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1. 互花米草与海三棱藨草的生长特征和相对竞争能力
陈中义, 李博, 陈家宽
生物多样性    2005, 13 (2): 130-136.   DOI: 10.1360/biodiv.040122
摘要5097)      PDF(pc) (613KB)(52319)    收藏

外来物种互花米草(Spartina alterniflora)已对我国特有种海三棱藨草(Scirpus mariqueter)发生了竞争取代。作者通过在长江口崇明东滩湿地取样和盆栽竞争实验,比较了二者的主要生长特征和种间相对竞争能力。结果表明:无论是先锋种群还是成熟种群,互花米草的高度、盖度、地上生物量、地下生物量和平均每花序种子数都显著大于海三棱藨草;海三棱藨草的密度和单位面积结实枝条数显著大于互花米草。两种植物成熟种群的单位面积种子产量和种子的萌发率没有显著差异。种内竞争和种间竞争显著降低了两种植物的平均每株产生的无性小株数、结实株数、地上生物量和地下球茎数(海三棱藨草产生球茎),互花米草的种间竞争能力(相对邻里效应指数)显著大于海三棱藨草。互花米草在生长上的优势可能导致其在种间竞争上的优势,从而使互花米草能够在海三棱藨草群落中成功入侵。

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2. Species Diversity of Discomycetes in China
ZHUANG WENYING
生物多样性    DOI: 10.17520/biods.1995043
3. 生物群落多样性的测度方法Ⅰ α 多样性的测度方法(下)
马克平, 刘玉明
生物多样性    1994, 02 (4): 231-239.   DOI: 10.17520/biods.1994038
摘要4787)      PDF(pc) (585KB)(11366)    收藏
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4. 试论生物多样性的概念
马克平
生物多样性    1993, 01 (1): 20-22.   DOI: 10.17520/biods.1993005
摘要4388)      PDF(pc) (277KB)(10276)    收藏
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被引次数: Baidu(1636)
5. 群落构建的中性理论和生态位理论
牛克昌, 刘怿宁, 沈泽昊, 何芳良, 方精云
生物多样性    2009, 17 (6): 579-593.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09142
摘要7064)      PDF(pc) (439KB)(9820)    收藏
物种共存和生物多样性维持一直是生态学研究的中心论题。基于物种生态位分化的群落构建理论已经发展了近一个世纪, 但我们对群落构建和生物多样性维持的机理仍然不清楚。近年来, 群落中性理论以其简约性和预测能力成为群落生态学研究的焦点, 但由于其“物种在生态功能上等价”的假设与大量研究结果相悖, 同时对自然群落结构的准确预测也只限于少数的生态系统, 因而饱受质疑。如今, 越来越多的生态学家认为群落构建的生态位理论与中性理论之争的最终归宿应该是二者的整合。 在本文中, 我们在简要回顾生态位理论和群落中性理论发展的基础上, 分析二者之间的主要分歧和互补性, 试图梳理二者整合的途径。我们认为, 尽管中性理论的发展极大地丰富了群落构建理论, 但二者的整合尚处于初级阶段; 群落构建零模型假说、中性—生态位连续体假说、随机生态位假说等都不失为有价值的尝试, 今后需要在其他类型的生态系统中进行实验验证, 以更好地理解确定性过程和随机过程在决定群落构建和生物多样性维持中的作用。
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被引次数: Baidu(226) CSCD(73)
6. 中国被子植物科属概览: 依据APG III系统
刘冰, 叶建飞, 刘夙, 汪远, 杨永, 赖阳均, 曾刚, 林秦文
生物多样性    2015, 23 (2): 225-231.   DOI: 10.17520/biods.2015052
摘要3228)   HTML20)    PDF(pc) (3932KB)(9817)    收藏

被子植物是现存高等植物最为繁盛的类群, 约30万种, 是陆地植被的主要组成成分。搞清科、属和种的数量和范畴对认识全球和区域生物多样性有重要价值。分子系统学的快速发展, 使很多被子植物的科和属的范畴发生了变化。本文结合APG III系统和一些新的系统发育研究动态, 对中国原产和引入的被子植物科属名单进行了整理, 确认被子植物在中国原产258科, 引入55科(其中6科归化), 中国原产2,872属, 引入1,605属(含归化152属), 并简要介绍了中国被子植物科属范畴的历史沿革和新变化。新的名录与《中国植物志》相比, 新增115科1,729属, 与Flora of China相比, 新增85科1,531属。

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被引次数: Baidu(2) CSCD(7)
7. 植物群落清查的主要内容、方法和技术规范
方精云, 王襄平, 沈泽昊, 唐志尧, 贺金生, 于丹, 江源, 王志恒, 郑成洋, 朱江玲, 郭兆迪
生物多样性    2009, 17 (6): 533-548.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09253
摘要7177)      PDF(pc) (661KB)(8985)    收藏
植物群落是不同植物在长期环境变化中相互作用、相互适应而形成的组合。它提供着人类赖以生存的主要物质资源, 维系着地球生态系统的健康和功能, 也为各种动物和其他生物提供食物来源和栖息地, 是人类生存和发展不可或缺的物质基础, 具有不可替代的作用。我国植物群落类型多样, 在世界上首屈一指, 但我国至今尚没有一次全面和系统的植物群落清查, 不仅影响了人们对我国植物资源的了解、利用和保护, 也不利于我国生态学、环境科学和地理学等相关学科的发展。采用统一的方法体系和技术规范开展我国植物群落的清查工作势在必行, 并具有紧迫性。本文基于作者长期的野外工作实践和国内外的群落调查方法, 首先简要定义了与植物群落清查有关的重要概念, 在此基础上, 论述了调查样地的设置原则和体系、群落清查的技术指标和方法、主要优势种生态属性的测定方法和规范, 并介绍了大样地调查的主要步骤。通过本文的介绍、归纳和总结, 试图为制定我国植物群落清查的技术规范提供基础材料和技术储备。
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被引次数: Baidu(459) CSCD(191)
8. 三个“哪些”: 植物园的使命
洪德元
生物多样性    2016, 24 (6): 728-.   DOI: 10.17520/biods.2016158
摘要1263)   HTML5)    PDF(pc) (336KB)(8471)    收藏

