去需要基于有效种群大小、最小存活面积等条件, 可见破碎化生境不利于物种的长期生存.热点分析可以有效探测研究区域内具有显著统计学意义的局部热点区域(Getis & Ord, 1992 ; Ord & Getis, 1995 ), 除关注分布概率的高低, 更加强调地理单元间的位置关系, 大大削弱了红色木莲适生区分布的破碎化程度, 更能反映其真实分布状态, 并且边界成本的降低对保护资源的高效利用与自然保护地的合理布局具有重要意义.我们相信综合MaxEnt模型的预测功能与热点分析的聚类优化将十分有益于物种地理分布的科学研究与保护规划的开展. ...
基于MaxEnt生态学模型的檀香在中国的潜在种植区预测
1
2014
... 本研究采用刀切法(Jackknife)检验环境因子贡献率(胡秀等, 2014 ), 基于此识别影响红色木莲空间分布的主导环境因子.本研究选择贡献率大于20%的环境因子作为主导环境因子, 进一步比较3个空间尺度下主导环境因子的异同, 分析MaxEnt模型建立的物种-环境关系的尺度效应. ...
基于MaxEnt生态学模型的檀香在中国的潜在种植区预测
1
2014
... 本研究采用刀切法(Jackknife)检验环境因子贡献率(胡秀等, 2014 ), 基于此识别影响红色木莲空间分布的主导环境因子.本研究选择贡献率大于20%的环境因子作为主导环境因子, 进一步比较3个空间尺度下主导环境因子的异同, 分析MaxEnt模型建立的物种-环境关系的尺度效应. ...
动物贮食行为及其生态意义
1
1996
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
动物贮食行为及其生态意义
1
1996
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
1
2006
... 红色木莲是木兰科木莲属(Manglietia )常绿乔木, 为IUCN红色名录无危等级(Least Concern, LC)物种, 《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》中列为易危(VU)物种(http://www.zhb.gov.cn/gkml/ hbb/bgg/201309/W020130917614244055331.pdf).红色木莲生长于海拔1,700-2,500 m的常绿阔叶林或常绿落叶阔叶混交林中, 喜温凉湿润气候.其分布范围广阔, 涵盖了我国湖北、湖南、福建、广西、四川、贵州、云南和西藏等8个省份, 尼泊尔、印度和缅甸等国也有分布(中国科学院昆明植物研究所, 2006 ; 董学芬, 2017 ). ...
1
2006
... 红色木莲是木兰科木莲属(Manglietia )常绿乔木, 为IUCN红色名录无危等级(Least Concern, LC)物种, 《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》中列为易危(VU)物种(http://www.zhb.gov.cn/gkml/ hbb/bgg/201309/W020130917614244055331.pdf).红色木莲生长于海拔1,700-2,500 m的常绿阔叶林或常绿落叶阔叶混交林中, 喜温凉湿润气候.其分布范围广阔, 涵盖了我国湖北、湖南、福建、广西、四川、贵州、云南和西藏等8个省份, 尼泊尔、印度和缅甸等国也有分布(中国科学院昆明植物研究所, 2006 ; 董学芬, 2017 ). ...
The problem of pattern and scale in ecology: The Robert H. MacArthur Award lecture
1
1992
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
动物与植物种子更新的关系. II. 动物对种子的捕食、扩散、贮藏及与幼苗建成的关系
1
2001
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
动物与植物种子更新的关系. II. 动物对种子的捕食、扩散、贮藏及与幼苗建成的关系
1
2001
... 基于3个空间尺度下可获得的有效地理分布信息, 利用ArcGIS 10.2中最小边界几何(minimum bounding geometry)工具分别构建红色木莲分布位点的最小凸多边形(minimum convex polygon, MCP), 得到红色木莲可能分布的区域范围.红色木莲主要由鸟类传播种子(柴勇等, 2011 ), 鸦科鸟是常见的植物种子扩散者, 扩散距离通常小于5 km, 其中星鸦(Nucifraga caryocatactes )传播种子的距离记录达20 km (蒋志刚, 1996 ; 李宏俊和张知彬, 2001 ).本研究在各尺度MCP分布范围的基础上, 利用ArcGIS 10.2中的缓冲区(buffer)工具向外扩张20 km, 以此作为各尺度的建模区域(图1 ). ...
