| (一)兔形目 Lagomorpha | | | |
| (1)兔科 Leporidae | | | |
| 1. 灰尾兔 Lepus oiostolus | | LC | 1 |
| 2. 蒙古兔 Lepus tolai | | LC | 1 |
| (二)啮齿目 Rodentia | | | |
| (2)松鼠科 Sciuridae | | | |
| 3. 赤腹松鼠 Callosciurus erythraeus | | LC | 2 |
| 4. 岩松鼠 Sciurotamias davidianus | | LC | 19 |
| 5. 北松鼠 Sciurus vulgaris | | LC | 1 |
| 6. 隐纹花松鼠 Tamiops swinhoei | | LC | 16 |
| 7. 珀氏长吻松鼠 Dremomys pernyi | | LC | 5 |
| 8. 北花松鼠 Tamias sibiricus | | LC | 6 |
| 9. 喜马拉雅旱獭 Marmota himalayana | | LC | 5 |
| (3)豪猪科 Hystricidae | | | |
| 10. 中国豪猪 Hystrix hodgsoni | | LC | 38 |
| (三)灵长目 Primates | | | |
| (4)猴科 Cercopithecidae | | | |
| 11. 藏酋猴 Macaca thibetana | Ⅱ | NT | 18 |
| 12. 猕猴 Macaca mulatta | Ⅱ | LC | 7 |
| 13. 川金丝猴 Rhinopithecus roxellana | Ⅰ | EN | 38 |
| (四)食肉目 Carnivora | | | |
| (5)犬科 Canidae | | | |
| 14. 豺 Cuon alpinus | Ⅰ | EN | 5 |
| 15. 赤狐 Vulpes vulpes | Ⅱ | LC | 7 |
| 16. 狼 Canis lupus | Ⅱ | LC | 3 |
| 17. 貉 Nyctereutes procyonoides | Ⅱ | LC | 1 |
| (6)熊科 Ursidae | | | |
| 18. 大熊猫 Ailuropoda melanoleuca | Ⅰ | VU | 40 |
| 19. 黑熊 Ursus thibetanus | Ⅱ | VU | 37 |
| (7)小熊猫科 Ailuridae | | | |
| 20. 中华小熊猫 Ailurus styani | Ⅱ | EN | 13 |
| (8)鼬科 Mustelidae | | | |
| 21. 黄腹鼬 Mustela kathiah | | LC | 3 |
| 22. 香鼬 Mustela altaica | | NT | 7 |
| 23. 黄鼬 Mustela sibirica | | LC | 32 |
| 24. 缺齿伶鼬 Mustela aistoodonnivalis | | DD | 4 |
| 25. 石貂 Martes foina | Ⅱ | LC | 5 |
| 26. 黄喉貂 Martes flavigula | Ⅱ | LC | 36 |
| 27. 欧亚水獭 Lutra lutra | Ⅱ | NT | 6 |
| 28. 亚洲狗獾 Meles leucurus | | LC | 7 |
| 29. 鼬獾 Melogale moschata | | LC | 13 |
| 30. 猪獾 Arctonyx albogularis** | | LC | 37 |
物种
Species | 国家保护级别
National protected category | IUCN评估级别
IUCN Red List* | 记录保护地数
No. protected areas detected |
| (9)灵猫科 Viverridae | | | |
| 31. 小灵猫 Viverricula indica | Ⅰ | LC | 1 |
| 32. 花面狸 Paguma larvata | | LC | 35 |
| (10)林狸科 Prionodontidae | | | |
| 33. 斑林狸 Prionodon pardicolor | Ⅱ | LC | 1 |
| (11)猫科 Felidae | | | |
| 34. 豹猫 Prionailurus bengalensis | Ⅱ | LC | 36 |
| 35. 荒漠猫 Felis bieti | Ⅰ | VU | 2 |
| 36. 金猫 Pardofelis temminckii | Ⅰ | NT | 13 |
| 37. 豹 Panthera pardus | Ⅰ | VU | 10 |
| 38. 雪豹 Panthera uncia | Ⅰ | VU | 4 |
| (五)偶蹄目 Artiodactyla | | | |
| (12)麝科 Moschidae | | | |
| 39. 林麝 Moschus berezovskii | Ⅰ | EN | 35 |
| 40. 马麝 Moschus chrysogaster | Ⅰ | EN | 3 |
| (13)鹿科 Cervidae | | | |
| 41. 狍 Capreolus pygargus | | LC | 5 |
| 42. 小麂 Muntiacus reevesi | | LC | 29 |
| 43. 毛冠鹿 Elaphodus cephalophus | Ⅱ | NT | 38 |
| 44. 水鹿 Rusa unicolor | Ⅱ | VU | 7 |
| 45. 梅花鹿 Cervus nippon | Ⅰ | LC | 1 |
| (14)牛科 Bovidae | | | |
| 46. 秦岭羚牛 Budorcas bedfordi | Ⅰ | VU | 11 |
| 47. 四川羚牛 Budorcas tibetanus | Ⅰ | VU | 28 |
| 48. 岩羊 Pseudois nayaur | Ⅱ | LC | 9 |
| 49. 中华斑羚 Naemorhedus griseus | Ⅱ | VU | 34 |
| 50. 中华鬣羚 Capricornis milneedwardsii | Ⅱ | NT | 36 |
| (15)猪科 Suidae | | | |
| 51. 野猪 Sus scrofa | | LC | 38 |