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被引次数: Baidu(6)
9. 基于新一代高通量测序的环境微生物转录组学研究进展
蔡元锋, 贾仲君
生物多样性    2013, 21 (4): 401-410.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2013.10031
摘要2631)   HTML2)    PDF(pc) (302KB)(7404)    收藏

环境微生物转录组学是一门新兴学科, 它以复杂环境样品中的微生物mRNA为研究对象, 利用近年兴起的RNA-Seq高通量测序技术, 在整体水平上对环境微生物的基因表达水平和调控规律进行研究。本文概述了环境微生物转录组研究从样品的采集保存、RNA提取、mRNA的富集、cDNA合成直到高通量测序及数据分析的基本流程。总结了该技术面临的主要瓶颈: 环境样品mRNA含量低、腐植酸等干扰杂质多、rRNA去除程度有限。针对 RNA的提取、纯化以及mRNA的富集这些重点步骤, 详细阐述了近年来在提高mRNA的得率与纯度上的方法学进展。重点介绍了高通量测序数据的处理及分析方法, 从测序数据的质量控制、序列组装、rRNA的鉴定及去除、功能基因注释及分类到差异表达基因的鉴定。最后总结了近年来环境微生物转录组学在新基因的发现、不同环境条件下微生物的基因表达及调控规律研究、有机物的代谢路径分析等3个主要研究领域的广泛应用。随着测序技术及生物信息学分析工具的发展进步, 环境微生物转录组学将具有更广阔的应用前景。

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被引次数: Baidu(35) CSCD(10)
10. 土壤微生物多样性影响因素及研究方法的现状与展望
周桔, 雷霆
生物多样性    2007, 15 (3): 306-311.   DOI: 10.1360/biodiv.070069
摘要4693)      PDF(pc) (221KB)(7362)    收藏

土壤微生物是土壤生态系统的重要组成部分, 在土壤有机物质分解和养分释放、能量转移等生物地化循环中起着重要作用。随着人们对生物多样性重要性认识的不断深入及研究方法的不断改进, 土壤微生物多样性, 尤其是功能多样性的研究工作逐渐受到生态学家的重视。本文从土壤微生物多样性的影响因素以及研究方法等方面阐述了目前国内外土壤微生物多样性的研究现状, 并对其未来研究方向进行了展望。

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被引次数: Baidu(383) CSCD(85)
11. 土壤微生物学特性对土壤健康的指示作用
周丽霞, 丁明懋
生物多样性    2007, 15 (2): 162-171.   DOI: 10.1360/biodiv.060290
摘要5767)      PDF(pc) (357KB)(7060)    收藏
土壤健康是陆地生态系统可持续发展的基础。作者通过概述土壤微生物学特性(土壤微生物群落结构、土壤微生物生物量、土壤酶活性)与土壤质量的关系, 阐明了土壤微生物对土壤健康的生物指示功能。研究表明: 土壤中细菌、真菌和放线菌的组成及其所占比率在一定程度上反映了土壤的肥力水平: 在土壤性质和肥水条件较好的土壤中, 细菌所占比率较高。土壤微生物生物量与土壤有机质含量密切相关, 而且土壤微生物生物量碳与土壤有机碳的比值(Cmic : Corg)和土壤微生物代谢熵(qCO2)的变化在一定程度上反映了土壤有机碳的利用效率。一般情况下, 土壤酶活性高的土壤中, 土壤微生物生物量碳、氮含量也高。因此, 土壤微生物学特性可以反映土壤质量的变化, 并可用作评价土壤健康的生物指标。
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被引次数: Baidu(385) CSCD(113)
12. 2014年第1期整期pdf文件
生物多样性   
13. 环境微生物的宏基因组学研究新进展
孙欣, 高莹, 杨云锋
生物多样性    2013, 21 (4): 393-400.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2013.08050
摘要2038)   HTML2)    PDF(pc) (247KB)(6568)    收藏

宏基因组学以环境中微生物的基因组的总和为研究对象, 从而规避了传统方法中绝大部分微生物不能培养的缺陷, 因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。本文重点介绍了宏基因组学技术中关键的两类技术: 即以罗氏454及Illumina为代表的高通量测序技术和以基因芯片(GeoChip)为代表的基因芯片技术在微生物研究中的应用。测序技术可以发现新物种和新基因, 但由于测序深度有限, 定量性差, 不易发现低丰度物种, 且易受污染物干扰。芯片技术很好地克服了这些局限, 但不易于发现新基因。本文介绍了这些技术近年来在气候变化、水处理工程系统、极端环境、人体肠道、石油污染修复、生物冶金等方面取得的部分代表性成果。在此基础上, 对宏基因组技术在环境微生物研究方面的未来发展方向提出了预判和展望。我们认为由于两种技术各自的优缺点, 今后将两类技术结合起来的综合研究会越来越多。另外, 由于大量数据的处理方法已成为制约宏基因组学发展的瓶颈, 相应的生物信息学技术开发将是未来科研的热点和难点。