Uncertainty analysis of crowd- sourced and professionally collected field data used in species distribution models of Taiwanese moths
1
2015
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
Low-cost strategies for protecting ecosystem services and biodiversity
1
2018
... 为消除环境因子多重共线性对建模的不利影响(Nüchel et al, 2018 ), 利用R 3.4.3的psych包分别对3个尺度下建模区域的生物气候因子与地形因子数据进行Pearson相关性分析, 筛选出相关系数低于0.7的环境因子(Manhães et al, 2018 ).三江并流尺度参与建模的环境因子为: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).云南省尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、年均降水量(b12)、最干月降水量(b14)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).全国尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、年均温度变化范围(b7)、年均降水量(b12)、最暖季度降水量(b18)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).将环境因子数据转化为ASCII格式, 作为MaxEnt 3.3.3k中环境图层(environmental layers)的输入文件. ...
MaxEnt’s parameter configuration and small samples: Are we paying attention to recommendations?
1
2017
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
The biodiversity challenge: Expanded hot-spots analysis
1
1990
... 不确定性是影响决策的重要因素(Myers, 1990 ), 空间尺度作为不确定性因素对MaxEnt模型进一步的应用与发展有明显的限制作用.本研究尝试使用热点分析的方法将MaxEnt模型输出结果进行处理, 探究热点分析在预测物种适生区方面的作用.结果显示, 热点区域(图4 )比MaxEnt模型的直接预测结果(图3 )更加清晰地呈现了红色木莲的适生区空间格局, 并且不同尺度间的一致性更加明显, 可见热点分析在很大程度上能消除空间尺度给MaxEnt模型带来的不确定性影响.最小存活种群理论表明物种以一定概率存活下去需要基于有效种群大小、最小存活面积等条件, 可见破碎化生境不利于物种的长期生存.热点分析可以有效探测研究区域内具有显著统计学意义的局部热点区域(Getis & Ord, 1992 ; Ord & Getis, 1995 ), 除关注分布概率的高低, 更加强调地理单元间的位置关系, 大大削弱了红色木莲适生区分布的破碎化程度, 更能反映其真实分布状态, 并且边界成本的降低对保护资源的高效利用与自然保护地的合理布局具有重要意义.我们相信综合MaxEnt模型的预测功能与热点分析的聚类优化将十分有益于物种地理分布的科学研究与保护规划的开展. ...
Snub-nosed monkeys (Rhinopithecus ): Potential distribution and its implication for conservation
1
2018
... 为消除环境因子多重共线性对建模的不利影响(Nüchel et al, 2018 ), 利用R 3.4.3的psych包分别对3个尺度下建模区域的生物气候因子与地形因子数据进行Pearson相关性分析, 筛选出相关系数低于0.7的环境因子(Manhães et al, 2018 ).三江并流尺度参与建模的环境因子为: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).云南省尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、温度季节变化标准差(b4)、年均降水量(b12)、最干月降水量(b14)、降水量变异系数(b15)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).全国尺度: 年平均温度(b1)、昼夜温差月均值(b2)、年均温度变化范围(b7)、年均降水量(b12)、最暖季度降水量(b18)、海拔(alt)、坡度(slo)、坡向(asp).将环境因子数据转化为ASCII格式, 作为MaxEnt 3.3.3k中环境图层(environmental layers)的输入文件. ...
