全基因组重测序方法在濒危植物保护中的应用

景昭阳, 程可光, 舒恒, 马永鹏, 刘平丽

Whole genome resequencing approach for conservation biology of endangered plants

Zhaoyang Jing, Keguang Cheng, Heng Shu, Yongpeng Ma, Pingli Liu

表1 受威胁植物核酸多样性

Table 1 Nucleic acid diversity of threatened plant species

学名 Scientific name 濒危等级 Endangered category 保护等级 Protection level θπ 样本量 Sample size 参考文献 References 野生稻 Oryza rufipogon 极危 CR Ⅱ级 Class II 0.003000 446 Huang et al, 2012 天目铁木 Ostrya rehderiana 极危 CR I级 Class I 0.001660 13 Yang et al, 2018 野生莲 Nelumbo nucifera - II级 Class II 0.002177 7 Huang et al, 2018 鹅掌楸 Liriodendron chinense - II级 Class II 0.001280 14 Chen et al, 2019 银杏 Ginkgo biloba 极危 CR I级 Class I 0.002110 545 Zhao et al, 2019 水青树 Tetracentron sinense II级 Class II 0.012800 55 Liu et al, 2020 细叶杨 Populus ilicifolia 易危 VU - 0.000830 19 Chen Z et al, 2020 珙桐 Davidia involucrate - I级 Class I 0.005850 10 Chen Y et al, 2020 连香树 Cercidiphyllum japonicum - II级 Class II 0.001100 82 Zhu et al, 2020 小粒咖啡 Coffea arabica 濒危 EN - 0.003810 48 Huang et al, 2020 朱红大杜鹃 Rhododendron griersonianum 极危 CR - 0.001940 31 Ma et al, 2021a 胡桃 Juglans regia 易危 VU II级 Class II 0.000500 55 Bernard et al, 2021 斧翅沙芥 Pugionium dolabratum - II级 Class II 0.013000 20 Hu et al, 2021 茶 Camellia sinensis - II级 Class II 0.006100 120 Lu et al, 2021 野生荔枝 Litchi chinensis - II级 Class II 0.008300 38 Hu et al, 2022 漾濞槭 Acer yangbiense 濒危 EN - 0.003130 105 Ma et al, 2022 芒苞草 Acanthochlamys bracteata 易危 VU - 0.000460 14 Xu et al, 2022 野大豆 Glycine soja - II级 Class II 0.001220 40 Wang et al, 2022