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被引次数: Baidu(63)
14. 生物多样性综合评价方法研究
万本太, 徐海根, 丁晖, 刘志磊, 王捷
生物多样性    2007, 15 (1): 97-106.   DOI: 10.1360/biodiv.060132
摘要4374)      PDF(pc) (432KB)(6499)    收藏
2002年召开的《生物多样性公约》第六次缔约方大会确定了“到2010年在全球范围内大幅度降低生物多样性丧失的速度”的目标, 并要求各国制定生物多样性评价指标, 开展生物多样性评估。本文作者根据科学性、代表性和实用性的原则, 提出了生物多样性综合评价的5个指标, 即物种丰富度、生态系统类型多样性、植被垂直层谱的完整性、物种特有性、外来物种入侵度, 确立了生物多样性综合评价方法; 并以全国31省(市、区)为单元, 开展了全国生物多样性综合评价, 将各省(市、区)生物多样性分为四个等级。云南、四川、广西的生物多样性属“优”, 贵州、湖北、广东、湖南、重庆、福建、西藏、江西、浙江、海南、甘肃、新疆、陕西的生物多样性属“良”, 河南、安徽、山东、山西、河北、北京的生物多样性属“一般”, 吉林、内蒙古、上海、辽宁、宁夏、青海、江苏、黑龙江、天津的生物多样性为“较差”。
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被引次数: Baidu(213) CSCD(38)
15. 生物群落的种—面积关系
唐志尧, 乔秀娟, 方精云
生物多样性    2009, 17 (6): 549-559.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09144
摘要3473)      PDF(pc) (369KB)(6449)    收藏
种—面积关系主要探讨物种数量随面积扩大而变化的规律, 它联系不同尺度的生物多样性, 是生物多样性尺度转换的重要依据。利用种—面积关系可以估算群落或区域的物种数量、评价区域生物多样性的丧失。由于构建方式、尺度效应以及区域差异, 种—面积关系的具体形式及其普适性还存在争议。本文主要从构建、尺度效应、区域分异以及与种—多度分布的联系等方面综述种—面积关系的主要进展, 并探讨它在不同方面的适用性。最后给出了利用基于组合样方系列构建的种—面积关系来估算秦岭山地物种数的实例, 结果表明估算精度良好。
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被引次数: Baidu(45) Baidu(55)
16. 应用16S rDNA-RFLP方法分析宁夏地区稻田土壤细菌的多样性
张建萍, 董乃源, 余浩滨, 周勇军, 陆永良, 耿锐梅, 余柳青
生物多样性    2008, 16 (6): 586-592.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2008.08118
摘要5543)      PDF(pc) (383KB)(6289)    收藏
水稻是宁夏地区主要粮食作物, 水稻种植也具有维持生态系统平衡, 防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA, 构建其16S rDNA克隆文库, 用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23 kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到74种酶切带型, 序列分析发现77.3%的克隆序列与环境中未培养细菌的16S rDNA序列有较高的相似性, 仅有22.7%的克隆序列与数据库中可培养细菌有较高的相似性, 表明宁夏稻区土壤中的多数细菌尚未培养。系统发育研究发现74个序列分属于12个类群, 其中变形细菌所占比例最大(37.8%), 依次为酸杆菌(16.2%)、放线菌(12.2%)、拟杆菌(10.8%)、绿屈挠菌(10.8%)、浮游霉菌(8.1%), 另外有少量厚壁菌门、芽单胞菌门和疣微菌门细菌克隆。在变形细菌的序列中包括、、γ和δ 4个类型, 比例分别为13.5%、5.4%、12.2%和6.8%。表明宁夏稻区土壤中优势细菌类群为变形杆菌和酸杆菌, 且土壤细菌类群具有丰富的多样性。
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被引次数: Baidu(42)
17. 土壤生物多样性的研究概况与发展趋势
傅声雷
生物多样性    2007, 15 (2): 109-115.   DOI: 10.1360/biodiv.060293
摘要3442)      PDF(pc) (197KB)(6242)    收藏
本文概括性地介绍了土壤生物类群的多样性及其在生态系统中的作用; 同时简要地回顾和比较了国内外在土壤生物学方面的研究动态, 分析了土壤生物学今后的发展趋势。鉴于土壤生物在生态系统中的重要性以及我国在土壤生物学研究方面的不足, 《生物多样性》本期刊登了一系列有关土壤生物的文章, 目的是为了使国内科学家对土壤生物多样性在生态系统中的作用有更好的认识, 并希望能够唤起更多的年轻学者加入到土壤生物学研究的行列, 以推动土壤生物学在我国的迅速发展并将土壤生物学的研究成果应用于国民经济的发展中。
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被引次数: Baidu(138) Baidu(138) CSCD(54)
18. 中国外来入侵生物的危害与管理对策
万方浩, 郭建英, 王德辉
生物多样性    2002, 10 (1): 119-125.   DOI: 10.17520/biods.2002014
摘要4609)      PDF(pc) (205KB)(6076)    收藏
本文探讨了外来入侵生物的概念及其在我国的危害状况、入侵原因,提出了外来入侵生物的预防及管理对策。随着国际贸易往来和旅游业的发展,生物入侵在我国不断加剧,正在成为威胁我国生物多样性与生态环境的重要因素之一。外来入侵种的生态代价是造成本地物种多样性不可弥补的消失以及物种的灭绝,其经济代价是农林牧渔业产量与质量的惨重损失与高额的防治费用。生物入侵在我国大部分是由于人为因素引起的。这些因素包括:缺乏对引进种的利益与风险进行评估、淡薄的生态意识与不顾生态后果的经济利益驱使下的盲目引进、缺乏严格的科学监管体系或监管不力、缺乏全面检疫的体系与机制。外来入侵生物的综合性与系统性研究已成为当今我国生态环境保护、农业生产和经济可持续发展的重大研究领域。我国对外来入侵生物的预防与管理应着重于国家能力、研究能力、监测与管理能力三大体系的建设上。根据我国国情和目前的紧急现状应制定出优先行动计划。对特定外来种的入侵生物学基础研究、特定生态系统或地理区域入侵种现状及影响的关键评估研究、特定外来入侵生物对生态环境影响的风险评估体系及经济损失的模式研究、发展控制外来有害生物的环保型技术与方法研究、外来生物受控制后生态系统的恢复与栖息生境的复原技术与方法等,均是目前亟待研究的课题。
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被引次数: Baidu(635) CSCD(125)
19. 生物入侵机制研究进展
徐承远, 张文驹, 卢宝荣, 陈家宽
生物多样性    2001, 09 (4): 430-438.   DOI: 10.17520/biods.2001063
摘要3657)      PDF(pc) (328KB)(6010)    收藏
本文从外来种本身的生物学特性、外来种与新栖息地土著种之间的相互作用、群落生物多样性对入侵种的抵抗能力、新栖息地生态环境变化对入侵种的影响等方面综述了近年来有关生物入侵机制的研究进展,并探讨了研究方法的发展和亟待解决的问题。大量的研究表明生物入侵机制是极为多样的,可能没有一般的、通用的机制。阐明生物入侵的机制,对推动生态学理论的发展和控制有害外来种有重要意义。
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被引次数: Baidu(353) CSCD(61)
20. 南岭国家级自然保护区兰科植物物种多样性的海拔梯度格局
田怀珍, 邢福武
生物多样性    2008, 16 (1): 75-82.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2008.07081
摘要3648)      PDF(pc) (627KB)(6008)    收藏
兰科是单子叶植物最大的科和被子植物中的第二大科。兰科植物物种多样性的海拔梯度格局因地域或坡向不同而呈不同趋势。南岭国家级自然保护区地处南岭山脉中段南坡, 植物资源丰富。作者对南岭国家级自然保护区兰科植物进行了为期4年的调查, 记录了其种类、数量、生活型、海拔、生境, 分析了其区系成分, 并依据IUCN (2001)濒危物种红色名录及保护区的具体情况对其濒危等级进行了评估。从海拔230–1,902 m, 每200 m分段, 共划分为9个海拔段分析其垂直分布格局。结果显示: (1)实地记录兰科植物38属70种, 大多数种类数量较少, 乳阳管理处的种类最为丰富; (2)随着海拔的上升, 总体兰科植物以及不同生活型的兰科植物物种数量均呈现“中间高度膨胀型”而峰值偏向低海拔的特点; (3)濒危物种主要集中在600–1,000 m人为活动稀少、环境好的小生境中; (4)800–1,000 m的区系成分最丰富, 热带性质的兰花多数分布在海拔1,600 m以下; (5)相邻海拔段的兰科植物种类的相似性系数较高; 海拔段相隔越远, 相似性系数越小。小生境和水分条件对于兰科植物的生长非常重要, 中海拔具有良好的水热条件, 因此物种多样性最高; 而低海拔地区的人为破坏使得该海拔段兰科植物物种的多样性显著降低。
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被引次数: Baidu(58) CSCD(21)
21. “中国山地植物物种多样性调查计划”及若干技术规范
方精云, 沈泽昊, 唐志尧, 王志恒
生物多样性    2004, 12 (1): 5-9.   DOI: 10.17520/biods.2004002
摘要5679)      PDF(pc) (231KB)(5789)    收藏
我国是个多山的国家,拥有丰富的生物多样性资源。为研究我国山地的植物物种多样性垂直格局及其地理分异,北京大学自20世纪90年代中期开始,实施了中国山地植物物种多样性调查计划(Peking University′s Survey Plan for Plant Species Diversity of China′s Mountains, 简称PKU-PSD 计划)。本文简要介绍该计划的主要研究内容、研究的山地以及野外调查和数据分析方法,试图为同类研究提供参考。
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被引次数: Baidu(236)
22. Systematics and Biodiversity Conservation
YUAN DECHENG
生物多样性    DOI: 10.17520/biods.1995049
23. 外来植物入侵对土壤生物多样性和生态系统过程的影响
陈慧丽, 李玉娟, 李博, 陈家宽, 吴纪华
生物多样性    2005, 13 (6): 555-565.   DOI: 10.1360/biodiv.050058
摘要5743)      PDF(pc) (151KB)(5648)    收藏
随着科学家对生态系统地下部分的重视, 评价外来植物入侵对土壤生态系统的影响成为当前入侵生态学领域的研究热点之一。本文综述了外来植物入侵对土壤微生物、土壤动物以及土壤碳、氮循环动态影响的研究, 并探讨了其影响机制。已有的研究表明, 植物入侵对土壤生物多样性及相关生态系统过程的影响均存在不一致的格局, 影响机制也是复杂多样的。外来植物与土著植物凋落物的质与量、根系特征、物候等多种生理生态特性的差异可能是形成格局多样性和影响机制复杂性的最主要原因。今后, 加强多尺度和多生态系统的比较研究、机制性研究、生物多样性和生态系统过程的整合性研究及土壤生态系统对植物入侵的反馈研究是评价外来植物入侵对土壤生态系统影响的发展趋势。
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被引次数: Baidu(129) CSCD(47)
24. 家养动物的起源与驯化研究进展
李晶, 张亚平
生物多样性    2009, 17 (4): 319-329.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09150
摘要2583)      PDF(pc) (388KB)(5623)    收藏
动物的驯化是新石器时代农业革命的主要内容之一, 导致了人类生活方式从狩猎向畜牧的转变。开展家养动物起源与驯化的研究, 不仅有助于了解人类社会的发展史和人工选择下动物的进化过程, 而且有助于开展家养动物的良种选育和遗传多样性保护, 因此该研究领域受到了人们的长期关注。近年来, 随着更多考古证据的发现与分子遗传学的发展, 人们对于家养动物的起源与驯化有了更深入的认识。本文对家养动物起源与驯化研究中一些基本问题的研究方法和进展进行了综述。文章第一部分介绍了家养动物的野生祖先、起源地、起源时间、建群者大小和扩散路线等问题; 第二部分则涉及家养动物驯化的条件、过程、性状改变及其遗传机制等方面。最后指出了家养动物起源与驯化研究中依然存在的问题, 并对未来研究发展的趋势进行了讨论。
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被引次数: Baidu(23) CSCD(2)
25. 长江流域鱼类物种多样性大尺度格局研究
于晓东, 罗天宏, 周红章
生物多样性    2005, 13 (6): 473-495.   DOI: 10.1360/biodiv.050121
摘要5154)      PDF(pc) (531KB)(5613)    收藏
作者以长江流域鱼类编目数据库为基础数据, 研究了长江流域鱼类物种多样性的大尺度格局。长江流域内共记录了鱼类378种(亚种), 隶属于14目32科144属。其中淡水鱼338种(亚种), 以鲤形目为主, 达到269种(亚种), 洄游鱼类11种, 河口鱼类29种; 流域内特有种和受威胁物种分别有162种(亚种)和69种(亚种)。根据鱼类分布特点, 按水系将长江流域分为19个区域, 除了江源区和金沙江中上游外, 物种数和G-F多样性指数上游高于中下游, 但各区域内差异不大, 然而特有种比例从上游到下游随海拔降低而逐渐降低。利用Jaccard物种相似性系数对19个区域进行聚类分析, 将整个流域分成三部分: (1) 江源区和金沙江中上游, 地理上属于青藏高原东南部波状平原部分和横断山区, (2) 上游其他流域, 地理上属于川西高原、云贵高原、四川盆地及秦巴山区, (3) 中下游流域, 地理上属于淮阳山地、江南丘陵和长江中下游平原, 基本反映了流域内自然地理环境及我国大陆地势三级台阶变化的特点。
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被引次数: Baidu(144) CSCD(30)
26. 生态位模型的基本原理及其在生物多样性保护中的应用
朱耿平, 刘国卿, 卜文俊, 高玉葆
生物多样性    2013, 21 (1): 90-98.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2013.09106
摘要3744)   HTML2)    PDF(pc) (308KB)(5420)    收藏