Local spatial autocorrelation statistics: Distributional issues and an application
1
1995
... 不确定性是影响决策的重要因素(Myers, 1990 ), 空间尺度作为不确定性因素对MaxEnt模型进一步的应用与发展有明显的限制作用.本研究尝试使用热点分析的方法将MaxEnt模型输出结果进行处理, 探究热点分析在预测物种适生区方面的作用.结果显示, 热点区域(图4 )比MaxEnt模型的直接预测结果(图3 )更加清晰地呈现了红色木莲的适生区空间格局, 并且不同尺度间的一致性更加明显, 可见热点分析在很大程度上能消除空间尺度给MaxEnt模型带来的不确定性影响.最小存活种群理论表明物种以一定概率存活下去需要基于有效种群大小、最小存活面积等条件, 可见破碎化生境不利于物种的长期生存.热点分析可以有效探测研究区域内具有显著统计学意义的局部热点区域(Getis & Ord, 1992 ; Ord & Getis, 1995 ), 除关注分布概率的高低, 更加强调地理单元间的位置关系, 大大削弱了红色木莲适生区分布的破碎化程度, 更能反映其真实分布状态, 并且边界成本的降低对保护资源的高效利用与自然保护地的合理布局具有重要意义.我们相信综合MaxEnt模型的预测功能与热点分析的聚类优化将十分有益于物种地理分布的科学研究与保护规划的开展. ...
Maximum entropy modeling of species geographic distributions
4
2006
... MaxEnt模型是以最大熵原理(principle of maximum entropy)为理论支撑的机器学习模型(Phillips et al, 2006 ), 基于已有的、数量有限的物种分布点数据以及分布点对应的环境条件, 构成未知分布的约束条件, 建立物种地理分布与环境因子间的联系, 通过特定算法找出物种分布规律的最大熵, 进行未知区域的物种分布概率预测(分布的适宜程度) (Phillips et al, 2004 ).自Phillips (2006) 等首次引入MaxEnt模型预测物种潜在分布之后, 它已成为生态学研究的热点工具. ...
... ).自Phillips (2006) 等首次引入MaxEnt模型预测物种潜在分布之后, 它已成为生态学研究的热点工具. ...
... 使用受试者工作曲线(receiver operating characteristic, ROC)与遗漏率(omission rate, OR)检验MaxEnt模型预测精度, 并通过比较3个空间尺度下MaxEnt的ROC曲线下面积(area under the curve, AUC)与OR值评估模型预测精度的稳定性(Phillips et al, 2006 ).AUC值在0-1之间, 值越大, 模型预测精度越高, 一般认为AUC值 > 0.7时, MaxEnt模型的预测结果便为可信(Raes & Steege, 2007 ); OR值越小MaxEnt预测精度越高(Phillips et al, 2006 ). ...
... ); OR值越小MaxEnt预测精度越高(Phillips et al, 2006 ). ...
A Maximum Entropy Approach to Species Distribution Modeling. p
1
2004
... MaxEnt模型是以最大熵原理(principle of maximum entropy)为理论支撑的机器学习模型(Phillips et al, 2006 ), 基于已有的、数量有限的物种分布点数据以及分布点对应的环境条件, 构成未知分布的约束条件, 建立物种地理分布与环境因子间的联系, 通过特定算法找出物种分布规律的最大熵, 进行未知区域的物种分布概率预测(分布的适宜程度) (Phillips et al, 2004 ).自Phillips (2006) 等首次引入MaxEnt模型预测物种潜在分布之后, 它已成为生态学研究的热点工具. ...
Botanical richness and endemicity patterns of Borneo derived from species distribution models
1
2009
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
A null-model for significance testing of presence-only species distribution models
1
2007
... 使用受试者工作曲线(receiver operating characteristic, ROC)与遗漏率(omission rate, OR)检验MaxEnt模型预测精度, 并通过比较3个空间尺度下MaxEnt的ROC曲线下面积(area under the curve, AUC)与OR值评估模型预测精度的稳定性(Phillips et al, 2006 ).AUC值在0-1之间, 值越大, 模型预测精度越高, 一般认为AUC值 > 0.7时, MaxEnt模型的预测结果便为可信(Raes & Steege, 2007 ); OR值越小MaxEnt预测精度越高(Phillips et al, 2006 ). ...
