%A 贾晓旭, 唐修君, 樊艳凤, 陆俊贤, 黄胜海, 葛庆联, 高玉时, 韩威 %T 华东地区地方鸡品种mtDNA控制区遗传多样性 %0 Journal Article %D 2017 %J 生物多样性 %R 10.17520/biods.2017012 %P 540-548 %V 25 %N 5 %U {https://www.biodiversity-science.net/CN/abstract/article_9003.shtml} %8 2017-05-20 %X

为了探明我国华东地区地方鸡品种的遗传多样性和群体遗传结构, 追溯其母系起源和进化过程, 利用PCR技术扩增了11个地方鸡品种的线粒体DNA (mtDNA)控制区(D-loop)序列, 并结合NCBI数据库中已发表的红色原鸡(Gallus gallus) D-loop区全序列, 分析了它们的遗传多样性与亲缘关系, 构建了11个品种与红色原鸡系统发生邻接树。结果表明:11个地方品种mtDNA D-loop区全长为1,231或1,232 bp, 其中1,231 bp的序列有196条, 1,232 bp的序列有123条, 经过比对发现, 两者在859 bp处存在单碱基缺失。11个地方品种319个个体共计检测到变异位点37个, 总体单倍型多样度核苷酸多样度和平均核苷酸差异分别为0.901 ± 0.009、0.00573 ± 0.000001和6.833。按照鸡mtDNA单倍型分类通用标准, 共包含35种单倍型, 可以分为A、B、C和E共4个分支(单倍型群), 分别包括11、10、9和5个单倍型。中介网络图中11个鸡品种也很明显地分成了4个支系, 分别含有100、118、47和54条序列。系统发育树分为4个大枝, 海南亚种(G. gallus jabouillei)自成一枝; C单倍型群与4个亚种的红色原鸡聚为一枝; E单倍型群与2个亚种红色原鸡聚为一枝; A和B单倍型群只与滇南亚种(G .gallus spadiceus)聚为一枝。11个品种中, 除了狼山和丝羽乌骨鸡2个标准化品种外, 都有很高的遗传多样性, 可开发选择潜力很大。没有发现线粒体品种特异性DNA序列。华东地区地方品种至少有4个母系起源, 部分品种可能受到了欧美高产品系的渗入。