生态位模型是利用物种已知的分布数据和相关环境变量, 根据一定的算法来推算物种的生态需求, 然后将运算结果投射至不同的空间和时间中来预测物种的实际分布和潜在分布。近年来, 该类模型被越来越多地应用在入侵生物学、保护生物学、全球气候变化对物种分布影响以及传染病空间传播的研究中。然而, 由于生态位模型的理论基础未被深入理解, 导致得出入侵物种生态位迁移等不符合实际的结论。作者从生态位与物种分布的关系、生态位模型构建的基本原理以及生态位模型和生态位的关系等方面探讨了生态位模型的理论基础。非生物的气候因素、物种间的相互作用和物种的迁移能力是影响物种分布的3个主要因素, 它们在不同的空间尺度下作用于物种的分布。生态位模型是利用物种分布点所关联的环境变量来模拟物种的分布, 这些分布点本身关联着该物种和其他物种间的相互作用, 因此生态位模型所模拟的是现实生态位(realized niche)或潜在生态位(potential niche), 而不是基础生态位(fundamental niche)。Grinnell生态位和Elton生态位均在生态位模型中得到反映, 这取决于环境变量类型的选择、所采用环境变量的分辨率以及物种自身的迁移能力。生态位模型在生物多样性保护中的应用主要包括物种的生态需求分析、未知物种或种群的探索和发现、自然保护区的选择和设计、物种入侵风险评价、气候变化对物种分布的影响、近缘物种生态位保守性及基于生态位分化的物种界定等方面。