Species richness
1
1987
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
Assessing biodiversity conservation priorities: Ecosystem risk and representativeness in continental Ecuador
1
2002
... 物种的地理分布是不均匀的(赵淑清等, 2000 ), 弄清区域内物种资源的分布现状是实施精细化保护的关键.根据本研究结果, 红色木莲在兰坪白族普米族自治县和维西傈僳族自治县均有大面积分布, 但这两个区域却鲜有此种的分布记录(表1 ).可能有两方面原因导致记录的缺失: 一是三江并流区域内环境异质性极大, 沟谷纵横与气候多变的环境条件让基础性研究工作的开展十分困难; 二是三江并流区域内的保护资源与人员有限, 物种资源调查工作仅针对重点保护物种, 无法全面铺开.本研究表明, 基于MaxEnt模型通过扩大空间尺度的方法可以有效克服基础性研究工作不足, 并且得到的预测结果可以为下一步的野外调查研究提供新样地, 实现模型预测与实地调查工作的良性循环.三江并流区域是世界生物多样性热点区域, 如果等数据收集充分再开展精细化保护, 很多物种可能已经灭绝(Sierra et al, 2002 ), 因此我们建议基于已有的物种信息利用MaxEnt模型等相关方法预测三江并流区域内更多物种的地理分布, 随后结合实地考察逐步掀开该区域生物多样性的神秘面纱, 使三江并流区域生物多样性的精细化保护在不断探索与实践中得到完善. ...
The sensitivity of species distribution modeling to scale differences
1
2013
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
基于MaxEnt模型的不同气候变化情景下我国草地螟越冬区预测
1
2017
... 基于三江并流尺度的建模区域分析各尺度下红色木莲适生区的空间格局, 主要从两个方面进行研究: (1)分布概率的空间一致性分析.为了深入揭示分布概率的空间格局对尺度选择的响应规律, 本研究基于ArcGIS 10.2对MaxEnt模型输出的概率值信息进行符号化展示, 并使用优化热点分析工具(optimized hot spot analysis)进一步对MaxEnt模型输出的分布概率进行归一化处理, 识别并分析3个尺度下红色木莲概率分布的热点区域.(2)潜在适宜分布区域质心位置分析.本研究使用分区统计工具Zonal分别计算3个空间尺度下潜在适宜分布区域的几何质心(centroid), 通过质心位置的变化表征红色木莲空间分布的变迁(唐继洪等, 2017 ).综合分布概率的空间一致性与质心位置的分析结果, 判断不同空间尺度下红色木莲适生区的空间格局变化. ...
基于MaxEnt模型的不同气候变化情景下我国草地螟越冬区预测
1
2017
... 基于三江并流尺度的建模区域分析各尺度下红色木莲适生区的空间格局, 主要从两个方面进行研究: (1)分布概率的空间一致性分析.为了深入揭示分布概率的空间格局对尺度选择的响应规律, 本研究基于ArcGIS 10.2对MaxEnt模型输出的概率值信息进行符号化展示, 并使用优化热点分析工具(optimized hot spot analysis)进一步对MaxEnt模型输出的分布概率进行归一化处理, 识别并分析3个尺度下红色木莲概率分布的热点区域.(2)潜在适宜分布区域质心位置分析.本研究使用分区统计工具Zonal分别计算3个空间尺度下潜在适宜分布区域的几何质心(centroid), 通过质心位置的变化表征红色木莲空间分布的变迁(唐继洪等, 2017 ).综合分布概率的空间一致性与质心位置的分析结果, 判断不同空间尺度下红色木莲适生区的空间格局变化. ...
