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中国与欧洲高卢蜜环菌的遗传多样性
孙立夫, 裴克全, 张艳华, 赵俊, 杨国亭, 秦国夫, 宋玉双, 宋瑞清
生物多样性    2012, 20 (2): 224-230.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2012.07214
摘要   (3196 HTML3 PDF(pc) (346KB)(2558)  

高卢蜜环菌(Armillaria gallica)为北半球广布种, 不同大陆间的菌株遗传相似性和多样性水平能反映出该种在洲际大陆尺度上的地理遗传变异关系。作者用ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记技术, 对从中国和欧洲收集到的高卢蜜环菌79个菌株进行了遗传多样性分析。用6个ISSR引物扩增得到210个位点, 其中多态性位点(频率<0.95)为202个, 占96.2%, 平均每个引物多态位点多达33.6个, 表明ISSR标记在蜜环菌中存在较高的多态性。根据非加权类平均法(UPGMA)聚类分析, 中国53个菌株中的49个在0.773的相似性水平上聚成了中国类群(China group); 而欧洲26个菌株遗传分化较大, 分别在0.775和0.763的相似性水平上聚成了欧洲类群A(Europe group A)和B(Europe group B); 2个欧洲类群间的相似性水平仅为0.738, 而欧洲类群A与中国类群间的相似性却达到了0.770; 两个大陆均有少数菌株表现出较为明显的遗传分化, 个别菌株的种内遗传相似性甚至低于蜜环菌种间的遗传相似性。结果表明, 中欧两个大陆间的A. gallica菌株因地理隔离已经表现出明显的遗传分化, 处于异域物种形成过程中; 欧洲大陆的菌株遗传分化更为明显, 可能是两个大陆A. gallica菌株的起源地。


引物序号(编号)
Primers
引物序列
Primer sequence
退火温度
Annealing
temperature (℃)
9#(MAO) (CTC)4RC 48
11#(GUO) BDB(ACA)5 48
13#(857) (CA)8YG 54
14#(MANNY) (CAC)4RC 60
15#(TCG) XDH(TCG)5 61
16#(CGA) DHB(CGA)5 61
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表1 ISSR引物及退火温度
正文中引用本图/表的段落
ISSR-PCR扩增的反应条件及引物筛选详见孙立夫等(2009b), 所用6个引物详见表1。整个扩增重复2次。
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