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27. 物种多样性地理格局的能量假说
王志恒, 唐志尧, 方精云
生物多样性    2009, 17 (6): 613-624.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09161
摘要4435)      PDF(pc) (366KB)(5372)    收藏
物种多样性地理分布格局及其成因是生物地理学和宏观生态学研究的核心问题之一。为了解释物种多样性的分布格局, 人们提出了多种假说, 其中讨论最多的是能量假说。该假说认为, 物种多样性的变化受能量控制。根据能量的不同形式及其对物种多样性的影响机制, 能量假说包括以下几种形式: 生产力假说(productivity hypothesis)、水分—能量动态假说(water–energy dynamic hypothesis)、环境能量假说(ambient energy hypothesis)、寒冷忍耐假说(freezing tolerance hypothesis)以及生态学代谢假说(metabolic theory of ecology, MTE)。本文系统介绍了每种能量假说的含义、所使用的能量形式及表征变量, 以及对物种多样性的影响机制, 并对不同形式的能量假说进行了比较, 在此基础上, 分析了每种能量假说的优点和缺点以及各自面临的问题。
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28. 中国自然保护区分布现状及合理布局的探讨
陈雅涵, 唐志尧, 方精云
生物多样性    2009, 17 (6): 664-674.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.08324
摘要3897)      PDF(pc) (709KB)(5361)    收藏
为了保护中国丰富的生物多样性, 我国已经建立了大量的自然保护区。评价这些保护区的布局对于生物多样性的有效保护无疑是十分重要的。本文收集了截至2007年底我国建立的2,047个保护区的有关资料, 利用地理信息系统技术, 分析了这些保护区的分布现状和生物多样性的保护状况, 包括保护的植被类型、野生保护物种以及热点地区。结果表明: 我国自然保护区的覆盖面积达到145.7万km2, 占中国陆地面积的15.2%, 超过世界平均水平(13.4%); 在我国47种自然植被类型中, 有21种植被类型的被保护面积比例低于10%, 说明这些类型可能没有得到充分的保护。应用Dobson筛除算法对216个保护区中的保护物种进行筛除分析, 发现仅西双版纳、武夷山、长白山、高黎贡山、祁连山5个保护区即包含了381个保护物种(约占总数783种的50%); 前21个保护区可包含占总数75%的保护物种(590种)。根据不同方案划分的生物多样性热点保护地区仍存在一些保护空缺地, 如新疆北部、四川与长江以南地区, 因此, 我国的保护区布局有待进一步改进。
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被引次数: Baidu(66) CSCD(21)
29. 生物入侵: 中国学者面临的转化生态学机遇与挑战
李博, 马克平
生物多样性    2010, 18 (6): 529-532.   DOI: 10.3724/SP.J.2010.529
摘要2640)      PDF(pc) (180KB)(5333)    收藏
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被引次数: Baidu(61) CSCD(13)
30. 生物多样性信息学研究进展
王利松, 陈彬, 纪力强, 马克平
生物多样性    2010, 18 (5): 429-443.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2010.429
摘要3431)      PDF(pc) (401KB)(5327)    收藏