植物物种多样性的垂直分布格局
1
2004
... 环境因子贡献率的刀切法检验结果表明, 不同空间尺度下红色木莲的地理分布受不同的环境因子所影响, 地形因子在较小空间尺度内(三江并流尺度)有重要影响, 而转移到较大空间尺度下(云南省与全国尺度)其作用则不显著.海拔梯度反映了温度和湿度等环境因子的综合效应, 对山地物种分布规律的研究具有重要意义(唐志尧和方精云, 2004 ).三江并流区域位于西南山地, 海拔分布从760 m (怒江河谷)到6,740 m (卡瓦格博峰), 狭小地域内的巨大高差使该区域内的物种分布对海拔梯度变化十分敏感, 这也是海拔和坡向等地形因子主导该尺度下红色木莲分布的重要原因.随着空间尺度的扩大, 除海拔等地形因子信息外, 其他环境因子信息也丰富起来, 且红色木莲分布位点的数量增多, 为MaxEnt模型的建立提供了更多的约束条件, 年均降水量、昼夜温差月均值和年均温度变化范围等生物气候因子对红色木莲分布的影响突显出来.由此可见, 红色木莲的空间分布格局存在着尺度依赖效应, 特定尺度下的空间格局可能存在特定主导因子(Wiegand et al, 2007 ), 因此在挑选参与建模的环境因子时应充分考虑空间尺度对物种分布的影响. ...
植物物种多样性的垂直分布格局
1
2004
... 环境因子贡献率的刀切法检验结果表明, 不同空间尺度下红色木莲的地理分布受不同的环境因子所影响, 地形因子在较小空间尺度内(三江并流尺度)有重要影响, 而转移到较大空间尺度下(云南省与全国尺度)其作用则不显著.海拔梯度反映了温度和湿度等环境因子的综合效应, 对山地物种分布规律的研究具有重要意义(唐志尧和方精云, 2004 ).三江并流区域位于西南山地, 海拔分布从760 m (怒江河谷)到6,740 m (卡瓦格博峰), 狭小地域内的巨大高差使该区域内的物种分布对海拔梯度变化十分敏感, 这也是海拔和坡向等地形因子主导该尺度下红色木莲分布的重要原因.随着空间尺度的扩大, 除海拔等地形因子信息外, 其他环境因子信息也丰富起来, 且红色木莲分布位点的数量增多, 为MaxEnt模型的建立提供了更多的约束条件, 年均降水量、昼夜温差月均值和年均温度变化范围等生物气候因子对红色木莲分布的影响突显出来.由此可见, 红色木莲的空间分布格局存在着尺度依赖效应, 特定尺度下的空间格局可能存在特定主导因子(Wiegand et al, 2007 ), 因此在挑选参与建模的环境因子时应充分考虑空间尺度对物种分布的影响. ...
Trends and biases in global scientific literature about ecological niche models
1
2015
... 深入理解物种的生态特性与地理分布是开展保护规划与分布预测的重要内容, 也是识别生物多样性空间格局中生态与进化关键要素的基础(Elith et al, 2011 ).国内外学者为寻求一种可以揭示物种-环境关系的方法进行了大量探索与研究, 以生态位理论为基础的物种分布模型(species distribution models, SDMs)应运而生, 其概念一经提出便迅速受到生态学、生物地理学、进化生物学及保护生物学等科学领域的关注与认可.SDMs模型以生物气候分析系统(bioclimate analysis and prediction system, BIOCLIM)为雏形, 随着生态学、统计学等理论的发展、3S技术的推广以及相关研究的推进, 发展至今, 已涌现出大量的SDMs模型, 其中最大熵(maximum entropy, MaxEnt)模型从中脱颖而出, 成为目前使用最广的模型(Catherineh et al, 2008 ; Ahmed et al, 2015 ; Barbosa & Schneck, 2015 ; Vaz et al, 2015 ). ...
兰坪县野生动植物保护与利用对策
1
2017
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
兰坪县野生动植物保护与利用对策
1
2017
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
Species associations in a heterogeneous Sri Lankan dipterocarp forest
1
2007
... 环境因子贡献率的刀切法检验结果表明, 不同空间尺度下红色木莲的地理分布受不同的环境因子所影响, 地形因子在较小空间尺度内(三江并流尺度)有重要影响, 而转移到较大空间尺度下(云南省与全国尺度)其作用则不显著.海拔梯度反映了温度和湿度等环境因子的综合效应, 对山地物种分布规律的研究具有重要意义(唐志尧和方精云, 2004 ).三江并流区域位于西南山地, 海拔分布从760 m (怒江河谷)到6,740 m (卡瓦格博峰), 狭小地域内的巨大高差使该区域内的物种分布对海拔梯度变化十分敏感, 这也是海拔和坡向等地形因子主导该尺度下红色木莲分布的重要原因.随着空间尺度的扩大, 除海拔等地形因子信息外, 其他环境因子信息也丰富起来, 且红色木莲分布位点的数量增多, 为MaxEnt模型的建立提供了更多的约束条件, 年均降水量、昼夜温差月均值和年均温度变化范围等生物气候因子对红色木莲分布的影响突显出来.由此可见, 红色木莲的空间分布格局存在着尺度依赖效应, 特定尺度下的空间格局可能存在特定主导因子(Wiegand et al, 2007 ), 因此在挑选参与建模的环境因子时应充分考虑空间尺度对物种分布的影响. ...
兰坪云岭省级自然保护区生态质量评价研究
1
2011
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
兰坪云岭省级自然保护区生态质量评价研究
1
2011
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
1
2013
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
1
2013
... 3个空间尺度下红色木莲适生区分布格局在大部分区域呈现出一致性, 但在兰坪白族普米族自治县出现差异.通过查阅此地的科考报告、专著及学术论文等文献资料, 我们发现其境内野生生物资源的本底调查仍不全面, 物种名录及其种群数量尚不明确(杨国斌, 2011 , 2013 ; 汪海林, 2017 ).红色木莲在该区域分布位点的缺失极有可能是由于野外调查与保护的缺位, 进而导致了本研究三江并流尺度下MaxEnt模型的预测结果在此区域的空白.考虑到保护一个物种的最佳时期是当它处于普通物种状态的时候(Scott et al, 1987 ), 本研究选择红色木莲这一普通物种作为研究对象, 分析结果反映出过去实地野外调查与野生生物资源保护往往偏向关注面临灭绝风险、生境狭窄的物种及其生境, 而较少考虑普通物种, 并且这种“只抓重点”的保护模式对普通物种野生资源构成的威胁已经开始显现, 2013年红色木莲被列为《中国生物多样性红色名录: 高等植物卷》VU等级物种.因此, 本研究建议在兰坪白族普米族自治县开展滇金丝猴(Rhinopithecus bieti )、怒江金丝猴(R. strykeri )等关键物种专项保护的同时, 也进一步加强针对以红色木莲代表的普通物种的调查研究, 将普通物种的保护纳入兰坪白族普米族自治县的保护体系当中. ...
MaxEnt最大熵模型在预测物种潜在分布范围方面的应用
1
2015
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
MaxEnt最大熵模型在预测物种潜在分布范围方面的应用
1
2015
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
基于MaxEnt模型预测齿裂大戟在中国的潜在分布区
1
2015
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
基于MaxEnt模型预测齿裂大戟在中国的潜在分布区
1
2015
... 在MaxEnt 3.3.3k中导入处理好的地理分布位点数据与环境因子数据, 然后设置模型参数.根据地理分布位点数量, 三江并流尺度与云南省尺度的建模选择线性特征(linear features)、二次型特征(quadratic features)与片段化特征(hinge features)的特征组合, 全国尺度建模选择线性、二次型特征、乘积型特征(product features)、阈值性特征(threshold features)与片段化特征(Elith, 2011 ), 并选择10%存在点训练集逻辑斯蒂(10% training presence)作为各尺度模型的应用阈值规则(Raes et al, 2009 ); 并将MaxEnt模型重复运行次数设为20次, 以消除随机性(张路, 2015a , b ), 其他参数保持默认值.模型输出结果为一系列表示红色木莲分布概率的栅格. ...