生物多样性信息学是一门蓬勃发展的新学科。它将现代的信息技术带入生物多样性及其相关学科的研究领域。它在生物多样性基础数据的数字化、模型工具和各种工具软件的开发、数据整合, 以及全球、地区和国家尺度生物多样性信息网络等多个方面的发展, 向我们展示了未来在全球范围内自由、免费共享生物多样性数据和信息, 以及人们行动起来共同关注、调查与监测野外生物多样性的前景。目前, 已有大量数字化的物种编目、标本馆标本、多媒体影像、研究文献等生物多样性基础信息可以通过互联网检索和利用。其中, 最值得关注的是一些成功的国际性研究项目, 如物种2000、全球生物多样性信息网络、生命条形码以及网络生命大百科全书。这些项目的成功不仅体现在对大量基础信息和数据的发布, 而且它们通过与生物多样性信息标准TDWG(Biodiversity Information Standards: TDWG)的合作, 推动了达尔文核心标准(Darwin Core)等一些重要的生物多样性信息标准的应用, 以及地区和国家性生物多样性信息节点的建立, 这些都为将来全球范围生物多样性信息的共享和数据交换奠定了重要基础。在数字化信息的基础上, 研究人员也开发了一些在特定研究领域应用的数据挖掘和模型工具, 例如基于数字化标本的地理分布预测工具MAXENT, 分类学专家知识管理的LifeDesk。公民科学理念的发展则向我们展示了公众和科学爱好者广泛参与以互联网为基础的生物多样性信息学研究活动。因此, 生物多样性信息学的发展前景广阔, 它将为我们实现全球保护战略目标, 应对生物多样性危机, 解决全球气候变化条件下生物多样性资源管理和利用建立坚实的信息基础。

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31. 环境抗生素抗性基因研究进展
苏建强, 黄福义, 朱永官
生物多样性    2013, 21 (4): 481-487.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2013.07071
摘要2462)   HTML8)    PDF(pc) (352KB)(5290)    收藏

抗生素耐药性及其在全球范围内的传播已成为国际关注的热点。本文结合最新文献, 综述了抗生素抗性基因在环境中的来源、传播、分布以及新型抗性基因的发现等方面的研究进展。环境中抗生素抗性基因的来源主要是环境中细菌的内在抗性基因及随人或动物粪便排到体外的抗性细菌。功能宏基因组学技术的应用极大地丰富了人们对抗生素抗性组学的认知, 并已从环境中筛选到多种新型抗性基因。近年来, 由于抗生素在医疗以及养殖业中的大量使用, 增加了抗性基因在环境中的丰度和多样性, 加速了抗性基因在环境中的传播, 在多种环境介质(如养殖水域、污水处理厂、河流、沉积物和土壤等)均检测到多种高丰度的抗生素抗性基因。我们建议今后在以下方面开展深入研究: (1)抗性基因传播和扩散的机制; (2)新型抗性基因筛选和抗性机制; (3)抗生素和抗性基因环境风险评估体系等。

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32. 中国兰科植物保育的现状和展望
罗毅波, 贾建生, 王春玲
生物多样性    2003, 11 (1): 70-77.   DOI: 10.17520/biods.2003010
摘要3347)      PDF(pc) (289KB)(5277)    收藏
兰科植物是植物保育中的“旗舰”类群(flag group)。中国不是兰科植物种类最丰富的地区,但具有最复杂多样的地理分布类型以及众多的原始类群,因此,开展对中国兰科植物的研究和保育是世界兰科植物研究和保育工作中的重要组成部分。本文介绍了目前中国兰科植物研究和保育的现状,分析了与国际同类工作相比存在的差距,并对今后的发展方向提出了一些看法。
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被引次数: Baidu(279) CSCD(66)
33. 植物物种多样性的垂直分布格局
唐志尧, 方精云
生物多样性    2004, 12 (1): 20-28.   DOI: 10.17520/biods.2004004
摘要4116)      PDF(pc) (358KB)(5250)    收藏
生物多样性沿环境梯度的变化趋势是生物多样性研究的一个重要议题,而海拔梯度包含了多种环境因子的梯度效应,因此研究生物多样性的海拔梯度格局对于揭示生物多样性的环境梯度变化规律具有重要意义。在不同的研究尺度,植物多样性沿海拔梯度具有不同的分布格局,而形成这种格局的因素有很大差异。本文从α多样性,β多样性和γ多样性三个尺度总结了植物物种多样性沿海拔梯度分布格局及其环境解释。α多样性沿海拔梯度的分布格局在不同生活型的物种之间差异很大,但对于木本植物来说,虽然也存在其他格局,但α多样性随海拔升高而降低是被广泛接受的一种格局。在一般情况下,β多样性随着海拔的升高而降低,并且对于不同生活型的物种,β多样性沿海拔梯度具有相似的分布格局。γ多样性沿海拔梯度具有两种分布格局: 偏峰分布格局和显著的负相关格局; 特有物种数往往随着海拔的升高而减少,而特有度则随着海拔的升高而增加。
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34. 植物DNA条形码促进系统发育群落生态学发展
裴男才, 张金龙, 米湘成, 葛学军
生物多样性    2011, 19 (3): 284-294.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2011.11250
摘要4318)      PDF(pc) (938KB)(5195)    收藏
系统发育群落生态学是近年兴起的一个重要生态学研究分支, 它以群落生态学为基础并引入了系统发育的分析方法, 全面动态地反映了群落中物种内和物种间的相互作用关系, 揭示了群落格局形成的生态学过程, 研究了生物多样性的形成及维持机制。巴拿马BCI (Barro Colorado Island)样地的成功例子说明, 在固定样地进行长期的群落生态与系统发育研究切实可行且极具意义; DNA条形码的快速兴起对这一研究发挥着重要作用。本文先列举了群落生态与系统发育综合分析能解决的群落系统发育结构、群落生态位结构、生物地理学和性状进化等生态学问题; 接着介绍了标准植物DNA条形码以及利用片段组合(rbcL+matK+trnH-psbA)进行快速物种识别和近缘种区分、精确群落系统发育关系的构建以及群落生态学研究; 随后提出DNA条形码研究在类群水平上需注意两片段的条形码组合(matK+rbcL)在同属种鉴别能力上的不足, 而在较大尺度群落水平上需对实验设计进行优化。DNA条形码将为探讨物种多样性及其维持机理、系统发育beta多样性以及群落水平上功能性状进化研究提供新的思路。
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被引次数: Baidu(37) CSCD(15)
35. Beta多样性研究进展
陈圣宾, 欧阳志云, 徐卫华, 肖燚
生物多样性    2010, 18 (4): 323-335.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2010.323
摘要3822)      PDF(pc) (440KB)(5190)    收藏

Beta多样性度量时空尺度上物种组成的变化, 是生物多样性的重要组成部分, 与许多生态学和进化生物学问题密切相关, 并且其信息可用于保护区选址和布局规划, 因此在最近10年间成为生物多样性研究的热点问题之一。多年来, 学者们利用各种度量方式和分析方法, 在不同地理区域, 对许多生物类群beta多样性的时空格局和形成机制进行了大量研究。本文主要从beta多样性的度量方法、时空格局、形成机制及其在生物多样性保护中的应用等几个方面, 总结了最近10多年来相关研究的进展。Whittaker(1960)最初提出beta多样性概念时就缺乏严格的定义, 随着概念的不断演化, 度量方法也同样呈现出多样化, 而度量手段的多样化非常不利于不同研究之间的比较。目前应用最普遍的度量方法是采用相似性指数, 如Jaccard和Sørensen指数。最近几年, 新的度量方法还在不断出现, 其中一些方法非常值得注意。Beta多样性具有时空尺度和分类尺度依赖性, 一般随分析粒度(grain)的增加而降低。虽然有些研究表明beta多样性随纬度增加而降低, 但学者们并没有达成共识。山区和生物地理区的交界处beta多样性都比较高, 因而需要在这些地区增加保护区的面积或者数量以囊括物种变化梯度。对时间尺度上beta多样性的研究表明, 气候变化确实导致了物种组成在时间上的变化, 并且物种在不同大陆和地区间的迁移导致了生物同质化。扩散过程和生态位过程共同决定了beta多样性, 只是这两个过程的相对重要性依尺度、地理区域和物种类群的不同而有所差异。综上所述, 我们认为未来beta多样性研究的热点问题是:(1)不同生物类群的进化历史和生物学特征对beta多样性的影响; (2)不同的时空尺度对beta多样性及其维持机制的影响; (3)人类活动对beta多样性的影响。