全球200: 确定大尺度生物多样性优先保护的一种方法
1
2000
... 物种的地理分布是不均匀的(赵淑清等, 2000 ), 弄清区域内物种资源的分布现状是实施精细化保护的关键.根据本研究结果, 红色木莲在兰坪白族普米族自治县和维西傈僳族自治县均有大面积分布, 但这两个区域却鲜有此种的分布记录(表1 ).可能有两方面原因导致记录的缺失: 一是三江并流区域内环境异质性极大, 沟谷纵横与气候多变的环境条件让基础性研究工作的开展十分困难; 二是三江并流区域内的保护资源与人员有限, 物种资源调查工作仅针对重点保护物种, 无法全面铺开.本研究表明, 基于MaxEnt模型通过扩大空间尺度的方法可以有效克服基础性研究工作不足, 并且得到的预测结果可以为下一步的野外调查研究提供新样地, 实现模型预测与实地调查工作的良性循环.三江并流区域是世界生物多样性热点区域, 如果等数据收集充分再开展精细化保护, 很多物种可能已经灭绝(Sierra et al, 2002 ), 因此我们建议基于已有的物种信息利用MaxEnt模型等相关方法预测三江并流区域内更多物种的地理分布, 随后结合实地考察逐步掀开该区域生物多样性的神秘面纱, 使三江并流区域生物多样性的精细化保护在不断探索与实践中得到完善. ...
全球200: 确定大尺度生物多样性优先保护的一种方法
1
2000
... 物种的地理分布是不均匀的(赵淑清等, 2000 ), 弄清区域内物种资源的分布现状是实施精细化保护的关键.根据本研究结果, 红色木莲在兰坪白族普米族自治县和维西傈僳族自治县均有大面积分布, 但这两个区域却鲜有此种的分布记录(表1 ).可能有两方面原因导致记录的缺失: 一是三江并流区域内环境异质性极大, 沟谷纵横与气候多变的环境条件让基础性研究工作的开展十分困难; 二是三江并流区域内的保护资源与人员有限, 物种资源调查工作仅针对重点保护物种, 无法全面铺开.本研究表明, 基于MaxEnt模型通过扩大空间尺度的方法可以有效克服基础性研究工作不足, 并且得到的预测结果可以为下一步的野外调查研究提供新样地, 实现模型预测与实地调查工作的良性循环.三江并流区域是世界生物多样性热点区域, 如果等数据收集充分再开展精细化保护, 很多物种可能已经灭绝(Sierra et al, 2002 ), 因此我们建议基于已有的物种信息利用MaxEnt模型等相关方法预测三江并流区域内更多物种的地理分布, 随后结合实地考察逐步掀开该区域生物多样性的神秘面纱, 使三江并流区域生物多样性的精细化保护在不断探索与实践中得到完善. ...
MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响
1
2016
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...
MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响
1
2016
... 近年来, 国内外有关研究开始关注不同条件下MaxEnt模型性能的稳定性与不确定性(尚忠慧, 2016) (① 尚忠慧 (2016) 基于Maxent的物种空间分布预测不确定性分析——以当归为例. 硕士学位论文, 陕西师范大学, 西安.), 主要集中于数据质量和参数设置两方面对MaxEnt模型预测精度及输出结果的影响, 如: 不同分辨率的环境图层下预测精度的比较(Song et al, 2013 ); MaxEnt模型预测效果对分布位点数量的响应(陈新美等, 2012 ); 不同来源的分布位点数据下MaxEnt模型预测精度与潜在适宜分布区域的一致性探讨(Lin et al, 2015 ); MaxEnt模型在不同阈值选择下预测物种分布的表现(Escalante et al, 2013 ); 物种分布数据不充分的条件下最优参数的设置(Morales et al, 2017 ); MaxEnt模型复杂度对物种潜在分布区预测的影响(朱耿平和乔慧捷, 2016 ).尺度与格局是生态学研究的核心问题, 也是统一种群生物学与生态系统科学、综合基础生态学与应用生态学的关键(Levin, 1992 ).MaxEnt模型对空间尺度变化的适用能力是其进一步发展与应用的重要制约因素, 目前有关MaxEnt模型的研究仍停留在单一空间尺度, 关于MaxEnt模型性能与空间尺度的关系研究较少. ...