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被引次数: Baidu(86) CSCD(37)
36. 太湖地区典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析
滕齐辉, 曹慧, 崔中利, 王英, 孙波, 郝红涛, 李顺鹏
生物多样性    2006, 14 (4): 345-351.   DOI: 10.1360/biodiv.060003
摘要4457)      PDF(pc) (636KB)(5189)    收藏
土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础, 但长期以来缺乏对高强度土地利用条件下的土壤微生物多样性的认识。作者采用间接法提取了江苏省太湖地区典型菜地土壤微生物的总DNA, 以细菌的通用引物27F和1492R扩增16S rDNA片段, 将扩增产物与T-载体酶连, 转化大肠杆菌, 建立土壤微生物16S rDNA克隆文库。PCR扩增基因文库中插入的16S rDNA外源片段, 用两种限制性内切酶Hha I和Rsa I 分别酶切, 获得该土壤173个克隆的酶切指纹图谱。结果表明, Hha I和Rsa I联合酶切产生了63个基因分型, 文库的覆盖度达76.30%, 单一酶切产生的基因分型少, 但文库的覆盖度高; 克隆文库中存在两种优势类群, 分别占总克隆的16%和12%。16S rDNA测序结果表明, 太湖地区菜地土壤细菌在分类方面主要属于a-和g-变形杆菌亚门。以上结果为进一步研究太湖地区菜地土壤微生物生态功能提供了基础资料。
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被引次数: Baidu(112) CSCD(41)
37. 植物DNA条形码研究进展
宁淑萍, 颜海飞, 郝刚, 葛学军
生物多样性    2008, 16 (5): 417-425.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2008.08215
摘要5398)      PDF(pc) (326KB)(5172)    收藏
DNA条形码(DNA barcoding)已成为近5年来国际上生物多样性研究的热点, 即通过使用短的标准DNA片段, 对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中已得到广泛的应用, 所采用的标准片段是线粒体COI基因中约650 bp长的一段。然而在植物中DNA条形码的研究进展相对缓慢, 目前尚处于对所提议的各片段比较和评价阶段, 还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢, 因此条形码片段主要在叶绿体基因组上进行选择, 被提议的编码基因片段主要有rpoB, rpoC1, matK, rbcL, UPA, 非编码区片段有trnH-psbA, atpF-atpH, psbK-psbI, 此外还有核基因ITS。已有的研究表明以上任何一个单片段都不足以区分所有植物物种, 因而不同的研究组相继提出了不同的片段组合方案, 目前被广泛讨论的组合主要有5种。本文综述了DNA条形码序列的优点、标准、工作流程、分析方法和存在的争议, 重点论述了植物条形码研究中被提议的各序列片段和组合的研究现状。
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被引次数: Baidu(207) CSCD(6)
38. 猕猴桃属植物的cpSSR遗传多样性及其同域分布物种的杂交渐渗与同塑
张田, 李作洲, 刘亚令, 姜正旺, 黄宏文
生物多样性    2007, 15 (1): 1-22.   DOI: 10.1360/biodiv.060277
摘要3990)      PDF(pc) (495KB)(5105)    收藏
同域分布的近缘物种常常发生杂交而导致种间基因渐渗, 从而对相关物种的自然居群遗传结构产生重要影响, 近缘种间的杂交渐渗已成为进化生物学和保护生物学关注的热点。本研究采用8对cpSSR引物对我国西部高原台地向中东部丘陵平原过渡地带同域重叠分布的猕猴桃属(Actinidia)7个物种的自然居群遗传多样性、居群遗传结构和同域分布种间遗传分化进行了检测。结果表明: (1)在6个多态性位点检测到18个等位基因形成的42个单倍型, 尽管各单倍型间显示了复杂的网状进化关系, 但还是具有明显的物种特异性; (2)各物种有丰富的cpSSR遗传多样性, 但种间存在较大差异, 绵毛猕猴桃(Actinidia fulvicoma var. lanata)的遗传多样性水平最高(P = 62.50%, hT = 0.173, HT = 0.897), 美味猕猴桃(A. deliciosa)的最低(P = 37.5%, hT = 0.041, HT = 0.516); (3)尽管不同物种的居群分化程度存在较大差异, 但种内居群间存在明显分化(GST为0.319–0.780, FST为0.401–0.695), 居群间的基因流不足(Nm为0.219–0.747<1); 其中以美味猕猴桃的居群遗传分化度最高(GST = 0.780, FST = 0.695); (4)遗传分化系数GST(unordered alleles)与NST(ordered alleles)无显著差异, 揭示本研究的大多数猕猴桃属物种不存在系统地理结构, 与用Mantel检验得出的居群遗传距离和地理距离不存在显著性相关的结果一致; (5)除了中华/美味猕猴桃复合体(A. chinensis / A. deliciosa complex)的湖北五峰(HW)和广西资源(GZ)两个同域复合居群外, 同域分布的物种间遗传分化强烈(FST为0.476–0.990), 与UPGMA聚类时多数居群按各自物种聚类的结果一致。进一步分析表明, 中华/美味猕猴桃复合体近缘种间存在明显的共祖多态性和杂交渐渗现象, 近缘种植株分布的交错程度以及是否存在亚居群结构对杂交渐渗存在着重要影响。亲缘关系较远的物种间杂交渐渗事件稀少, 但存在个别同塑事件。本研究结果有助于进一步了解猕猴桃属植物自然居群cpDNA的遗传特性和渐渗杂交进化模式, 为我国猕猴桃野生种质资源保育及可持续开发利用提供基础数据和科学依据。
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被引次数: Baidu(76) CSCD(14)
39. 植物与传粉者相互作用的研究及其意义
黄双全
生物多样性    2007, 15 (6): 569-575.   DOI: 10.1360/biodiv.070294
摘要3683)      PDF(pc) (215KB)(5099)    收藏
The majority of flowering plants and crops rely in whole or part on animals for pollination. The mutualism between plants and pollinators has attracted ecologists and evolutionists to use this type of interspecific interaction as a model system to study species adaptation and diversification since Charles Darwin. Recent debate on the nature of pollination systems call for studies of this interaction at different levels, ranging from single species to entire communities in a given area. At the species level, detailed studies suggest that floral traits are under selection from mutualists and antagonists as well as the physical environment. In contrast, studies at community-level are rare, but recent analyses indicate considerable spatial and temporal variation in both generalized and specialized pollination systems. This special issue of Biodiversity Science focuses on plant-pollinator interaction, presenting current research status in this area from China. Papers include floral traits and pollinator behaviors addressed by phenotypic manipulation, estimates of pollen removal and receipt, anatomy of flowers, histochemistry analysis and spatial and temporal comparison. The taxa being investigated include wild orchid and cultivated legume, endemic, endangered and invasive species with diverse sexual systems. These thirteen experimental studies and three reviews show the development of pollination biology in China and expose how to facilitate our understanding of the critical ecological proc-esses underlying interspecific interaction in both natural and agricultural ecosystems.
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被引次数: Baidu(65) CSCD(22)
40. 生物多样性分布格局的地史成因假说
唐志尧, 王志恒, 方精云
生物多样性    2009, 17 (6): 635-643.   DOI: 10.3724/SP.J.1003.2009.09143
摘要3356)      PDF(pc) (541KB)(5092)    收藏
生物多样性的大尺度分布格局是现代环境与地史过程共同作用的结果。本文从影响机制、参数选择及与现代气候假说的关系等方面回顾了地史成因假说的最新进展, 并得出以下认识: (1) 地史过程对生物多样性的分布格局有显著影响, 但地史过程与现代环境之间强烈的共线性使得两者的影响常叠加在一起; (2) 与广域物种的多样性相比, 地史过程更有利于解释狭域物种(或特有物种)的多样性; (3) 地史过程的参数选择是地史假说所面临的挑战之一, 目前所用的指标与现代环境具有显著的共线性, 难以直观地体现地史过程对生物多样性的影响, 对不同区域内物种系统发育过程的对比或者物种形成速率及灭绝速率分布格局的分析可能有助于评价地史成因假说的影响。
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